Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0004100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0002607 hsa_circXPO1_094 hsa-XPO1_0042
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61710092-61717911 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61482957-61490776 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-218.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -236.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 220.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((((((((.(((((((..(((((.((.(((((..........))))).))))))....(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............)))))))))))).....)))))........)..))))))).))).............))))))).))))(.(((((((((....(((......)))....))))))(((((.........(((((((((..((((........((((.(((((.........(((((...((((.(((..((((..(((((((.......))))))).))))..))).)).)).)))))....((((((((((((((((..(((((((((((((......)))))))......))))))...((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..(((...)))))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...(((((.......))))))))))))).....))))(((......))).((((((((((.(((........)))))))))))))..........)))))))))..(((.((((((..(((...(((....)))...))).)))))).)))...........)))))))((((.....))))..((((...(((.(((....))))))..)))).....))))).))))......)))).....(.(((((((((((((...(((((..(((...((((((........(((...)))........))))))))).))))).((((((.....))))))...))))))))))))).)))))))))))))))(((((((........))))).))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.,...|||}||{(((({,((((,.(({(({((......}|.|)))}..,,}}}}....(((((((((((...((((.....))))..)),}))))))))((((((((((,,((((.((............)))))))))))),....}))))......{{|.,((((((|.|||({,{{{{,....,}}}}))),))),|))).||))))),.}||,..,,..}}}....,||||{(((,,..........{,(((((.....}}}}},.,},{{..(((,{{.....||,}||.,|},.}}}})))|,{{(((..,,(({{{.,,....})))))).,,}}||||||||,|{|||||.....((((((((((((((((..{{({{{((((({{...,,,)))))}}{{.{{,..,,)))}}((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..{({...})}))))}.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((.......)}}}})))))))).....)))){({......})}.((((((((((.(((........))))))))))))),,........)))))))))|,{((.((((((..(((,{.(({....))),,.))).)))))).})),..........)))))))((((.....))))...,,,....,|}||}},...,,|||{{{(((.{(((.....))))..))}))))}.....,{.(((((((((((((...(((((..(((...((((((.,,.....,,....,)}.,...)))))).,.))).))))).((((((.....))))))...))))))))))))),||)))))}}},,}}||||{{{{.,......)))}},}}))),)
Forensic Context

No forensic context available.