Basic Information

Symbol
hsa_ZKSCAN1_0002700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ZKSCAN1_0041
Host gene
ZKSCAN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:99621076-99621930 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:100023453-100024307 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-183.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -193.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 68.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........(((((...(((((..((.((((.((((....((((((((.((((.......((((((...((((.(((.(((((.(((((((..((....))....(((((.((..(.(((((((......((((.........)))).(((((....)))))...))))))).)..)))))))....(((((.((((..((......)).)))))))))(((((((((.....................((((((((((((((.((..((..............))..)))).))))))))))))))))))))).))))).))))))).)))))))(((((..(((((..((((((.((..((((((..((((((....))))).)..)))))).((((((.........)))))).....)).).)))))..))))).)))))...(((......))).))))))..)))).)))))))).)))).)))).)).......................(((.....))).))))).))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
({(.,,,{(((,,....(((,..((.((((.((((....((((((((.((((.......((((((...((((.(((.(((((.(((((((..({....}}....(((({{((..(.(((((((......((((.........)))).(((((....)))))...})))))).}..)))))))....,({(,{((((.,({......)).))))))))|(((((((((.....................((((((((((((((.((..((...,..........))..)))),})))))))))))))))))))),))))).))))))).)))))))(((((..(((((..(((((,.,(..((((((..((((((....))))).)..)))))).((((((.........)))))).,...,),,.)))))..))))).)))))...(((......))}.)))))}..)))).)))))))).)))).)))),),..)))............,,,...,{|,....},)))).)},..))).....
Forensic Context

No forensic context available.