Basic Information

Symbol
hsa_chr7_0684000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ZKSCAN1_0013
Host gene
ZKSCAN1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
7:99619482-99622091 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:100021859-100024468 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-910.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -959.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 617.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((((...((((((((((((((((((((((.(((((((((((((.((((((.((((.((((((......((..((((((((((((((((((((...(((..((((..(((((..(((....))).............(((((((((((((((((.........)))))))))))))))))...)))))..))))...)))...)))))).)))).)))))))))).))...(((((...(((((((.((((((((.(((.((((((((((.....((((((.((((((......))))))((((((.((((((....(((..((((((...((((.....)))).......((((((..................(((((..((((((.((.((.(((((.........((((((((((((((.....((((...................((((................)))).(((((((....(((((..((((((((...(((((((((.............)))))))))..(((....)))(((((((.((((......((((..((.(((((............))))).))..))))......)))).)))))))...)))))))))))))..))))))))))).((.((((((((.((((((.....))).))).))....))))))..)).(((.((((.((....((((..((((....)))))))).)))))))))..))))))))))))))..(((......)))..))))).)))).))).)))..)))))((((((((.(((((..(((((((((((............(((.((....)).))).......))))))))).))......)))))...)))))))).....((((..((((......)))).))))))))))..)))))).)))....)))))).)))))).........(((((.....))))).))))))........(.((((((((((((..(((((((((((..((((........))))..........((((((.....(((....)))....)))))).(((((((((..(........)..)))))))))..))))))).)))))))).))))).))).))))))))))).)))((((((((.((.((((((((((((....)))))((((((.....))))))(((((((.(((...)))...)))))))............(((.(((.((..(((((((((((((((.(((..((.((((((.((((((((((((((..(((((.(((((...((((.(((.((((.(((.((((..((((((....((((((.((((((.((.........))))))))))))))..))))))...))))..)))...))))................((((((....)).))))....(((((..((((((((..(((((((............((((....))))..(((.....)))..((((((((((...))))........)))))).)))))))..((((((.(.....).)))))).......))))).))).)))))))))))))).))))))))...))).)))).)))))((((.((((((((....(((((...(((((((((.((..((((..((.(((((((.((((((..........)))))).).)))))).)).....))))..((((((.(.......).)))))))).)))))).))).)))))((((....))))...........))).))))).)))).....)))))))))).)))))))))).))))))))..)).)))..)))..(((((.(((((((((((((.........((((((.....)))).))............))))))..(((.(.(((....))).).)))......))))))).)))))(((((.........)))))..)))))))...)).)))))))).......((((((((((((......(((((((((.....))))))))).......))))))....)))))).(((((....)))))((......)).(((((((....((((((....)))))).....))))))).))))).).)).))))))).)))))....)))))).)))).)))))).))))))))))))).))))))))))))))))))))))...))))))).))))((.(((((((.(((.(((((((((.(((..........))))))...)))))).)))((((..(((((((.((((....)).)))))))))))))...(((((((((((((..(.((.((((........))))))).))))..........)))))))))....((((.(((.(((((((..((((((....))))))..)).))))).)))..))))....(((...((.(((....))).)).)))..(((((...(((...))).)))))..............(((((((((.((.((((...)))).))))).))))))....)).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((((((.,.((((((((((((((((((((({.(((((((((((((.((((((.((((.((((((.......{..((((((((((((((((((((...(((..((((..(((((,.(({....}}}.............(((((((((((((((((.........))))))))))))))))).}.)))))..))))...)))...)))))),}))).)))))))))}.....,(((((...(((((({.((,({{{{.(((.((((((((((,,,{,((((.{(((((((({..,.....}}})}})))||||,.,...,,||||,{{{||||{||||,...{{{|((((({,{,({{{{,......}}}},...,||||{{.}||{|,|,||.(((((,({((({{{,.,(((((,,,,,,,,,..,.{((.({...................|||}|,...........}))))}.(((((((..,,((({(,,(((({(({...(((((((((.............)))))))))..{{{....,},(((((((.((((.,,...((((..((.((({(,...........))))).))..))))..,,..)))).)))))))...}))))))))))}}..))))))).....{(.((((((((.((((((.....)))}})).)),...})))))..)),{||,(({{.{{....|||{.,{{((....)))}|||{{||||}|{{{{{{.|,|{((((((.{{{{....{{.,,....)))))).)))})))},}.}))))))||||||||}{{({{..(({((((((,{..,}|,....,,|{|.{{....)).}})}},}}}},))))),,,..,...,},)),,),,.)))}}|||{{.{,({{{|({(((.({((,((|,,|||||,,,((((({....}))))}....}})))),}}|}}.,,..,..|||||...,.)))))})),)))}}.....,|,{{{||||{((((..(((((((((((..((((........)))}..........||||||.,,..||,.,,,)))....)))))}.(((((((((..(........)..)))))))))..))))))).))))|}}}.})}))}}))}})))))))))).))).,(((((,..,.{||||((((((({{{{{{,,.((((((.....))))))(((((((.(({...}))...)))))))..,,.,,||,..{((,(((.((..(((((((((((((((.(((..((.(((((,,((((((((((((({..(((((.(((((...((((.(((.((((.(((.((((..((((((....(((((,{((((((.((.{......}))))))))))))))..))))))...))))..)))...))))................(((({{....}}.))))....(((((..{{{(((((..(((((((,...........,{{{....}}},..{{{....,|||,.((({{(((((...)))}}.,.,,,}))))}}.)))))))..((((((.(.....).)))))).......))))).}},.)))))))))))))).))))))))...))),}))).)))))((((.((((((((...,({{{{...||((((((({(,..((((..,{.(((((({,((((((..........)))))).).)))))).}}.....))))..{{{|||}|,..,,,.|,|||}}|||{||||,,.})),)))))|||,.,..,,||,.......})})))}))))).)))).....)))))))))).)))))))))).))))))))..)).)))..)))..,|||..||||}}}}}))}}}}}......{((((({{{.{(((((((((......,....}......))))))))))...{{{...(({{{{{...|||||{,,{{{|{,,,{,{{,{{,...,}||{{||||,}}...},,}))))))),,,,,}.}|}}|,((((((.{{{{,(((((((((.....)))))))))}))}...})))))}))))))...}}|,(({{{{|||||((,,....}}}|,,|||,....((((((....)))))),)))))))),)))))))),).)).})))))).)))))....)))))).)))).)))))).))))))))))))).}))))))))))))))))))))).,.))))))).))))((.((((({{.{{{.((((((.(({((,,,{,,.....,,.)))...||||||.||}((((..(((((((.((((....)).))))))))))))).,.(((((((((((((,,(.(({((((........)))}}),,))))....,.,}},)))))))))....((({.(((.((((({{..(((((,....,)))))..)}.))))).)))..||||{,,,{{,....|}|||,,.,),.)))))),......(({,(((.{.(((((((((....((..,.....,..))...))))))))).}.))))))..,}.))))).)))))).)))))))
Forensic Context

No forensic context available.