Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0005800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0054859 hsa_circXPO1_093 hsa-XPO1_0228
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61711072-61717911 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61483937-61490776 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-186.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -203.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 172.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((((((((.(((((((..(((((.((.(((((..........))))).))))))....(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............)))))))))))).....)))))........)..))))))).))).............))))))).))))(((.....((((..((((..((((........((((((((..............(((((.....))))).....((..(((.((.....)).)))..))..))))))))((((((....((....)).....)))))).......((((((.(((((((.....((((((((((((((((..(((((((((((((......)))))))......))))))...((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..(((...)))))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...(((((.......))))))))))))).....))))(((......))).((((((((((.(((........)))))))))))))..........)))))))))..(((.((((((..(((...(((....)))...))).)))))).)))...........)))))))((((.....))))...........)))))))........((((((.((((.....))))..))))))))))))..))))..))))))))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((.....)))))).(((((((((,,.(((((.((......}).}))))....,,,,....(((((((((((...((((.....))))..)),}))))))))((((((((((,,((((.((............)))))))))))),....}))))......(((.{(((((({.(((({,((((,....,,,,,}}}})}}.)))).,))))))}.)))}}}}},,,,,,.,,.{(((((((.......,,,,.{.(((((.....))))),,,}}{{..(((.{{.....}},)))..)),.)))))))){{{(((,.,,(({{,.},....})))))).,,,,.,|||.{{{{{,||,,.....((((((((((((((((..{(({{{((((({{...,,,)))))}}{{.{{,..,,)))}}((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..{({...})}))))}.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((.......)}}}})))))))).....)))){({......})}.((((((((((.(((........))))))))))))),,,.......)))))))))|,{({.((((((..(((,{.(({....))),,.))).)))))).}})|..,.......))))))){(((,,,,,|}}}..,,{,...,{{,{{{....})}}}},,||||.((({.....}})}..}}}}},,,....,})))))}))))})),.,))))
Forensic Context

No forensic context available.