Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0004600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0054857 hsa_circXPO1_049 hsa-XPO1_0063
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61710092-61729445 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61482957-61502310 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-603.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -656.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 670.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((........((((.((.((...(((.....((((..(((....)))....))))....)))...)).)).))))((((((.((((.(((........(((((((((...))).))))))..(((((........)))))..((((..(((.(((.(((((((..(.....)..)))))))..))).)))..)))).....((((((.....(((((((.(((((((((((((((((..(((((((((((.........(((..((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..)))))))..((((..(((.....)))..))))..)))))))))...)))..)))...)))).)))))..)))..)))......(((((((((.(((((((........((((((......(((.(((((((..((((((((...(((((((((((((((.((((((...((((((((((..(((((.(((.(((((.(((((((((((((((......)))))...........((((.(((((..(((((((......((((((((((((.........(((((((((.((......(((((((((((((((((((......)))))).......(((((((.(...(((((.((((....))))......((((((.((((......((((...)))).((((...((((...)))).))))......))))..)))))).......)))))).))))))).))))))........(((((((((((((........(((.(.((.......((((((........)))))))).).))).....((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))).........))).).)))))))))))))))).......)).)))))))))........)))))))))))))))))))..................))))).))))..((((((....(((((((((.....))))))))).....))))))......)))))))))))))))((.((((.(((((...............)))))..))))))....)))))))).)))))..))))))))).)).))).......)))))).))))))..((((((....((((((((((.(((..(.(((((((((..(((((...........((((((((((........(((((((((....(((((((........((.((((.((((.......)))).)))).)).....)))))))..))))))))).........((((((.((((..((....))..)))).))))))..))).))))))).)))))...)))))))))..)..)))))))))))))((((......))))(((.....)))........))))))(((((((...)))))))))))))))..)((((((((((((((....))))).((((((.............))))))(((........)))..)))))))))..((((.((((((.....)))))).))))(((((...(((((.((......)).)))))............(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............)))))))))))).....)))))......(((.((((((((.(((((((((((....)))).))).....)))).)))))))).)))))))).)))))).)))(((((((..............(((((.....))))).....((..(((.((.....)).)))..))..)))))))(((((((....((....)).....))))))).........(((.((((((((....(((((..(((..(((...(((((((((((((......)))))))......))))))...)))..))).....)))))((......)).)))))))).)))))))))))))))).))))))))))))))))))))(((..(((((...))))).)))...(((((.......)))))((((((((....(((((((((.........((((((((((.(((........)))))))))))))........((((..((....))..))))......((((........))))......)))).)))))..........)))))))).(((((((((.....((((...(((.(((....))))))..)))).((((.....))))................))))))))).((........))...)))))))))))).))))).........(((((((........).))))))..)))))))))))))...))).)))).))))))..))(((((..........(((((((........))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((........((((,{{.{(,,.{((....,{{{{..(((....))}....)})),}},}}}...||.}},}}||((((((.({{{.{{,...,,,,.(((((((((...)))}}}))))..(((((........)))))..{(((..(((.(((.(((((((..(.....)..)))))))..))).)))..}}}}.....,{,{(({....(((((((.((((((((((((((((({((((((((((({.........(((.,((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..))))))}..((((..(((.....)))..)))).,)))))))))...)))..)))...)))).)))))..))).,))),,{{{.,,|||||,,.,,{(((,...||,,,.,,((({{{{{.{{{{{{{...,{{(({({{{{..,{{{{{{{{{|,,{{({({(((({..,(((((((((..(((((.{{{.(((((.(((((((({({{{{{......}}}}},.{{{.,{{{.((((,(({{(..(((((((,.....{(((((((((((.........{((((((((.{(,,....(((((((,,{(((((((((......}))))),....,.(((((({,((({(((({.{{((,,..|||}......{,{{{|,||,||,,...{(({...}))}.{(((...((((...}))).)))),|,.,,}}.},}),}})}.,,},.,)})))},))))))).,}}}},........{((((((((((((....,..((((((.....,.,..,{{{{({{|....,})))),.....,..{{{{{,..{..,,,,(({((,{(({,,..,}))}))}),.,}})))),)))))).......))).),})))))))})))))))....,,,)}.))))))))),.......))))))))))))))))))).....},.)),.,}}}}})),))}}}}}..{(((((....(((((((((.....))))))))).....)))))}.....,))))))))))}}}))||,((((.{((,{...,,..,,,.....,}}}}..}}}},,..,,}}}))))).)))))..))))))))).)).)))}}}}...,,))))},)),))}}}}}|,,.....((((((....}))))).(((((((((..(((({.........,,((({{{,((({{.,....(((((,,,,}}}}|,|{|||}}}}..,.||,{{{,.,{{{......,|||||||||,|,.....,,))))).,))))))|},.......{,((((((.((((..((....))..)))).)))))),}}||||,,},)),)))))...)))))))))((({(((((((((((((((((((({.((((,{(((.....}})},,....})))...(((((((...))))))).|||{{||.{{(((((((((({(((....}}}},.||||||......,,,....}}}},.(((........}}}.}}}})}||||{.((((.((((((.....)))))).))))|||||,,.{({({|((......}}.,)))}....,}}|....(((((((((((...((((.....))))..)),})))))))){(((((((((,{((((.((............))))))))))))}....}))))......(((.{(((((((.(((({,((((,....,,,,,}}}})},.)))).}))))))).))),,,}}.,,,,,..,.{(((((((.......,,,,.{.(((((.....))))),,,},{{..(((.{{.....}},)))..))..))))))))|||||||.{{(({{{.,.....}))))))...,,.,|||,,,.(((((((.....((((({({((((((({..,{{{{{((((({{...,,,)))))}},{,({{,,||}}|},((((.......(((((((((((((((((..(((.|((((..{{{...})))))),.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((,......}}}}})))))))).....))))(((......}}}.((((((((((.(((........))))))))))))),,........})))))}}}{{{{{.((((((..(((,{.(({....))),,.))).)))))).))),..........)))))))((((.....))))...........}}}}}},..,}})))))))))))))))))..}))).)))).....}}))).))))))){{{,{......,}))...)))))))))))).))))).........(((((((........).))))))..)))))))..))))..,})).)))).)))))}..))(((((,,.......,({(((({..,.....}))}).),)))))
Forensic Context

No forensic context available.