Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0004500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0120658 hsa_circXPO1_059 hsa-XPO1_0056
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61710092-61727029 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61482957-61499894 UCSC (hg38)
External Database
circbank circBase

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-581.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -634.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 620.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((...(((..(((((........))))).)))...)))))(((((.(((((((......((((........)))).(((((....((((.(.((((....(((((((.(((((((((((((((((..(((((((((((.........(((..((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..)))))))..((((..(((.....)))..))))..)))))))))...)))..)))...)))).)))))..)))..)))......(((((((((.(((((((........((((((......(((.(((((((..((((((((...(((((((((((((((.((((((...((((((((((..(((((.(((.(((((.(((((((((((((((......)))))...........((((.(((((..(((((((......((((((((((((.........(((((((((.((......(((((((((((((((((((......)))))).......(((((((.(...(((((.((((....))))......((((((.((((......((((...)))).((((...((((...)))).))))......))))..)))))).......)))))).))))))).))))))........(((((((((((((........(((.(.((.......((((((........)))))))).).))).....((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))).........))).).)))))))))))))))).......)).)))))))))........)))))))))))))))))))..................))))).))))..((((((....(((((((((.....))))))))).....))))))......)))))))))))))))((.((((.(((((...............)))))..))))))....)))))))).)))))..))))))))).)).))).......)))))).))))))..((((((....((((((((((.(((..(.(((((((((..(((((...........((((((((((........(((((((((....(((((((........((.((((.((((.......)))).)))).)).....)))))))..))))))))).........((((((.((((..((....))..)))).))))))..))).))))))).)))))...)))))))))..)..)))))))))))))((((......))))(((.....)))........))))))(((((((...)))))))))))))))..)((((((((((((((....))))).((((((.............))))))(((........)))..)))))))))..((((.((((((.....)))))).))))(((((...(((((.((......)).)))))............(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............)))))))))))).....)))))......(((.((((((((.(((((((((((....)))).))).....)))).)))))))).)))))))).)))))).)))(((((((..............(((((.....))))).....((..(((.((.....)).)))..))..)))))))(((((((....((....)).....))))))).........(((.((((((((....(((((..(((..(((...(((((((((((((......)))))))......))))))...)))..))).....)))))((......)).)))))))).)))))))))))))))).))))))))))))))))))))(((..(((((...))))).)))...(((((.......)))))((((((((....(((((((((.........((((((((((.(((........)))))))))))))........((((..((....))..))))......((((........))))......)))).)))))..........)))))))).(((((((((.....((((...(((.(((....))))))..)))).((((.....))))................))))))))).((........))...)))))))))))).))))).........(((((((........).))))))..)))))))..))))..).))))....)))))..))))))))))))...(((((....)))))....)((........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,(((((...(((..(((((........))))).))).}.)))))(((({{(((((((......((((........)))},(((((.{{.((((.{.((((....(((((((.((((((((((((((((({(((((((((((,.........(((.,((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..))))))}..((((..(((.....)))..)))).,)))))))))...)))..)))...)))).)))))..))).,))),,{{{.,,|||||,,.,,{(((,...||,,,..,((({((({.((({({{...,{{((((({{{..,{{{{{{{{{|,,{(({({((((,..,(((((((((..(((((.{({.(((((.(((((((((({{{{{......}}}}},.{{{.{{{{.((((,((({(..((((((({.....{(((((((((((.........(((((((((.{(.,....(((((((,,{(((((((((......}))))),......(((((((,((({(((({.{{((,,..|||}......{,{{{|,||,||,,...{(({...}))}.{(((...((((...}))).)))).{,.,,}}.},}),}})}.,,},.,)})))},))))))).}}}}}}........{((((((((((((....,..((((((..........,{{((({{{.....})))),.....,..,{{{{...{..,,,,(({((,{((,,,..,})),))}),.,}})))),)))))).......))).),})))))))})))))))....,,,)}.)))))))))........))))))))))))))))))).....},.)),.,}}}}})),))}}}}}..{(((((....(((((((((.....))))))))).....)))))}.....,))))))))))}}}))||,((((.{((,{...,,..,,,.....,}}}}..}}}},...,,}}}))))).)))))..))))))))).)).)))}))}...,,))))},)),))}}}}}|,,.....((((((....}))))).(((((((((..(((({.........,,((({{{,((({{.,....(((((,,,,}}}}|,|{|||}}}}..,.||,{{{,.,{{{......,|||||||||,|,.....,,))))).,))))))|},.......{,((((((.((((..((....))..)))).)))))),}}||||,,},)),)))))...)))))))))((({((((((((((((((((((((,.((({,{(((.....}})},,....}))),..(((((((...))))))).|||||||.{{(((((((((({(((....}}}},.||||||......,,,....}}}},.(((........}}}.}}}))}||||{.((((.((((((.....)))))).))))|||||,,.(({({|((......}}.,)))}....,}}|....(((((((((((...((((.....))))..)),})))))))){(((((((((,{((((.((............))))))))))))}....}))))......(((.{(((((((.(((({,((((,....,,,,,}}}})},.)))).}))))))).))),,}}}.,,,,,..,.{(((((((.......,,,,.{.(((((.....))))),,,},{{..(((.{{.....}},)))..))..))))))))|||||||.{{(({{{.,.....}))))))...,,.,|||,,,.(((((((.....((((({({((((((({..,{{{{{((((({{...,,,)))))}},{,({{,,||}}|},((((.......(((((((((((((((((..(((.|((((..{{{...})))))),.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((,......}}}}})))))))).....))))(((......}}}.((((((((((.(((........))))))))))))),,........})))))}}}{{{{{.((((((..(((,{.(({....))),,.))).)))))).))),.........,)))))))((((.....))))....,......}}}}}},..}}})))))))))))))))))..}))).)))).....})))).))))))){{{,{......,)))...)))))))))))).))))).........(((((((........).))))))..)))))))..))))..}.)))).},.))))}..))))))))))))...,,{({{{{{|,}},....)||}}....},})
Forensic Context

No forensic context available.