Basic Information

Symbol
hsa_ZEB1_0001100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ZEB1_0085
Host gene
ZEB1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:31609507-31803636 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:31320578-31514708 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-568.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -607.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 497.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....((((((((.(.(((((((((.....................)).))).((((((((....(((.....((((((((.(((((((..(((((((((((((...))))))..((..((((.(.((.......)).).))))..)))))))))....)))..((((((((((((((...((((.(((.(((((...(((.......))).))))).))))))).)))))))))).)))).(((((((((((((.((((.(((((((((((((((((((((((((......(((.....((((.((((((((((....(((((.((..((((......))))...)).)))))...)))))))......))).))))....)))..)).)))))).))))...))))))))))..((((((((....)))))))).(((.(((.....))).)))....((((...((((.((((.((((((((((.(......).)))))..(((....))))))))))))....)))))))).))))))).)))))))........((((........)))).(((...)))((((((....)))))).((..((((.........))))..))((((((((((((.(((((((....(((....)))...))))))).)))).........((.(((((...((((((...))))))....((((((((((((((((((.......))))))))).............................(((((.((.(((((((...(((((....)))))((..((((........))))..)).....(((((..((.((((((((((.((((((...((.((((.........)))).))..)))))).)))))))))).))..))))).(((((..........))))).........((((((((..............((((.....))))...........)))))))))))))))..)).))))).....))))..)))))...((((.(((((..(((.......))))))))..))))..))))).)).........))))))))...)))))).....)))).))))))))..)))..........))))))))..((((..(((((((((....)))))))))..))))......))))).))))))))....(((.((((.((((.(((.......((((((((((.(((.............))).))).)).))))).....))).)))))))).))).....((((((.((((((.(........).)))))))))))))).(((((((((((((.....(((.(((.(((....))).((((((.(((((..((((((((((((((.....((.........))....))))))(((((((((((((((..........((.....((((((..((((((...))))))........)))))).....))....(((.(((..(((...(((...........))))))....))).)))....(((((.(((...))).)))))........))).))))))))))))((((....((....))(((((..(((..((....))....)))..))))).((.((((((((.(........).))))))))))....)))).(((((((...)).)))))((((.......))))..))))))))....)))))......((((.((((.......)))).)))).....(((((.((..(((((((........)))))))..))...)))))....(((((((((...((.......((.....)).......)))))))))))..))))))(((((...(......)...)))))((((.((......)).))))..........))))))......)))))......)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.....((((((((.{,(((((((,{.....|,..............,}.}}}.((((((((....(((...,.((((((((.(((((((.,(((((((((((({...})))))|.{{..{{{{,{,{{,,.....}},}|||}|,,|}}))))}|,...}))..((((((((((((((.,.((((.(({.(((((,..(((.......))).))))).})))))),)))))))))).)))).{{(((((((((((.((((.((((((((((((((((((((((((({{,,.(((({{{..((((.,.,,,||||,....,||||}||..((((,.....},,)||}}..}}}}),}}},,,,,,|,,...,,..},,....,))}..)).)))))).))))...)))))))))).,((((((({....}))))))),,(({((,.....,||{|||.....,||}..||,{.((((.(((({(((((.(......).))))).,(((....))))))))))))....,,))))).,))})))).)))))))...,,,,,((((........)))),((({{{|,,,{{|||},},)|||||,{,{{((,,.........||||{,||({.,,,,{((((.(((((((....{({....}},...))))))).))))|..,,.},}}}.,,|||||.{(((({...}))}}}...,,||||..(((((((((((.......))))))))))).,.,{,{.,..,,.(((........}})..||.|}}}}}.,,....{||||}},.,,,,}||,,,,{|,,,}}.,,))))}}})),|..|{{||..|{.((((((((((.((((((,.......((......,.,,,,}.,...)))))).)))))))))).}}..||}|}.(((((....||,{{.}}|||{{,.,,,.|{{{{|||||,........,}}}}|||,,.,|))}}||..,|..||,,,||}|||||,,,,,,{{{.},|||.||||}||||,}}|||..|((({.{{{||,,|||...,,,.}}))))}),,))))...}))),|||{{.||...,}),))))}..)))))}.....)))).))))))))..)))..........))))))))..{{{(..(((((((((....)))))))))..}}}},,,,..}))}}.)))))))).,..(((.((({{((((,,((.{{{{{.,((((,{,{{.{{{.............)},})))},)),)))),},,.}}|,||},}}}}.}}}.....((((((.((((({.{........}.)))))))))))))).(((((((((((((.,.,.{((.((,.(((....))).((((((.(((((..((((((((((((((.....{,.........))....))))))(((((((((((((((,..,,,...,{,.....((((((..((((((...))))))........)))))).....,,....{{(.(({..{{{..,|||..,,,......},.))}....)}).})),,..(((((.(((...))).)))))........))).)))))))))))){{((,,..{{....}}(((((..(((.,({....))....)))..))))).{{.((((((((.(.,....,.).))))))))}}....}}},.((((((,...,).))))){(((.......)))),.))))))))....)))))......((((.((((.......)))).))))..|||{((((.{{.,(((((((........)))))}},,)}...))))}.|,.(((((((((...({.......{{.....}}.......)})))))))))..))))))(((({...{......}...)))))|||||{{,{{,,.,.}))),.,}})...},})))))....}.)))))......,))))))).
Forensic Context

No forensic context available.