Basic Information

Symbol
hsa_YAP1_0001900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-YAP1_0052
Host gene
YAP1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
11:102002785-102005654 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:102132054-102134923 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1029.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1080.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 653.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((.(.((((...((((((.((.((((((((((((((((((.((((((((((.((.....((((..((((((((.((((....(((.((.((....(((((((.((((........))))..((((..((.((.(((((........))))).)).))....((((((..((((.......))))(((((((((.((((..(((((((.((.(((...((((((.(((...((((((((((...)))............((((((...((((((((......))).)))))((((((.(((((.((.(.(((((((............((((((((((((((((((..............((((.....))))((((((.....((((((((((((((.....(((((((..........))))))).((((((..((((((((...))))))))))))))...((((((.((((.....(((((.....)))))))))...))))))...............))))))))))))))...)))))).((((..((((((((.(((..(((((((((.....))))))))).....))).))))))))..)))).......((((.(((((((((..(((.....))).....))))))))).))))...)))))...))))))))))))).....(((((((((((((((..(((((.(((.(((((((.(((........))).))))))).))).)))))))))))).........................((((((((((.((((....(((((.(((...((((((.(((((((((((((((((.((.((((((((((((((((((((((((.((.((((.((((...((((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((.((((((((((((((((.(((((.((((((((((.((((((((.((((((((((((.((((((((((((((((((((..((((((((((.(((...(((((((((((((((...(((..((((((((.((((((.(((((...(((((((((((((.((((((((((........(((((...((((.......))))))))).........((((((((.......))))))))..(((((((.((((((......(((.((((((((((..........))))).))))).)))....)))))).))))))))))))))))).))))))))))))).....)))))..)))))).))))))))..))).)))))))))))))))...))))).))))))))..)))))))))))))))))))).)))))))))))).)))))))).).))))))))).))))).)))))))))))))))).))))))))))))))))).))))))))).)))))))))))...))))..)))))).))))))).))))))))))))))))).)).))))))))))))))))).))))))...))).)))))...((((((.((((((..((((((((......)))))))).....((((((((((...........))))))))))...........)))))))))))).((...(((((((((((((((..(...(((((......))))).((((...((((.....)))).))))....)..))))))).)))))))))).)))).))))))))))....))))))))....(((.((((..((((((....))))))...)))).))).((((((.((((((..(((((((..(((((((((((((((((..((.............))..))).))).))))......((.(((((((((..(......)..))))).)))))).........)))))))..)))))))..))))))...))))))((((((((..(((((...............((....))..............)))))..)).)))))))))))))).))))))).)))))).))))))...(((((((...(((((.((...(((...((((......)))).))))).)))))....))))))).(((((((.(((((((((.(((((((((..............)))))...((((..(((((((.(....).)))))).)..))))((((((((((((((...........))).)))))))....(((((((.(((..((((.((((((.((((.((......((((.(((((((((.(((..(((((((..((((.....))))..)))))))..)))))))))))).))))....)).))))...)))))).)))).))).)))))))....(((((((.....))))))).((((((((((((..(((((((((...))))))))).))))))))))))...........))))......))))...))))))))))))))))..(((((......))))).(((((((........)))))))..))))))).))).))))))))).))..))))))).)).))...)))).))))).))))))..))))..)))))))....)).)).))).......))))))))))))