Basic Information
Symbol
hsa_XPO1_0006700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0005050
hsa_circXPO1_092
hsa-XPO1_0012
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61712903-61717911
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61485768-61490776
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-148.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-161.68 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
131.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.....)))))).((..(((((...(((((.((......)).)))))............(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............)))))))))))).....)))))......(((.((((((((.(((((((((((....)))).))).....)))).)))))))).))))))))...(((.(((((((..........(((((.(.(((((.....)))))))))))..(((((((.........(((((...((((.(((..((((..(((((((.......))))))).))))..))).)).)).))))).((((.....))))........(((((((((((((......)))))))......)))))).)))))))......(((((((((((((((((..(((.(((((..(((...)))))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...(((((.......)))))))))))))......))))))).))).....((((((((((.(((........)))))))))))))........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((.....)))))).(((((((,{.,.,(((((((.({(..,(((({....,.........(((((((((((...((((.....))))..)),}))))))))((((((((((,,((((.((............)))))))))))),....}))))......(((.{(((((({.(((({,((((,....,,,..,})})},.)))).}))))))).)))..((((({,,,.,{,((((((({.......,,,,.{.(((((.....))))),,}}}{{..(((,{{.....||,}|}.,|},.}}}})))}{{((((..,,((,,,.},....}))))))...}},,|||,}....}}}},,.}))))).,{||....}))}...})))),,|,.})}.)))))))..,},,}))})}},.|,||((((.......(((((((((((((((((..(((.{((((..{({...})}))))}.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((.......)}}}})))))))).....)))),}}...}},}},.((((((((((.(((........)))))))))))))........})
Forensic Context
No forensic context available.