Basic Information

Symbol
hsa_ZEB1_0003400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ZEB1_0173
Host gene
ZEB1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
10:31642449-31647262 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:31353520-31358333 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-412.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -452.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 381.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.......((((....))))....)))))((((...((((((((((((((.((......)).))))))).........((((((((((((((..(((((((((((.((((((....(((((....((((((((.(((((.....((((((((((((.......................((((((((..((((.(......(((((..((((((.(((((....(((((..(((((((((.(((..((.((((.((((((((((.(((........((((.(((((......((.......)).......))))).))))...(((.(((........))).)))....((((((.((((.(((................(.(((.(((((.......)))))))).)...........((((((((....)))).))))...........))).)))).))))))......((((..(((((((.((((((..(........)..)))))).)).)))))..))))...........)))))))))).))).........)))))).)))))...)))))))..)))))....))))).)))))).....)))))).)))))))))))).(((......)))..)))))))))))).....)))))))))))))....))))).....................))))))..(((((.(((((...((((((....))))))...))))))))))....(((.(((.(((....((((((..(((((((.(((.(((((.....))))).))))))))))(((((((....))))))).......................))))))....))).))).))))))))))))))..))......)))))..)))))))))))))).................(((((((((..(((((...))))(((((...........)))))((((((((.(((((((((((....)))))((.((((((............))))))..)).))))))(((..(((((.(((((((......(((....)))((((((.(((((((..((((((............)))))).........(((..(((((((....)))))))..)))(((((........)))))....(((.((((((...)))))))))..(((((((.....(((((...))))).....)))))))..((((((.((((((((((((.............))))))))))(((((((((((.(((((((((((((((((..((..........))..))))))).((((((((((((((((...))))))........(((((((.((........)).))))))).((.....(((((......))))).....)).(((((((.....(((((....)))))(((((((((......))..))))))).)))))))......((((((((....))))))))((((....)))).......))))))))))...))))))))))........((((...((((..(((((((..........))))))).)))).)))).((((((.....)))))).))).))))))))(((((....)))))..(((((....((((((((......))))....))))..))))).)).))))))........(((((....)))))...)))))))..)))))).))))))))))))..))))))))))).(((((((........)))))))......((.((((((....)))))).)))..)))))))))....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.......((((....))))....)))))((((...,{{{{{,(((((((.((......)).)))))))........{((((((((((((,,.{(((((((((((.((((({.,{{((((,....(((((((,{(((((.....(((((((((((({,,,...,.,||,.......,.,(((({{({..{|{{.,...,,{(((((..((((((.(((((.,,.(((((..(((((((((.(((..((.((((.((((((((((.{((,,,...,.{(((,(((((,..,.,{{,.....,|}.|.....,}}}},))},.,.(({.(((........))).}}}....((((((.((((.{(({{,..{{{|..,||,,({((,,{{{{|,,.....))))))),.)...........((((((({....}))).))))...........}},.}))).)))))}....,.,,{,..|{{||{{.{(((((..{,,....,}},.)))))}.)),)))}}.,})}}.....,.,,..}},))))))).))}.........)))))).)))))...)))))))..)))))....))))).)))))).....)))))}}))}}}}}}})))..,|.,,..,},}.,)))))))))))).....)))))))))))))....,,,)}.}}})}....,,,,......,}}}},,..{((((.(((((...((((((....))))))...)))))))))}....(((.(({.{{(.,,.((((((..(((((((((((.(((((.....))))).))))))))))(((((((....))))))).......................))))))....))).))),}},)))))))))))},........))))),.})))))))))))}}.............,,..(((((((((.{((((,...}))){((((...........))))}((((((((.(((((((((((....))))){,.((((((............))))))..}}.))))))(((..(((((.(((((({......||,....||,((((((.(((((((..{{({((,{{....,,,..}))))}........,(((..(((((((....)))))))..)))|((((........))))}....((,{((((((...)))))))))..(((((((.....(((({...})))).....)))))))..((((((.((((((((((((.,.........,.))))))))))(((((((((((.(((((((((((((((((..((.{{,...}},}}..}}}}}}},{((((((((((((((,...}))))}..,.....{((((((.{(,,,.....)).))))))}.,,.....(((((......)))))...,||,.(((((((.....(((((....)))))((((((((,,,....)).}))))))).)))))))...|},((((((({....})))))})||||,}|.,},,.......)))))))))}...})))))))))........{(((...((((..(((((((.{,....,,.))))))).)))).)))}.((((((.....)))))).)))}})))))))(((((....)))))..(((((,.,,((,,({{{..,...}))}..,,)),},.))))).)).))))))........(((((....)))))...)))))))..)))))).))))))))))))..))))))))))).(((((((........)))))))......((.((((((....)))))).}),..)))))))))....))))
Forensic Context

No forensic context available.