Basic Information

Symbol
hsa_ZEB1_0016700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ZEB1_0087
Host gene
ZEB1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
10:31706886-31707931 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:31417957-31419002 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-276.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -297.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 312.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.......(((((((((((..(((((......)))))((...((((((......(((((.(((.((((...))))...(((((((..((((((...........))))))..)))))))...))).)))))....(((((..(((((....(((((.(((((((((.(...).))))))))(((((.........)))))...((((((......))))))((((((..(((((((......)))).((((.(.(..((((...))))..).).))))......(((((..((((((((.....((((((....)))))).(((((((((..........((((.(.((.......(((((((.(((.....((..((((((((.....))))))))..)).....)).).))))))).......)).).)))).((.....((((...(((((........))))).)))).....))((((.((((((((((..........)))))))))).)))).))))))))).....((((((((....)))))))).......((((((((..((((((..............((((((((...)))))))))))))).))))))))...))))))))..)))))))))))))).....).)))))))))).)))))))))))...)))))))))))))((((.((((((((.....((((((((((.(((...))).)))..)))))))......))))))))..)))).((((..(((...)))..))))..(((((((((.....((.......))....)))))))))....(((((((((((.((((.((((((((...(((((((..((...((((((((((..((((.....(((...(((.((...........))))).))))))).)))))))))).))..)))))))...)))))))).)))).)).........))))))))).........))((..((((((((...(((((.....))))).))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.......{((((((((((..(((((......))))).{{,....||..{{{.....}}}{(((((((.....{{((((((((({{{((({{,..,|,,,.{{((((|||.,{{|(({{{{.,((((.........{{{,,{{{,,{....,..,,{{{((({((((({{{{((||,,,,.(((((......,,.)))))...((((((......))))))...........{((({.{{{{({{{{,((,.{{({,{((({..,,}}.,))).))))........|||,,||,||........||,{{,,.,}))))))}.|||}}.,,,......,,.))),,|}}}},..,|,,{{{{{{.{{{.....((..((((((((.....))))))))..))....,)}.,.)))))))}}..))))},,,}))))))}),)}}|||}..{(({{..(((.((..((((((({{(.{,..((({.{(((((({((,{,,,.....}})}}))))),))))}}}..,|||,.,...((((((((....)))}})}}.,,,...{(((((((..((((((,....,,,,..,,.({{{{{{,,,,)))))))))))))).)))))))}.,,,}},))),)))))))..)).)))...}))}},,}},,}))))))))}}))))))))))))))))))))|((((.((((((((,,...((((((((((.(({...})).)))..)))))))...,,.))))))))..)))),((((..(({...}})..)))){.{((((((((.....{(,......)),...))))))))},...{((((((((((.((((.((((((((.,.(((((((..((...((((((((({,,{.(((((({,({...||.,})))),,}|,,{{|,||....)).))})))))))))).))..))))))).,.)))))))).)))).)),........})))))))).........))((..((((((((...(((((.....))))).))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.