Basic Information

Symbol
hsa_RP11-192P3.5_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ZEB1_0064
Host gene
ZEB1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:31650393-31652934 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:31361464-31364005 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1070.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1110.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 518.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((...))))..))..))(((...(((((((((((((((..((((((.((((((((((.(((..(((((...)))))...)))...))))))(((...(((((......))))))))((((..(((....((..(...(((((((((((......((.(((..(((((((((.(((.(((((..(..(((....((.(((.((.((((.((((......)))))))).)).))).))...)))..)...)))))))).........)))))))))))).))...((((.......))))((((((((((..((..((((((((.(((((.((((.(((((........))))))))).....)).))).))).)))))..))..))))..........)))))).....))))).)))))).)..))......)))..)))))))).).(((.(((((((((.(((((.........(((((((((((....)))))).....)))))..)))))..)))))))).).))).))))).))))))......(((((....(((..(((((((((((((((((((.(((((...(..((((.(((............))).))))..).)))))...))).....))))).)))))))))))..)))...)))))........(((.((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((...((((((((((.....(((....(((..((((((.....)))))).)))..)))(((((.((.((.(((((((..((.....))))))))))))).)))))(((....((.((((..((...((((((....((..((.((((((((((((..(((.....))).))))...)))))))).))))...(((((((((.........))).)))))).........)))))).))..)))).))...))).((.(((...((((((.(.((((.(((......)))...))))...).)))))).))).))))))))))))))))))))))))))))))).)))))).)))))))))).)))....(((.....(((((....)))))..)))((((......))))..).))).))))).........((((((((((((..(((((.((((((((((((((....))))))))((......((((((.(((((((((((((((((((.(((((...((((....))))..)))))((((((.........(((......(((....((((....))))..)))))))))))).....(((((....((((.((.(((.(((((((............)))))))...))).)).))))..)))))...)))))).)))))))..((.......))...(((.((((((((...(((.(((((....((((.((.((((...((((((...((..((.((((((((...((.((((.((((((.(((.((..(((.....)))..))((((.((.((((.((...((...((...))...))...)))))).)).)))).))).)))..(((........))).(((((((.((.((((..(((((............)))))....)))).)).)))).))).(((....)))..(.(((((....(((((((.((((..(((((.((((((.....))))......((.((((.((((........)))))))).)).((.(((((....((((....))))..))))).))..((((((.((((((((((((..((.((((..(((((.((....(((....))).....(((.((((((.(((..(((.((......))..)))..))).)).)))).)))....((((((((((.((.(((((....((((....))))...)))))))......((.(.(((..((((((.((.((((..(((((.(........).)))))....)))).)).)))).))..))).).))(((((...(((..(.((((((.(((.......))))))))).)))).)))))..))))))).)))...((.((((.(.((...)).).)))).))((((((.(((.......)))))))))..)).)))))....)))).))..)))......)))....)))))))))))).((((((((.(((.......))))))))))))).)))))....)))).)))))))..))))))(((..((((....)))).))).))))))))))))))))).))..))...)))))).....)))).)).))))..)))))(((((((((..........(((((....))))).(((((.(((..........)))..((((((.(.(((.......)))).))))))...)))))..)))))).)))...)))...)))))))).))).))))))))))))......)).)))))))))))..)))))))..))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((...))))..))..})((({{.(((((((({((((((..((((({.((((((((((.(((..(((((...)))))...)))...))))))(((...(((((......)))))))){(((..(((.{{.,...{.(((((((((((((...,,.{,.,((.((((((((((.(((.(((((..{,{({{,..,({.{((,{(.((((.{(((,...,.)))))))).)),))).))...))}}}}}..)))))))).........))))))))})}},,,...((((.......))))((((({((((..((..((((((((,(((({.((((.(((((........)))))})))}...,)),))}.))).)))))..))..))))..{{....,})))))).,...))))).))))))})).},....}}))),.)))))))).}.(((.(((((((((.(((((.........(((((((((((....)))))).....)))))..)))))..)))))))).).))).))))).))))))......(((((....(((..(((((((((((((((((((.(((((...(.,((((.(((............))).)))).,).)))))...}},....}))))).)))))))))))..)))...)))))........(((.((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((...((((((((((....,(((....(((..((((((.....)))))).)})..))}|((((.(.{((.(((((((,.,,.....}}))))))))))},))))|{{{....{(,((((,.((...((((((....((..((.((((((((((({..{((.....}}}.))))...)))))))).))},...(((((((((.........))).))))))....,}}..)))))).}}..}})),)).,,))),((.(((...((((((.(.((((.(((......)))...))))...).)))))).))).))))))))))))))))))))))))))))))).)))))).)))))))))).)))..{,{{,.....,{|||,...))))}.....((((......)))).,),))).)))))}}.......((((((((((((..(((({{(((((({(((((({....}))))))}((......(((({{{(((((((((((((((((((.(((((...((((....))))..)))))((.(((........))).))..(((((....((((.((.(((({((((.({{{((({.,{..{{,},..},),)})))}|..((((..({...},)))}.....))))),.}))).)).))))..)))))...)))))).)))))))..((.......))...(((.((((((((...(((.(((((....((((.((.((((.,,((((((...((..((.((((((((.,.((.(({{{(((({{{(((.{..{{..{(.(((((....((((....))))..))))).}}..},..,)}}}))}.,|||{||.||.||||.|||,|||..(((........))).,({((((.{,.||||.,||{||,..,,,......}})))....)))).)).)))).))).(((....)))..{.(((((....(((((((.((((..(((((.((((((.....))))...,{.((.((((.((((,....,,.}))))))).)).||.(((((....((((....))))..))))).}}..((((((.((((((,{,(((..((,((((..(((((.((....(((....))).....{((.(((({(,(((..(((.({.....,}.}.)))..)},,)),)))).)}},...((((((((({.{{.{((((....((((.,,.||||.,{}}|||,|.{{...{|.|.|||..||((((.({.({{{..{{{{(,(,,,,,...}.}})))....)))).)}.)))).}}..}}}.},,}{((({...{{{..|.((((((.(((.......))))))))).|}}}.})))}..))))))).)))...((.((((.(.{{...}).).)))).))((((((.(((.......)))))))))..)).)))))....)))).)),,})),.|...}},,...)))))))))))).((((((((.(((.......))))))))))))).)))))....)))).)))))))..))))),{{{..((((....)))).))),))})))))))))))))).))..))...))))))...,.)))).)).))))..)))))(((((((((....,{{,.{((,{(.{..|}}},,|||,,}||,,}},...{{{,||{.((((((.(.(((.......)))},))))))..})).))}.)))))).))),..)))...)))))))).))).))))))))))))......)).)))))))))))..)))))))..))))).)))
Forensic Context

No forensic context available.