Basic Information

Symbol
hsa_ZFR_0003000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ZFR_0050
Host gene
ZFR
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
5:32379221-32389716 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:32379115-32389610 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-432.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -464.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 570.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.........)).))(((((((....)))))..(((((...((.....(((((((((((.((......(((((......)))))....(((((....)))))(((((((((((..........))))))))))))).))))))))))).....))...)))))..(((((((((((......(((..(((((.((.((((.(((((((((....((((((.((.(((((((((.....))))....((((((((((((...))))))))))))................))))))).))))))(((((((((.((..((((((((((((......))))))....(((((((...(((((((((((....(((((..((.(((....)))...))..)))))(((((...((((((((((((((((((.......(((((((((....)))))))))...........(((((((((((((....((.......)).....))))))..)))))))....((((((((((.((((...(((....))).))))...))).)))))))........(((((((((((..((((.(.((((....))))).)))).))))..)))))))..((((((((((.....((((((((......(((((((((.........))))....))))).....)))))))).......))))))))))...(((.((((.((((((....)))))).)))).))).)))))))))))))))))))))))....(((((..((((((.((((..(......)..)))).))))))..))))).((((......)))).....(((((.(((((.........)))))))))))))))))))))....((((((((((.(((...(..((((((((..(((((((((((..((((((..((....)).)))))).(((.(((....))).))).......................)))).)))))))(((((((((................)))))).))).......(((((((((((((...)))))))).)))))........))))))))..)..)))..)))))))))))))))))....(((((((((....)))))))))....))))))....)).)))))))))......((((((.((((....))))......(((((.(((....))).))))).((((((...((((((..(((((....((((.....(((....(((..(((.(((((((....((....))))))))))))..)))...)))))))..)))))))))))))))))..((.(((((.......................)))))))((((((((.....((((.(.......).))))....))))))))..))))))((.(((((.......))))).)))))))))))(((((....)))))....(((((((((.......(((((.....)))))....)))))))))....((((((.((...(((((((...)))))))....)).).))))))))).)).))))))))..)))))))).....))).....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((({{{{.{{({{{((,,,(({{..|((({(.(((((...((.....(((((((((((.((.,,,,,(((((......))))}},,,(((((....)))))((({{((((({..........))))))))))})).))))))))))).....})...)))))..))}}}.},,|}}}....}},}}|||||}}(((((..........))))){{((((.{,,,{{|{{{(({{{((.{{{{{,{{{{..,,|||||,|||)|{(({|.,,,,|||||.{{{{,(((({..,|||||.,.}|||,..{(((((({.......((((((......))))))...((((((((...((......,,,,,.)))))))).....{{((((({{{..,,,||,.{{...,}}..}},,,,})))))))}}}))))}},(((((((((....))))))))).}}}}}}}...(((((((((((((....{,.......}}.....))))))..}))))))....{{{{{{({{{.,,{{...,.{{,,,|||{|{||{{{{||{{|||||{||,|{{{.(((((((((((..((((.(.((((....))))).)))).)))}.,)))))))}}||,,{||||.,,,.}}},,{|||||,{|||.,{{{{{{,,||,,,||}}}|||||.,{{{{{{{{{,.,,,,|{{{,{{{{{{{{{{|||,|,|{|.((((,{((((({{...,))))})))))),))),},}})))}|{|{,|.,,,,..}}},}}|||,},{{(({{{{{{.,|,),))))))))}}.|}|}}},,},,}}}||}|,,,}}}}}}|,||,.{,,{{.|||||.,,,.....,}}},},,)),},||(((({{|{{,....,}}},...})))))}}}}}}))))},||||||||||,..((((((..({....}).)))))).((({(,,.,}}))....))))}}}{{{..........,,..}})},}}}},||(((((((((..,,........,}}.)))))).)))},.....(((((((((((({...}))))))).)))))..,,,,.,,,,,,..,.{|{{|{{..,,}|,|{|,|((((,{...({(((((,(((,.,,{|||||((((.((((....}))).)))}}|{{{...,,}}|((((((.((((....))))...,,,(((({.(((....))).})))).{{({{{,..{{((({..(((((.,,.((((.....{,,....((({,{{{.(((((({..,.{,....,})))))))}}}..}}}}}})),))))..)))))})))))))))},.,({.((((({...............,.....})))))}}((((((((.....((({.{.......}.))))....))))))))..})))))||,|{{{{,.....,}}|}{{{{|||,,{({{(((({....)))))....(((((((((.......(((((.....)))))....)))))))))....|||||}.,|}}}{((((({...))))))}..,,))}},))},)))))))..,,),))))..))),.,}}.}}}}))),,}.)))
Forensic Context

No forensic context available.