..))))..)).)))))))))).)))))))))))))))))).)).))))))...)))).).))))))))))))((.(..(((..(((((((.((.........)).)))))))...)))(((((((.((.(..(((....)))..))).)))))))..........(((((...((((.....))))...))))).......).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((.{.((((...((((((.((.((((((((((((((((((.((((((((((.((..,{{{,,(,,((((((((.((((,...{((,((.((....({((((({(({{{{{{{,..|{||,((({((((((.,.{({{.{|{,|||||||||{{{{{,||||,({(((,,((((.......))}}((({{(((({(({{..((((((({,,.((({{,(((((({({,..|||{|||{(({...))),..,}}}}}}.,||||||.,.{{(((,(({{,..{|||{,,,,|((,,,,}||,,..||}|}|||||,||,..........((((((((((((((((((.....,,.....,{((((.....))))||((((.....(((((((((((((({{{..(((((({..,,,,,.,.|||||},.{(((((..((((((({...})))))))))))))}},||{|||,||.(,,...{{{{{.....}}}}}||||,..}}}))),,..,.,,..})},.)))))))))))))).,.))))},.((((..((((((((.(((..(((((((((.....))))))))).....))).))))))))..)))).......((({.(((((((((..(((.....))).....))))))))).))))...})))),..})))))))))))).....(((((((((((((((..(((((.(((.(((((((.(((........))).))))))).))).)))))))))))|,,,,...........,,,.......((((((((((.((((....(((((.(((.,.((((((.(((((((((((((((((.((.((((((((((((((((((((((((.((.((((.((((...((((((((((((({,((((((.(((((((((((((((((.{(((((((((((((((.(((((.((((((((((.((((((((.((((((((((((.((((((((((((((((((((..((((((((((.(((...(((((((((((((((...(((..((((((((.((((((.(((((...(((((((((((((.(((((((((,............,..............,}}}}}}},.,,,,,..,{{{{{{{,.,,,,..,}}}}))},|(((((((.((((((......(((.((((((((({..........))))).))))).)))....)))))).))))))))))))))))).))))))))))))).....)))))..)))))).))))))))..))).))))))))))))))).,.)))))}))))))))..)))))))))))))))))))).)))))))))))).)))))))).)},)))))))).))))).)))))))))))))))}.))))))))))))))))).))))))))),,))))))))))...))))..)))))).))))))).))))))))))))))))).)).))))))))))))))))).)))))).,.))).)))))...(((({{{((((((..,,,...(({{{{,,{{{|{{|...{{{({{,,,,{,|}}}...}}},.)))}))})))}}}........)))))))))))).((...{((((((((((((((..,,,,{{{((,,,...|}}||.,{((...,||.,.},,}.,},))),...,),,))))))).)))))))}}}.)))).)))))))))}...,))))))))....(((.((((..((((({....})))))...)))).))).,(({((,((((({..|||||||,.{{{{{{{{{|{{{{|||.{{|||||........}))}.))).))))))})},....{{.(((((((((..{......}..))))).))))}}.......|,|}))))},,||||}}},,}|||||,,,}}}}||{|||||||}.{{|||.,..,,,,,,,.,,|{{,...,..,,,.,{{({{({.(({{...|,|||{||,,,.,,,,)}))))}),}))),))}))))))...(((((((...(((((.{{...({(,,.{{{{.,,.,.)))}.}}},,.)))))....))))))).{{{{{{||((({{{{{{,{||{|{{||,.,,},........}}}},,,.{{((..{((((((.{....}.)))))).,..))))|||,{{|||||||{.,,,.......||}|||}})),,}},,||||||.{{{..{{{{.{({{{{.{{{{.{{..,.,.((((.(((((((((.{{(..(((((((,,,(((....,))}),.)))))))..)))))))))))).)))).,.,}).}))).,,})}))),}}})}))),}))))))},.,|{{{{|,.....}}}}}},.((((((((((((..(((((((({...})))))))).)))))))))))),|||,.,|,,,|,,,......}}}},,,}))))))))))})))}..(((((......))))).(((((((........)))))))..||}||||.,}},}}))))))).},}}))))))).)}.,)}}}))),}))))).,,.}}},,.,,...}}}))))....)).)),)})..,,,,,))},})))))))..,)))..)).)))))))))).)))))))))))))))))).)).))))))...)))).}.))))))))))))((.{..(((..(((((((.((.{.....,.)).)))))))...)))(((((((.({,(..(((....)))..})).)))))))..........(((((...{{{,.....})))...))))).......,,))
Forensic Context

No forensic context available.