Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0014900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0120673 hsa_circXPO1_064 hsa-XPO1_0100
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61721029-61726048 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61493894-61498913 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-130.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -145.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 235.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((..(((((.........)))))..)))))))..((((..(((.....)))..))))..))))))))(....((((((((((.((.(((((....(((.(((((((..((.(((......))).))...((((((((......))))))))...(((..((((((((((((.((((.(((...(((((..(((......)))..)))))(((...(((.((.(((((....((((((......))))))......))))).)).))).....)))..((((((((...(((((((((.((((((((((((.(.(((......))).).)))...((((((((..(..((((((...............(((((((((....(((((((((............)))).)))))..((((...)))))))))))))....))))))..).))))))))....))))))))).)))))..))))...)))....))))).........))))))).))))).)))))))..)))...(((....))).)))))))))).....))))).......((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))).......))..))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((({(((((..(((((.........)))))..)))))}}..((((..(((.....}))..)))}.,))))))))(....(({(((((((,(,{(((....}}}}.{{{,..{{,|{{{(({.....,{{{{|{,,,,,,,.{((((,....}))))},,,.||||||{||||||{{||,||||||{|,.,{{{{{..((({{.{,,|||{,|||||{((,,{(((,((,(({((,,,.{(((({......}}))}}......}}))).}},|||,..,.|||.....,{({{..}|{(((((({.{(((((({,..,...|||.||,..,,}}}}})}...{(((((((.....,|||||,,...,}}},,},..(((((((((..,,(({{{{{||,...........}))}.})}},..{{{{...}))})))))))))....}}}))),,.}))))}}},..,.}}}}|||}|,|}}}}..}}))|.,)))....,,,,.....,,,,,,}})}}}.})}},,))))))),,,..},}}},,.,|{(((({{....,})))),,,}}.},.,,,,.||{|,,{{{,(({(({{((,,,.,,})),)),)),)))))}),)))}......,)}.,)))}}.}})}))
Forensic Context

No forensic context available.