Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0004000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0120655 hsa_circXPO1_098 hsa-XPO1_0034
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61710092-61715906 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61482957-61488771 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-178.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -195.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 193.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((..........)))).......(((.((((((((.(((((((((((....)))).))).....)))).)))))))).)))...........)))((((.((((((.........(((((((((..((((........((((.(((((.........(((((...((((.(((..((((..(((((((.......))))))).))))..))).)).)).)))))....((((((((((((((((..(((((((((((((......)))))))......))))))...((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..(((...)))))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...(((((.......))))))))))))).....))))(((......))).((((((((((.(((........)))))))))))))..........)))))))))..(((.((((((..(((...(((....)))...))).)))))).)))...........)))))))((((.....))))..((((...(((.(((....))))))..)))).....))))).))))......)))).....(.(((((((((((((...(((((..(((...((((((........(((...)))........))))))))).))))).((((((.....))))))...))))))))))))).))))))))))..(((((....)))))..)))).))....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(({{((({..........}}}|...,{{{(({.,(((((((.{{{(({(((({....}}}}}}),,))},}))).,})))))),}}|,.......,,.}}}{((({{((({{.........,({(((((,....||||,..,|,{{,,{(({{{.....||{|||,{||,.||||)))|,,{{((,.{{(({{{.,.....))))))).,,}}||||||||,||{||||.....((((((((((((((((..{(({{{((((({{...,,,)))))}}{{.({,..,,)))}}((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..{({...})}))))}.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((.......)}}}})))))))).....)))){({......))}.((((((((((.(((........))))))))))))),,,.......)))))))))|,{((.((((((..(((,{.(({....))),,.))).)))))).})),..........)))))))((((.....))))..,,,,...,,|}|||,,..,}}|||,,||||.{(({.....})))..)}}}}}}},....,{.(((((((((((((...(((((..(((...((((((.,,.....,,,...,)}.,...)))))).,.))).))))).((((((.....))))))...))))))))))))).}))))))))),,{((((....})))}..,)))})),.,.}}})
Forensic Context

No forensic context available.