Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0005300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-XPO1_0245
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61710092-61717862 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61482957-61490727 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-203.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -223.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 149.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.............(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............)))))))))))).....)))))..((((((...(((((((....((((((.......))))))..))).))))...))))))...((((........(((.((((((((..............(((((.....))))).....((..(((.((.....)).)))..))..))))))))))))))).(((((((.......))))))))))(((.((((((.(((.(((.....((((((((((((((((..(((((((((((((......)))))))......))))))...((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..(((...)))))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...(((((.......))))))))))))).....))))(((......))).((((((((((.(((........)))))))))))))..........)))))))))..(((.((((((..(((...(((....)))...))).)))))).)))...........)))))))((((.....))))..((((...(((.(((....))))))..)))).((((.....))))...............((.(((((((((((((...(((((..(((...((((((........(((...)))........))))))))).))))).((((((.....))))))...))))))))))))).))...........((((....))))))).))).)))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.....,,,,,,.(((((((((((...((((.....))))..)),}))))))))((((((((((,,((((.((............)))))))))))),....,))))...,,,(({.,(((((((.{{{(({((((,....,}}},})},))}.)))).,})))))).))}....,||}}}},,,.((((((((.......,,,,.{.(((((.....))))),,,,,((..(((.{{.....}).)))..))..)))))))).|{{{{,...(({||.}}....,)))))))))(((.((((((.(((.(((.....((((((((((((((((..{{{{{(((((({{...,,,)})))}}{{.{{,..,,)))}}((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..{({...})}))))}.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((.......)}}}})))))))).....)))){({......))}.((((((((((.(((........))))))))))))),,........))))))))){,{((.((((((..(((,{.(({....})),,.))).)))))).})),..........)))))))((((.....))))..,,{,...{{{.(({....}))}|},,||||.{(((.....))))..}}}}}},,.....{(.(((((((((((((...(((((..(((...((((((.,,.....,,....,)}.,...)))))).,.))).))))).((((((.....))))))...))))))))))))).}},,,,,......{{||,,..))))))).))).)))))).)))
Forensic Context

No forensic context available.