Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0010900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-XPO1_0106
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:61717912-61719169 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61490777-61492034 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-406.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -429.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 315.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((.((((((((((..(((((((((...)))))))))..))).)))...........((((.(((((((((((.((..((((((....))))))..)).))))))..................)))))))))((((((((...))))))))(((((((....(((((((((((.(......))).))))))(((((.(.....).)))))..(((((..((((.....(((((.(((((..(((..((((.((((((((((((.((((((((((.((((..(((.....((((((((((((((((......)))))))))).)).(((((((((.............(((.((((((...))))))....)))....................(((((......))))))))))))))...(((((((((((.(((((((...((((((.........))))))))))).))))))).)))))).....((((((((((((.((((.....))))))))).))))))).)))).....).))..)).)).))))).))).)))))))))))))).......((((((((...))))))))))))..)))((..(((((((((.........)).))))))).))..(((..((((((...............)))))).))).........((((((((((.......(((..(((((...........))))).(((.((((.......((((..(((((((.............))))))).)))).....)))).)))))).(((((......)))))...((((((((.(......))))))))).((((((((((..(((((.(((((((......(((((((((.....(((.(((.....)))..)))((((((...((.......))..))))))..))))))))).......)))))))..)))))..))))...)))))).....))))))))))...)))))...)))))((((((((.........))))))))))))..)))))....((((((((.((.....))...))))))))....(((..((((......))))..)))........(((((((....))))))))))...))))))).(((((((....((((.((.........))))))....)))))))(((....))))))).)))))))....((((((........)))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((((,.,,,,,,||||}}|,((((((({{{{||||||||..|||.|,,....,......((((.(((((.(((((((.,,,,((({,{,,}|}}||...},,}}}})}},..,,.,.))))))}.)))))))))((((((((...))))))))(((((((...,,,(((((((((.(......||},}}}}))|((({.(.....,}))))}..(((({..{,(({,..|(((((.(((((,{((({{((((,(((.((((((((,(((({(((((.({((..(((.....,{{(({((((((((({......}))))))))).)).(((((((((....,........{{{.((((((...))))))....)))..........,.........(((((......))))))))))))))...(((((((((((.({(((((...((((((.{.....,.))))))))))).))))))).))))))...{{((((((((((((.((((.....))))))))))))))))),))))}..}}},),)))))})})})})))))))))))))}},,,,,.......((((((((...))))))))}}}|..}}}|{,.(((((((({.,.......)),))))))).}}..(((..((((((...............)))))).))).........{{(((({,,,.}}},..,||}}||||,.....,,,,..,,})},|{{.((((,,.....((((..(((((((.............))))))).))))....,)))).}}},)).(((((......)))))...((((((((.{......})))))))).((((((((((..(((((.(((((((..,{..(((((((((.....,{(,({{...,,)||.{|||((((,,..,||,..}}}}))..,,})),..)))))))))..,}}..)))))))..)))))..))))}..,)))))......,|||},,,)}}.)))))...)))))|(((((((.........))))))))))))..)))))..,.((((((((.,(,,...,.,}.)))))))),..}||{..{(((......)))}.,|||,.,,..,}||{((((....))))))))})}),)))))))..,,,,,,....,,,({(((({{{{.,.{{|||,.{{,,||,,,.||,,},.,))))),.,,,))))}}}}||,{|,,},.}})}))))))}},}.
Forensic Context

No forensic context available.