Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0023900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-XPO1_0244
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:61747195-61747871 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61520060-61520736 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-160.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -174.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 179.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((..(((((...(((...((((((((((........((((((((..............)))))))).................(((((((((.......)))))..))))((..(((.(((.(((........(((((((((......))))))))))))))).)))..)).....((((((((((((((((((((((((((....(...((((((.((((((.((((................)))).)))))))))))).)...))))))).)))).))))))((..(((.(((((..((((((((..(((.((((....)))).)))..)))))))))))).).)))..)).....((((((...))))))................)))))))))......((((((((((......(((.........((((...)))).........(((((...(((.............)))...)))))(((((.(((......((((....)))).......))).))))))))....))))))...)))).........((.....))))))))))))....)))...)))))..)))))))))(((((((.........((((((................)))))).........)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{({(({,..||{{|.,,{,,...{{{(({{{,,,{{{{{,,||||||{{..........,{{{|,,||||{............,,,{,{({((((((.......))))}.,||||((..((({(((.{{{||......{((((((((......)))))))))}}}})}.,}),,},.,,..(((((((({(((((((((((((((((.{..(...((((((.((((((.{(((.,,..........}}.)))}.)))))))))))).}..}))))))).)))).))))))((,,{{{.{((((..((((((((..(((.((((....)))).)))..)))))))))))).,.))),.}}.....((((({...})))))................})))))))).........,{{|||,.....,....,},,,....|||,...,,)}},}..,},}},.....|},||||,||,...,((((((,((({{{,,,,.,{,......{,,.,,{,||||,..........,)}))}}},...,.....{{{{(((((..(((..((.....)).,.))).)))}},}))},,,}),}}}}},||||,,.,,,..||},,,||,},))||||....}}},},,,,,..})))))}},.,,},,}},,,,,...}
Forensic Context

No forensic context available.