Basic Information

Symbol
hsa_ZEB1_0014900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ZEB1_0207
Host gene
ZEB1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
10:31673662-31750166 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:31384733-31461237 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-663.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -720.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 649.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.(((....).)))))).))))).((((....((.(((((((.(((.....))).))))))).))...((((((.....(((......)))..))))))(((..(((((((((((.((((((((((((((((((....((((((...))))))..))))).........(((((((((...(((.((.(((..((((((.(((((((((((((((((.((.....((((((((((....(((((((((((......((((((((((.....)))))))))).....)))))))))))....(((..((...((((((.....(((((((((((((((...(((........)))...))))...))))))))))).....))))))..))..)))((((((((((((((.......))))....((((((((((...((((((((....((((((....))))))...))))))))........(((...((.....))...)))..((((((....))))))..((((((((((((((((........)))))))..))))).....))))....)))))))))).......))))))))))...))))))))))......((((.(((.((.........)).)))))))..(((((...(((((......((((...(((((...)))))....))))))))).....)))))...........((((((((....)))))))).(((((((.((((((((((..(((((...................(((.((((((((((((((((((...))))))))....(((.((((((((((((((.........)).)))))))..))))))))....((((...((((.....))))...))))..((((......))))......(((....)))......(((((((..((((((.((((((((.(((((.((((.......((((((((((...((((......(((.((.(((.(((((...(((((((...........)).))))).)))))))))).)))..))))....)))))))))).....)))).)))))))))......)))).)))))).)))))))......)))))))))).)))...((((..........))))...)))))..)))))))))))))))))......((((...........))))......(((.((.(((..(((.((((((....(((((((((.(((....))).............((((((.(((((((.........))))))).)))))).....)))))))))..)))))).))).))))).))).......)).))))))))))))....))))).))))))((((((...)))))).((((((((...((.(((((((((((((((..(((.((((((.(((((((...(((((..(((...((((....))))..........((((((((....)))))..)))(((((((........)))))))...........((((((((((((((.....)))))))))))))).........))).)))))))))))).)))))).))).)))))).......(((((((((........((((..(((((((...)))).)))..)))).......))))))))).........(((((((((((((....)))))))))))))..........(((.(((...))).))).......(((((.............)))))(((((.((..((((.((((.............((((((((.........))))))))......(((((((.....))))))).....((.(((((((((((....)))))).)))))))..(((((((........))))))).......((((.(((((((....))))))))))).....(((......))).......(((((((((.((((.....(((((((..(((.(((((.....))))).))).))))).))...((((((.(((((((.....................((((....(((((.....)))))....((((((.(((..(((.((((....)))))))))).))))))...))))....((((((((((....((((((..((..(((((((((.(((((((..((((.((((((((.........))))))))..))))..))))))))))).)))))..))))))))...))))))))))))))))).))))))((((((..(((.(((((((....)))))))..)))...)))))).....)))).)))))))))(((....)))....(((((.........(((((((((((.(((.(((((.((((..(((((((((....)))))))))..))))....)))))((.(((((..(((((((((((........))))).......))))))..........))))).)).))).))))))))))).....((((((....))))))))))).....((((((((((((......(((....((((((....))))))...)))......))))).)))))))...)))).))))..)))))))))))))))).))..))))))))...(((.((((..((((...((...))...))))....))))..))).))))).)))..)))))))))..)))))).))))))).)))))).....)))))))).))).).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,((((,({.{{{.,,{{{|,},||{|||,,.{{,||,,,,{,|||||{{,|{{,,,,.)||,|}|||||,,,....|||||}....{((,.....}})..)))}}}{{{..(((((((((((.(((((((((((((((((((...((((({...))))))))))})).........(((((((((,..(((.{{,(({..((((((.(((((((((((((((((.({.....((((((((((.,,.(((((((((((......((((((((((.....)))))))))).....)))))))))))...,|{{.......{{({{{.....(((((((((((((((...{{{........}}}...))))...))))))))))).....}}}))}..},.,||{((((((((((((((.......))))....((((((((((...((((((((....((((((....))))))...)))))))}..,.....,{(...{{.....||...}},.,((((((....)))))),}}.,,{{{(((((((((........)))))))},,}}}}......}},..,,)))))))))).......))))))))))}}}))))))))))......((((.{((.((.,.....,.}},}}}}}}}..{{|{{.,.{{{({......{{{{{{|{,,,,,,}}}}}},,,.,,,,},}}}.....}}}}}...........((((((((....)))))))).{(((((((((((((((((..(((((,,..,,,,,,,,.......,...........|,((((((((...))))))))....(((.((((((((((((((.........)).)))))))..))))))))....((((.{.((((.....)))).}.))))..((((......))))......(((....)))......(((((((..{{((((.,...((((.(((((.{(((.......((((((((((.{.((((...{..(((.((.(((.(((((...(((((((..,........)).))))).)))))))))).)))..))))....)))))))))).....)))}.))))))))).....}))),..}))},.))))))),,,...,,}))))))}.}}}...{{{|,,,......,)}})...)))))..))))))))))))))))}..,,,.{,((,{|,....,}.}))),...,,||{.{{.(((..{((.((((((....(((((((((.{((....}}}..,,,,......{(({(((.({{{{{{.,.......))))))}.))))))},...)))))))))..)))))).))).)))},.}},.......)).))))))))))))..,,})))).)))))),|||||.,.}|||},.((((((((...{{.(((((((((({{(({..(((,({,,,,.|||||||..,|||||.,,(({..((((....)))).....)}}.(((((((((....)))))..}))).,{(((,,,,....}}}}}}},..,,,|||,}||{{{(((((((((,,,,,||}}}}}}}}}|||{.{{{{{{{{||..||||||||||,,||||||.},,,}}}}}}|,.....,{(((((({.,......((((..(((((({...}))).)))..))))...,}}.})))))))}.........(((((((((((((....))))))))))))}..........(({.(({....}},)))..,,,..,,,,,,|,{{{{.....}))).|(((((((((((.{(({({{,....,,......((((((((.........))))))))......(((((((.....))))))),}}},.},|((((((((((....}))))).))))))))))||))))}}......{((({|....{((.....}}}}}}}}}}}}))))))}))}},,}}}|||,,}}}})))},.....(((((((((.((((.....(((((((..(((.(((((.....))))).))).))))).)}...{(((((.((((((({,...,,.....,,,,.....,{{,....(((((.....)))))....((((((.((,{.{({{((((....)))))))))).))))))...},,.....,(((((((((....((((((..{{..(((((((((.(((((((..((((.((((((((.,.......))))))))..))))..))))))))))).)))))..}}))))))...))))))))))))))))).)))))|((((((,.(((.(((((({....}))))))..))).,.)))))),....)))).))))))))).|{,..{((({...((((({,..,....(((((((((((.(((.(((((.((((..(((((((((....)))))))))..))))....))))){(.(((((..(((((({{({,,,......}}}))....,..))))))..........))))).)}.))).))))))))))).....,{(({{....}))))))))))..})))|{{{{{{((({......{{{.,..{{{{{{....)))))).}.)))......))))).))))))}.,,)}}},,,,|,,,,}}}})))))))))).}),.)))))))).}}|{{.((((..{(((.,.{{...}}...))))....})))..)}}.)))}}.))},.)))))))))..)))))).))))))).)))))),....)))))}}),,})})}
Forensic Context

No forensic context available.