Basic Information
Symbol
hsa_XPO1_0010100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0054872
hsa_circXPO1_056
hsa-XPO1_0028
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61717777-61727029
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61490642-61499894
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-381.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-415.21 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
499.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((...(((..(((((........))))).)))...))))))...(((((((..(.....)..)))))))...(((((((((..........(.((((((....((((.((((..((.(((...(((((((..((..((((((((...(((..((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..)))))))..((((..(((.....)))..))))..)))))))))...)))..)))...)))).)))))..)))..)))........(((((((...((((((((.....((.((((...(((........)))..)))).)).......)))))))))))))))..(((((.((((((((((((((..((.(((.((.(((((....((((((......))))))......))))).)).))).....(((.((.....)).)))(((((((...((((((........))).)))...))).)))).....((((((......)))))))).)))))))))..(((((((((....(((((((((............)))).)))))..((((...))))))))))))).......))))).)))))..........(((((.(((........))).)))))..........))))))))....))..)))))))....))).))..))))...)))))))))))(((((((.(((..((.(((((((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))).........((.((.....)).))(((.........(((((((((....)))).)))))..)))....((((((((.....))))))))))))).)).))))))))))(((((....(((((((((.....))))))))).....)))))...((((....)))).((((.((.(((((.......)))))..)).))))....)))))))))...(((((......)))))...(((((.(((.(((..........))).))).)))))((((((....((((((((((.(((..(.(((((((((..(((((...........((((((((((........(((((((((....(((((((........((.((((.((((.......)))).)))).)).....)))))))..))))))))).........((((((.((((..((....))..)))).))))))..))).))))))).)))))...)))))))))..)..)))))))))))))((((......))))(((.....)))........))))))(((((((...)))))))......(((((..((((((......((.((.....((((((.............))))))(((........))).......((((((.(((.((((((.....)))))).)))))))))...(((((.((......)).)))))............(((((((((((...((((.....))))..)).))))))))))).)).......))))))..).))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((...(((..(((((........))))).))).,.)))))}...{((((((.,(.....|,,|||||||...{((((((({.........,{.({((((,..,((({,{{{{.,||,|((,,,{{{{{{{,{{{,,{{|||{{{...(({.,((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..))))))}..((((..(((.....)))..)))).,)))))))))...)))..)))...)))).)))))..})}.,))).,,,{,.,{({{{,{{{{{{{{{{{{,,.,,.{(((({....|}))}}.,,.,|,,,||||{||,.,{{{{||||||||||||{|{{{((,,{{((((((((,{(((({,{,{,(({((.(((((,,,,({((({......)))))}.,,,..|||,|{||.|||,{..{{{{,{{...,,.,,{||(((((({...,{{{{,,,{{{{{{|,|{}},...{||{|||,.,{{(((((((......}))))),...}}}|||||,,{((((((((,.{{((,,,,|||}......,,,,,|}||,|}},...{{{{...})))}||||,},|{{{...}))),)}))}||..,,,.,.,},||||.|||,..},,}}}})}))))}.,}},,,...,,,},|||{{{{||{{||,,,}|..{{|||{}}..}}}}...||||||}}},,,{|||||{{{.,.{{.{(({{{{{{.{{{((((,((.,(({{{...,))})).)}.))))))).))))}}.......|}},|.,}}}))})}}||}}},....,}|}|,||||}}}})},},...,))))))})}}}}))})))),,,,})}.}},.,}}}},)),))}}}}},.|{((({....(((((((((.....))))))))).....})))}|,.,{{|,}}}))))})))}}}|},((((.{{{.....}},.}}},.....,..)}})))))}..,{{{{|,,,,.,)))),.}}|||||}|{|,{||,.......},))).,))})))}}{(((((....((((((((((.(((..(.(((((((((..(((({.........,,((({{{,((({{.,....(((((,,,,}}}}|,|{|||}}}}..,.||,{{{,.,{{{......,|||||||||,|,.....,,))))).,))))))|},.......{,((((((.((((..((....))..)))).)))))),},||||,,},)),)))))...)))))))))..)..))))))))))))){({{......))}|(((.....))),.......)))))},((((((...))))))))))},,))}}){{(((((({{{{{{,,..||||,.|{{|{|.............}}}}},(((........))).}}}}}}||||(.((((.((((((.....)))))).))))})}||{{.(({(({((......,,.,)))),.,,}}}}....(((((((((((...((((.....))))..)),})))))))).{{{{......)))).)).,},,,)}...
Forensic Context
No forensic context available.