Basic Information
Symbol
hsa_XPO1_0011500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0054879
hsa_circXPO1_045
hsa-XPO1_0098
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61719170-61729445
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61492035-61502310
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-364.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-396.98 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
508.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((......(((((..(((((...............(((....)))))))).)))))............(((((((.(((((........((((((((((((((((...))).))))))..(((((........)))))((((((((((......(((((((..(.....)..)))))))...(((((((((..........(.((((((....((((.((((..((.(((...(((((((..((..((((((((...(((..((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..)))))))..((((..(((.....)))..))))..)))))))))...)))..)))...)))).)))))..)))..)))........(((((((...((((((((.....((.((((...(((........)))..)))).)).......)))))))))))))))..(((((.((((((((((((((..((.(((.((.(((((....((((((......))))))......))))).)).))).....(((.((.....)).)))(((((((...((((((........))).)))...))).)))).....((((((......)))))))).)))))))))..(((((((((....(((((((((............)))).)))))..((((...))))))))))))).......))))).)))))..........(((((.(((........))).)))))..........))))))))....))..)))))))....))).))..))))...)))))))))))(((((((.(((..((.(((((((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))).........((.((.....)).))(((.........(((((((((....)))).)))))..)))....((((((((.....))))))))))))).)).))))))))))(((((....(((((((((.....))))))))).....)))))...((((....)))).((((.((.(((((.......)))))..)).))))....)))))))))...(((((......)))))))))).))))))))))))......))))))))))))...((((((....((((((((((.(((..(.(((((((((..(((((...........((((((((((........(((((((((....(((((((........((.((((.((((.......)))).)))).)).....)))))))..))))))))).........((((((.((((..((....))..)))).))))))..))).))))))).)))))...)))))))))..)..)))))))))))))((((......))))(((.....)))........))))))(((((((...))))))).))))..(((.((((((((((((((....))))).((((((.............))))))(((........)))..))))))))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.......,{{{{{{((((..{,....,||,|},||,.,,{|}|{||||,|},,|.,,,.......,(({{(((,({{{{...,,...{{||{{{(((((((((...||}|,}}}}|..(((((........))))),|||{{,||||,|,,.(((((((..(.....)..)))))))..,{((((((({..........,.{{((((,...(({{.{{|{.,||,|{({,,(({{||||{{{{,({{|{{{{...(((.,((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..))))))}..((((..(((.....)))..)))).,)))))))))...)))..)))...)))).)))))..))).,))),,{,{...|||||{{{,{{{{{{{{{,,.,..{{((({....|}}}}}.,,.,||,,|||||||,.,{{{{||||||||||||{||{{(({,{,(((((((({{(((({{{,{{(({((.(((({,,,.((((((......)))))}..,...|||}|{||.|||,{..,||{,{{...,,.,,{||(((((({...{{{{{,,,{{{,{,|,|,}},...|||{|||,.,{{{((((((......}))))),,..}}}|||||,,{((((((((,.{,((,,,,|||}....,.,,,,,|}}},}}},,..{{{{...})))}}|||}}}|{{,...}))),)}))}||..,,,.,.,,,||||.|||,..},,}}}}),))))}.,}},,,...,,}}}|||{{{,||||||},,}}..|{|||,}}..}}}}...||||||}}},,{{{||||{{{.,.{{.{(({{{{{{.{{(((((.((.,(({{{...,))))).)}.))))))).)))),,.....,.||,,|.,}}}))})}}|||||,....,||||,||||}}}})}}},,.,,))))))})}}}}))})))),,,,})}.}},.,}}}},}},}}}}}}},.|{(({{....(((((((((.....))))))))).....})))}|,.||{|,,}})))),)))}}}|},((((.{{{.....)),.)}},........))))))))}..,{{{{{......)))),,)))}}))))}))})))}......))))))}))))),.,|{((((....((((((((((.(((..(.(((((((((..(((({.........,,((({{{,((({{.,....(((((,,,,}}}}|,|{|||}}}}..,.||,{{{,.,{{{......,|||||||||,|,.....,,))))).,))))))|},.......{,((((((.((((..((....))..)))).)))))),}}||||,,},}),)))))...)))))))))..)..))))))))))))){{{{......}}}|(((.....))),.......))))),(((((((...))))))).))))..(((.(((((((((({(((,...}}||,.,{{{{{.............))))},(((........))).)))))))))).)))..
Forensic Context
No forensic context available.