Basic Information

Symbol
hsa_YAP1_0001500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-YAP1_0047
Host gene
YAP1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
11:101987042-101988917 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:102116311-102118186 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-435.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -474.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 635.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((.....))))))....((((((((....(((((((...((((.(((((((((..........)))...)))))).))))....((((((((((...((((((((((...(((((((..(((((((....((((((((..(((((((((((.((.(((....))))).))))))(((((((.(((....))).)))))))..(((((.(((.(((.(.((((..((.((((...(((.((..((.((......((((((..............))))))......................)).))..)).))).)))).))..)))).).))).))).)))))....)))))...))))))))...)))))))...((((((..(((.((((((.....)))))))))..))))))..((((((((((..((((((............)))))).........((((.((((((.((((((.....................)))))).))))))))))......))))))))))...................))))))))))))))))))))))))))).(((((((((((((((((((((((..(((((.((((.....((((((((........((((((((((.(((((....))))).))))....)))))).(((((((..((...(((((((....))))))).))))))))).........((((((....))))))..((.((((...(((((.......))))).)))).)).(((.((((.(.(((......)))))))).))).....((((((((((((..((.......))..))))..)))))))))))))))))))).)))))..)))))))))......)))))..))))))))).((((((.(((((.((.((((((((.......)))))))).)).(((.(((.(((((((.....(((((((((((.(((............((((((......))))))..))).)))))...))))))....))))))).)))))).((((((........)))))))))))..))))))..))))))).))))))))....((((((((....))))).....))).((((((((((((((((((......))))))..........((((((...))))))..(((((.(((((((((..((((((((...(((((((..(((((((.......((((..(((((((((((((.(((............)))..))))))..)))))))..))))......)))))))(((((.((((......)))))))))(((.((((((.((..((...)).)).)))))).)))..............((((((((((((....(((...((((((((((((((((((.(((((((((((...))).........))))).)))))).))))).))))).(((((((((((.((..((((((...((((.........(((((........)))))(((((((...)))))))..........))))....)))))).....)).)))))))))))........(((((.....))))))))))...))).)))))))))))).)))))))..))))))))..)))).........))))).)))))((((...))))((((((((((..(((((((.((((((.(((((...............(((((..((((.(.((((((((..........)))))))).).)))).)))))..))))).))).))))))))))...))))..))))))...))))))))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,{,((((((.....))))))..)|||(((((..{,,,,,,,,|,,.((((.(((((({((..,.......)))...)))))).))))....(((((((((,..{((((((((((,,,((({{{{,,|||{{((,,,,((((((({..(((((({((({.(,,{((,{{{|||||,,,,}||,((((({.{{{....}||,}}}}}}(((((.......)))))...{{{||{|,|{{{,..{{{,{((,((.(({((...((((((..............))))))............{{{{..,|......)),,)}))..,)))}))}.)))}|)}))),}}))),}|}||,.,,}},...})))))})...)))}}}}...((({{{..{||.||||{{.,...)))))}}}},,}}}}}}..{((((((({|..||||||},|,,||||,,.,}}}}||||,|||,.{(({.((((({.{(((((..,.|,,....,||,......)))))).))))))))))|||{,.,,,|||||}}.......}}}}}....,}}}))}}}})))))))))))))))))))).(((((((({((({{{{(({{{{{,,{|||{,,(({{{({{,{,{{|,{,{{{.,,.,|||}|||||.|{|||,,,.})))}.,},,,...,,((,{.(((((((,.,(...(((((((....))))))).})))))))).,.))..},||||||.,{{|,||||{{{{{{((({{,{,{,,,.,,..,{{||},,..,,||,{|{||,.{|({({,..........|||||||}...,,|||||,,,,,|,,,{{{,,,,|,||,|}))}}..,)))))|,,||})}}}}}|.|||||,.|||||}}},}|||||})))}..|||||||||.{({(((.{{{{{.((.{(((((((.......)))))))},||,{,,,,{,.{{|||{{,|{{|{{{|||,,,,,..,{{,{{...,,...{(((((......))))))..,,},}}))},))}))},}}}}})))},,}.,})}}}|{{{{{{..,}},,.)))))}}}}}}..}})))).,,}}}})},}))))},),,,.,,|||||}}...)))))))}}}}))}((((((((((({{(((((......)))))}....,.....{(((((...))))))..(((((.(((((((((..((((((((...(((((((.,(((({{{.......((((..(((((((((((((.(((............)))..))))))..)))))))..)))){{{{{.}|||||,,,,,|}|||,..}}}}),||||,,|{((.((((((.((..{{...||,}).}})))}.})}}..}}||{{{{{{{(({{.((((((....)))))},|,,}}}||||||||{(({.((((((((({{.,,}}}...},...,))))).}}}))),,,}}},}},,,.,{|||{{{{{|.,,,,||||||,,,((({{{{,...,.(((((........)))))||||{,{,}}))))),,.......,,|||||{,,,|}}||}...,,...|||||||||},......{.(((((.....))))).,))}}}}}},.,}}})),))))),)))))))..))))))))..)))).........))))).))))){(({...,}}}{(((({((({..(((((((.((,(({.(((((.............,,(((((.,{({{.{,((((((((..........)))))))),,.)))}.)))))..))))).})).))})))))))..,,}}),,))))))...))))))))))))..,,})
Forensic Context

No forensic context available.