Basic Information

Symbol
hsa_chr11_0169800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ZBTB44_0026
Host gene
ZBTB44
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
11:130106053-130106898 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:130236158-130237003 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-209.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -224.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....(((((((((((((((.(((....((((((..(((((((((((...(((...)))...)))))))....(((((..((........))..))))).........(((.....(.....).....))).....))))..))))))..........((((((.(((.((....((((((((((..((((((((...)))).(((((((((.(((((...))))).)))))).)))..))))))))))))))....)).)))((..(((((....)))))..))(((....(((.(((((..(((((((((((...(((((((((.....)))))..))))(((.((((((...(((((...(((((...)))))...)))).)...))))))))).(((((((.((...............))...((((((((.......))))))))...)))))))........)))))))))))..))))).)))...)))......)))))).............))).))))))).)))((((.(((..(((......)))..))).)))).......((((((((....((((...))))..))))))))))))).....)(((((((.(((((((.((((((((((((((((((..((.((((.(..((........))..).))))))))).))))..))))))))))).)))))....)).))(((((..((((((((((......))))...))))))..)))))((((....((...((((((((((....((((.....))))........))))))))))....))..))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.....((({(((((((((((.(((,,,.((((((..(((((((((((...(((...}))...)))))))....({{{{,,(({{,.....}}.,)))}}.,,},},,}|||},.........,.....,,,.....))))..)))))).....,....((((((.{((.((....(((({{{{{{.{{(((((((...))))}{((((((((.(((({...})))).)))))).))}||}}|||}}}}}))))....),.)),((..(((((....)))))..)),((....(((.(((((..(((((((((((...((({(((((.....)))))..})))((,{((((((...(((((...(((({...}))))...)))).)...))))))))).(((((((.{(,,,....,}}}....,,...((((((((.......))))))))...)))))))........)))))))))))..))))).))),.,})}......)))))).............))).))))))).)))((((.(((..(((......)))..))).)))).......((((((((....{((,...}}})..))))))))})))),....)((((({{.(((((((.((((((((((((((((((.,(({((((.({,,,..}},}}}))..,.,,})}}))).)))),.})))))))))).))))),,,,|}.}}{{|||,,((((((((((......))))...))))))..}}}||(((({...||,..(((((((((({,{.((((.....)))),,}}....})))))))))..,,)),,)}))..)))))
Forensic Context

No forensic context available.