Basic Information

Symbol
hsa_ZEB1_0019400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ZEB1_0158
Host gene
ZEB1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
10:31773377-31775371 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:31484448-31486442 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-431.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -470.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 383.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((...((((((((..((((..(((((((((((.............((((((((..((((.(((((.((((........((((((((..........(((((.......))))).....................(((((......))).)).))))))))))))))))).)).))..))))))))(((((.((((.((((((((((.....(((..(((((...(((((.((((..((((((((((((((((((.((((.......((((((.(((.....)))..))))))((((((((((..........(((..(((((........))))).)))..........))))))))))...(((((((((((((......))))).))))))))((((.....))))....(((((((...((((((((((...)))))))))).........(((.(((((...(((((((.....)))))))))))))))..))))))).(((((.....(((((.(((.((.(.....(((.(((((((...(((((((..(((((....((((((..((((...)))).))))))....)))))..)))))))(((((((((((.(.((((((...............)))))).)))))))))))).....((((((((((((..(((....(((((((((......((((...)))).......)))))))))...)))...........))))))))))))..........((((((....))))))............))))))).)))..).)).)))..)))))......)))))...((((((((..(((....)))..)).))))))....)))).))).))))))))))))))).(((((........(((((((((((((..((((((..((((((((((((.((((...(((......)))..)))).)))))..((....))(((..(((((((...........((((((.....))))))(((((((((.........(((((.((((..(((((.(((((((((((((((((((((((........)))))).)))..)))))))((((((..........))))))(((((.........))))).....(((((((....(((.........))).......))))))).(((((((.(((((..(((((((.......)))))))..))))).)))))))....(((((....(((((.................)))))...)))))..((((......))))................)))))...((((((.......((((.(((((((........(((.(((..((((........)))).))).))).(((((....)))))...((((((((...(((((((((.........((((..((((((..(....)..))))))..))))........)))))))))..))))))))..........)))))))))))....)))))).....(((.(((((.((((((((((...........)))))).)))).))))))))))))).))..)))).))))).........))))))))).......((.(((((((.((....)).))))))).)).))))))))))....)))))))((((((.......))))))..))))))......(((((.((....)).))))).))))))))))))))))))(((..((((...((((((.......))))))...))))..)))(((((((((((...)))))))..))))........((.((((..((.....))..)))).)))))).)))))))))).......(((((..........)))))....)))...))))))))))))))))))).)))))))).)))...))))...)))))).))))..)(......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{...,...{{((((((..((((.,(((((((((((.,,..........{(((((((..((((.(((((.((((........((((((((..,,,.....{,{{(|{...{{||,}|,,.....||,.....,,,.,,}},|,.....,})}..,.))))))))))))))))).)).))..)))))))}(((({,((((.((((((((((.,...(((..(((((...(((((.((((..{(((((((((((((((((.((((.......((((({.(((...,.)))..)))))}((((((((((.......{((((({{(({{{........))))).,}}}.}},,}}..))))))))))...((((((((,(({{......}}})).)))))))}((((.....))))....{(((({{...((((((((((...)))))))))).........(((.(((((...(((((((.....)))))))))))})))..}}}}}}|.{{{{{.....(((((.(({.((.{.....(((.(((((((..,(((((((..(((((....((((((..(((,...}))).))))))....)))))..)))))))|((((((((((.(.((((((...............)))))}.}))))))))))}.....((((((((((((..{({....((((((((({.,...((((...))))...,.},)))))))))...}}}..,........))))))))))))..........{{{{{{....))))}}............))))))).}))..}.)).}))..)))))......)}}}|{..||{{{((({{,|,....}))))}),},})))}},,)))).))).))))))))))))))}.{{{{,........(((((((((((({..((((((..(((((({(((((.((((...(((.....})),..)))).)))))..{{....}}(((..(((((((........{{{(,,,,....}})),}},(((((((((.,.......(((((.((((.,((({{.,,{(((({{(((({..{(((({,........,}|}))|||,..}}}}}||((((((..........))))))}|,,,.,,,,,...}}))},....(((((((....{{{.,,,,....))),......))))))).{((((((.(((((..(((((((.......)))))))..))))).))))))}...,{{(((,{{{{{(,,.{{{{{,............)))}}},,,)),,|||,.....,)))}...},},,,,},....}},,,,,,||,((({,.....))))..(((((,......}}}}}.,,,.,{((((((((...{{{.,,|,.....(((((....)))))...((((((((...(((((((((.........((((..((((((..{....}..))))))..))))........)))))))))..))))))))....,,,.....)))}}}}....)))))))).,,..(((.(((((.((((((((((...........)))))).)))).))))))))}})}}.}}..)))).)))))......,}.))))))))).......((.(((((((.((....)).))))))).)).))))))))))....}))))))((((((.......))))))..))))))......(((((.((....)).))))),})))))))))))),,,,,(((..((((...((((((.......)))))).,.))))..)))(((({((((((...))))))}..))))........((.((({.,(((,...}))))))).)))))).)))))))))).......(((((..........)))))....)))..,))))))))))))))))))).)))))))).))),,.))))...)))))).}|||...,......}
Forensic Context

No forensic context available.