Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0001100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-XPO1_0220
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
2:61706510-61711713 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61479375-61484578 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-831.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -883.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 756.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...)))(((....((...(((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((.((((((((((((.(((((((((((((......(((..((((((((..(((.(((((((((((....)))))).)).))).)))..))))))))....)))......((..(((((((..(((((((((((.(((.((.(((.(((((((((((..((((((((((.(((((((((((......(((((((...............)))))))..(((((...((((((.........(((((.(((((((((((((............))))))))))))))))))............((.(((((.....))))).))............(((..((((...)))).)))..))))))...)))))...(((.....((((((......)))))).....)))...(((((((..((....))..))))))).)))))..))))))..))).....((((..((((.....((((((.((.(((((...(((((((.(((..(((((((..........(((((((((...((((.....))))..................(((((((((((((...(((((..(((...((((((........(((...)))........))))))))).))))).((((((.....))))))...)))))))))))))(((((((((..(((((((....)))))..(((((......(((((.((((..(((.(((((........))))).)))..)))).))))))))))...........................((((....))))....(((((...(((((((((((((...((((((...((((((....(((((((((((((((....((((.(((.......))))))).))))..(((((....)))))......((((.(((((.......))))).))))...((((((((.(((((..((((((((..((...((((((((((((.........))))))))))))..)).))))))))........(((((.......(((.((((((((((.((((......(((((((((((...........((((.((.((((................)))).))))))((((((((((((..((((.((.....(((.(((.((((((((((.((((...(((((((((((((((((((((..((((((.((.((........)).)).)))))))))))))..((((((.(((((..((((..(((((((((.(((....(((((.....)))))...))).)))))))))..)))).....))))).))))))((((((((.(((((((((((.......((((.((.((((((((......)))).)))).))..)))).......))))))))))).)))....))))).)))))...)))))))))..(((((.(........).)))))...))))))))))))))))).)))..........))))))..))))))))))))....((((((...............))))))...(((((((((((((((.((((..((....))))))...)))))((((((((....)))))))).(((.((((((..(((((.((.....(((((.......((((...)))).........)))))..(((((.........))))))).))))))))))).)))((((((....)))))).((((.(.((.(.((((((.....)))))).).))).)))).....((.((((((((..((......))))))))))..))..)))))))))).....)))))))))))....................(((((.((((((((.....((((.(((...................))).)))))))))))).)))))....(((......)))(((((.((((......)))).)))))......((((((.((((((.....)).))))...))))))...((((....)))))))))))))))))).)))((((.((.(((.......))))))))).....(((((....))))))))))..................(((((.((((((((((.(((((....((((........)))).....))))).........((((....)))).......((((((((....))))))))......)))).)))))))))))((......))......(((((((((...............((((.(((((((((..(((....)))))))..))))))))))))))))))..((((((.....))))))))))).)))))))).....((((.((((..(((.((((..(((((((((...((.................)).)))))))))..)))))))...))))))))..)))))))))))...))))))...)).)))))))))))))))))))))).))..))))))))).....))))))))).((((.......)))).........(((((....))))))))))))...)))..)))))))))))).)))))))).....)))).))))....(((((...........))))).)))))))))))))))))))))...)).))).))))))))))))))))))..)))))))))))))))..)))))))))))).)).)))))))))))))))))))).))))))))))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...)))(((....{{...(((((((((((((((.((((((((((((((((((((.({.((((((((((((.(((((((((((((...........{(((((((..(((.(((((((((((....)))))).))},)).)))..)))))))|,,..{({{{{{{,{{{.,,,,,,,..,,{(((({{{{{((({(({(({(((((,({{{{,.,{{{{{{,,.({(((((.{{,{{,...{(((..{.......)))}...,..)),)))))}|((((...((((((..,.......{{((.(((((((((((((,{,.........))))))))))))))))||,,....,,,,..|{,||{,{..,,.}}}}}.}}............(((..((((...)))).)))..))))))...)))),...,||,,..,((((((......)))))).,,,.,||,,.{{{{(((,.{(,..,||..}||||||.,|||,..|||,,..}))},,))},|||,,||||,...,|||||,,||,|(((({{(((((((,,{.{{{{((({{{..,{.....,{|(((((((((.((((.....))))..}}}}}}},......,.(((((((((((((...(((((..(((...((((((.,,.....,,....,)}.,...)))))).,.))).))))).((((((.....))))))...)))))))))))))(((((({{{....,,{(({{{{|,,},..,,||}}}.},}}}}}|.,.{({,{((.(((((........))))).)))))),)).}}))),},})}})}}...............,,.....((((....))))....(((((...(((((((((((((...((((((...((((((....(((((((((((.....,,,{{({.(((...,.,,||||||,.}},..,|||||,,..}))}}......{(((.(((((.......))))).))))...((((((((.(((((,.((((({{{..,{.,,|{((((((((((........,})))))))}|||{{||.}}}}}}}}}}},,,,,{{{{{....,,,{{{{((({((((((.{{({......{{(((((((({.,.........{(((.((.((((.{,.........,,..)))).})))}}{(((((((((({..{,,({((.....|||}{((.((((((((((.((((...(((((((({,{((,(((((((..((((({.((.((........)).)).})))))))))))),,{(((({.(((((.,(({{..{{{{{{{{{.,,{.,.,{{{{{.....))))).|{}||,||}}}})))}.}))|,,,,.}}))),)}||},((((((((.(((((((((((.......((((.((.((((((((......)))).)))).))..)))).......))))))))))).)))....)))))..}},}}..))))))))).,(((({,{.....,.|}.}}}}}...)))))))))))))),|}|}||..........}}}}}},.})))))))))))....{{{{{{....,,,,,......}},,},...((((((((((,((((.(((({.((,{{{{{((|...,{{{{.((((((((....)))))))}{(,({|(((((((.,(((({.((({...})))..,.)))},,.)}.))))}..))))}||||,..(((((.........))))).}}||||||||{||.|{{((((((....)))))).((((.(.((.(.((((((.....)))))).).))).)))){{{,..,,}||,|||,}}}|...,,,}))}})))),}.))}.})))))))))..{{{{||..||))),}}}.................(((((.((((((((.....((((.(((...................))).)))))))))))).))))).,|.|{(||....,,}|((((.((((......)))).)))),......((((((.((((((.....))}})))...))))))..,||||,.{{|||,|||,}}},||||,,,|||(,{,.,,.,||},.}}}}.)))))))).....{{{{|..,.))))),}}}},................,(((((.(((((((((({(((((.{..((((........)))).,,,.)))),..,,..{{|((|(,||||}}}.,.,.}.|||||{||,,,.))}}}}}}....,.)))).)))))))))))||,,,,},}),,,.,.((((((((,..............{((((.(((((((((..(((....))))))}..)))))))))))))))))).,((((((.....))))))))))).)))))))).,,..((({{((((..(((.((((..(((((((((...{{.................},.)))))))))..)))))))...)))))))),,)))))))))))...))))))...))},))))))))))))))))))))).,,..,,))))))))}}}}))))))}}}.((((.,{.(({((({{{{{{{{..|(((({,.{{{{{{|||||||.......,|||}||||,,,|{||||,,,|,.{{{|,,,.)))).}}.,.})))}}....}}}.),}}}}}})}))))))))))..,))))))))).,...,))))))))))))))}})}}),)))))))))))))..)))))))))))).}).)))))))))))))))))))).))))))))))))))).}})))
Forensic Context

No forensic context available.