Basic Information

Symbol
hsa_chr11_0009200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-YAP1_0050
Host gene
YAP1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
11:102103040-102105376 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:102232309-102234645 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-538.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -586.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 596.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((.(((((((((((.(((..(((((((((...............(((((.....))))).....((((.......))))(((.......))).....((((((....)))))).......(((((.(((((..............(((((..(((((.......)))))..)))))....((((((...................)))))).((((((((...))))))))..))))))))))))))))))).))))))))))))))....))))..)))(((..(((((..(((.(((......(((..(((((((((.(...(((...((((....))))...)))(((((((......((((((((...))))))))((((((((.((((..((((((((((((.(((((...(((((((((.(((((..(((.......)))....))))).....((((........((((((......)))))))))).........((((......)))).............)))))))))..............(((((((((....)))))))))(((.((((((((......))))).((((((((((((((.((...............))..))))))).)))))))(((((((..(....)..))))))).))).)))...))))).)).)))..(((((..........)))))((((((...))))))......)))))))..))))...)))).))))((((((((((((((....(((((((....)).))).))..)))))))(((((((......)))))))(((((.............................)))))...(((....(((((((..((.(((((((......(((((((((((((.(.(....((((((..............(((((((((......))))))).))))))))...((((((((((((.((((((((........(((.....))).......)))))))))))).))))).....)))....(.((((...(((((((.............)))))))...)))).).(((..((..(((.(((((....(((..(((((...((((((...((((((....)))))).(((((..............))))).........(((((......)))))......(((((((...........))))))).................(((((((((((((...................)))))).))))))).......(((....))).........................((((.((((((................(((.((((((((.....(((.(((((((........(((((...)))))))))))).)))((((........))))....(((((((((..................))))))))))))))))))))((((...))))..(((((.........)))))..(((((((.........((((((((((.(.(((((((((...........)))))))))).)))).))))))..)))))))......((((((...(((((..(((((((((((((.(((((((((((((...(((......))))))..(((((((...))))))).......((((.(((((((((.((......(((......)))((((.((((((....(((((((((.........................)))))))))))))))..)))).)).))))).))))))))..(((.((.....)).)))...)))))....)))))))))))))).....))))..)))))...))))))((((((....((((((...(((((....)))))..........))))))..))))))...)))))).)))).........))))))))))).))).....))))).)))..))..)))..........((((((..((((......))))...........(((((......))))).))))))......).).)))))))))))))))))))).))..)))))))..)))(((.((......)).)))....)))))))....)))))))......).)))))))))..))).........(((((((((......))))))))).....))).)))..))))).(((((.((((((......))))))....((((((.....(((((.....)))))......))))))..))))).....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((.(((((((((((.,{{,.(((((((({{{,..,,......,,(((((.....)))))..{..((((.......)))),||.......}}}..,,.{(({{{....}})}}||,|,...|{{{{.{{|((.{,...........(((((..(((((.......)))))..))))}....((((((..,,...........,,..)))))).((((((((...))))))))..}}))}}})}}})))))))).)}})))))))))))..,.})))..)))(({..(((((,..,,}|,|}...,,{{{.,(({{{{(((.({((((((..(({,.,,,|||}....,},,||||||||...{(((((({...}))))))|(((({{{{,{||{,,(((((,(({{{{,||||{,..(((((((((.(((((..(((.......)))....})))).....((((........((((((......)))))))))).,,,.....{{{|......}}}}.............))))))))).....,.......,(((((((((....)))))))))|{{.{{{(((({......))))),((((((((((((((.({,,...........,.)}..))))))).)))))))|((({{{..{..,,),,))))))}.,,,.})),,|)|},}.}}.}))},||||{..........}}}}},|{|{||{||}.,)}}},,,})))}|})|,}})}|||}}}},}}},{{(((((((,,,,,{{{.,,,,,||}.{{|||..,.,,})))),,,|(((((((......)))))))|||||}}}.,..,.,.,,....,}}}}....,..})))},.,|||....(((((((..((.(((((((......(((((((((((((.,{(,,..{{{|||,..........|,.(((((((((......))))))).}}}}))}}...{{{(((((((((.((((((((........(((.....))).......)))))))))))).))))).....}}}....(|((((,,,(((((((.,..........,)))))))...||||,},(((..((,.(((.(((((....,{{,.(((((...((((((((,((((((.,,,,,,((((({{((..............{,{((((((((,..((.((,.,..,,,,........|}}||,.,,..,}..,)))))))),,................(((((((((((((,.................})))))))}}))))).......,.,...)))))))).,,,.................{(((.((((((...........,|||,(((.{(((((((....,{((.((((((({.,,{....,,,,....))))))))))).))}|(((........)))}....{((((((((..{{............,.))))))))}}}}||||}}|,((((...))))..{{|||,|.......})))),|(((((({.........(((((({(({.{{(((((((((...........))))))))),.)))).))))))..))))))),....,|{{{{{...(((({..(((((((((((((((((((,{{{((((.,.(,,......,},))),.(((((({...))))))).......(((,,(((((((((.{{......(((......))){(((.((((((....(((((((((.........................)))))))))))))))..)))}.}}.))))).)))))))}..{{{.{{.....)).))}...,}}}}....)))))))))))))).....)))}..}))))...)))))}((((((.,,.,((((({,{(((({....}}}})...,.,,.,.)))))),.))))))...)))))).))))}}}}}.,}.})))))))))).}}).....))))).))).,))..)))......,.,,|{{,,,...,,.}}}}}.)))).....,|,....,|||,..,(({|,...})))))}),..}),).)))))))))))))))))))).))..))))))),{|||((({(,{{{{..||.,,),..}))),)))}}..)))))),......,,)))))))))..,||{.....}}}(((((((({......)))))))))..,,||}}.,}),,,))))},,,,,.((((((......))))))..,|||,||||,...}}|||,,...|||{{,,,,,.{,.....,.))))}}...)))
Forensic Context

No forensic context available.