Basic Information

Symbol
hsa_ZNF609_0006000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ZNF609_0114
Host gene
ZNF609
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
15:64851102-64854057 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:64558903-64561858 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-750.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -805.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 759.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.......(((.((((..(((((........)).))))))).)))((((.((((((.(((((((((((((((..((.......))..))))))))......(((((....))))).))))))).)))))).))))............((((((((((....((..((((...(((((((...(((((((((.......((((..(((((((..(((((.....((((..((((..((.((((....)))).))..))))..))))....)))))....(((((((...(((((............)))))((((((((..((((..(((....)))..)))).))))))))......((((((((.(((((((((((.(((.(.((((.(((..((((.(((((.....)))(((((((((......)))).)))))..((((..........))))............((((....)))).....(((((((((.((((((((((((((((.(((((((((.((((...(((..(((((.....((..((((((..(((((...((((......))))....(((((..((.((.(((((....((((((...((((((((.......(((((..((((.....))))....)))))...)))))))))))))).....))).)).)).))))))).....)))))..)))))).))...)))))..(((((((.....)))))))......(((....))).))).)))))))))....(((((...(((.(((((((((....)))))))))))).((((..(((((..(((.(((((((..(((((.....)))))))))))).)))..........)))))..))))...........(((((((((.((((.((.((((..(((..(((((......((((..((((.((..((((........))))....))........))))..)))).....))))).)))..)))).)).)))).))))).))))..)))))....)))).))))....))))).))))).....(.((((((((.((..(((((.........)))))..)).))).))))).).)).))))))))).)).))))..))).)))).)))))))))))))))))))))))......((((.(((((((.........)).)))))...)))))))))))((((.............))))..)))))))...)))).((((((......((((...((...(((((((((((((.............))))).((.((((.......)))).))((((.((..(((...((((.(........).)))).)))..))..))))(((((......)))))...)))))))).))))))...)))))).)))))))))...))))........)))...))))))))))))))))......((((((((..(((.........(((((((((((((..(((.........................((((((...............)))))).....((((.....)))))))..))))))))))))))))..))))))))((((((......))))))((((((((......)))))))).((((((((.((.(((((((((((((....)))))))))(((((((((((((((((((.(((((.((((((.(((.(((...((((.(.(((((((((((((((...((((((((((((..(((..((.(((((.((((.......((.((((((..(..((((.((.((((((.((((.(((((((...((.((((((((.(((((..((((((....((((((.....))))))....(((((.((((((((.......)))))))).)).)))...))))))...))))).)))))))).)).................(((((((((((.((.................))..))))))))))).......)))))))........((((((....(((..((.(((....((((........((.........))........)))).....))).))..)))...))))))......(((((...((......))...)))))..((((((....)))))))))).)))))).)).))))..)..))))))))))))..)))))..))..)))..).))))))))..)))....))))))))).......((((((.....((((.((.(((((..((..((..((........))..)).))..)))))))))))))))))...((((((.............))))))..(((((((...))))))).......((((((.(((....(((((..............)))))......)))..))))))(((((((((........))))))))).((......))................((((.((((((((((((((.........)))))))...))))))).)))).))))))))))).((((((...))))))............))).))).))))))))))).)))))))))))))))))))..............)))))).))))))))...(((((((....(((((((..((.......))))))))))))))))..........((((((((.....)).))))))....((((((((......)))))))))))))((((((((((((.((((((((((.......(((((.(((((...)))))..(((((.((.((((.....((((.(...((((...........)))).).)))).)))))).))))).....)))))...)))))).)))).)))))))))...)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((,.....,(((.((((..(((((........)).))))))).)))|{((.((((((.(((((((((((((((..((.......))..))))))))......(((((....))))).))))))).)))))).))},,,,,........((((((((((....{(,,{(({...{{||{{{...(({{{{{{|,......{{{({{(((({{,.........,,|{{{.,,{{....,,{.||||..|||||..{{{{{,.....,|||{{,.|((((,.(((((((,,.(((((..,.........)))))((((((({..{{{(..(((....)))..)))).)))))))}.,,,,.((((((((.(((((((((({,(((,(.((((.{((..((((.{((((,,...|||((((((((({....|)))).)))}|.,((((,{.,,...,.))}}............{(((....)))}.,.,|{|{((((,,,((,{{,,,{{||{,{|,|||{(((((,((((...((,.,(({{{,,}..||..((((((..(((((...((((......))))....((((({..({{{.(((((....((((((...((((((((.......(((((..((((.....))))....)))))...)))))))))))))).....))).)).})},)))))).....)))))..)))))).}}...|}}||,,(((((((.....)))))||,,,...,,|,,,,},}.}}}.}}}}}}|||,,..{((({.,,((,{(((((((((....)))))))))))).,||{.||||||..(((.(((((,,,{(((({.....))))}))))))).)))}},,,,,.}}}}}}},|}||},,,},,,,...{{{{(((({.((((.((.((((,,(((,,{{(((......{{||,.{{{,.{{..((((........))))..,.}}........}}}}..}}},.....))})).,}}..)))).}}.}})).)}))),))))}}))))},..,}}})||||,...,}|||.(((((.....)))))||||||,||,,|||||..,,,...,}}|||{,...,,,,)))),...,)))))))}}}}.}}.))))..))).)))).}))))))))))))))))))))))......((((.(((((((.........)).)))))...))))}}||}}},,||}},,,{{{{..{{{{,,.{|||||,|,..|,}..||||||....{{((((...{,...{,||||||(((((.............))))).||,,{||}}..}}})},}.},((((.((..((|,..((((.{........).)))).}}).,})..))))(((((......)))))...}}||||||.}}},})}}})),))),)))))}))),,.,,,}}}}}}..,.,....,,,,,,}}}}||||||,,....||||||||.{((({{{......|||||||((((((..,,..,},}|,....{{,..,{{,,,,..{{(((({,..........}.,)))))}..,..{{{{,....,}}},,,..}}}))}}}}))))})),})))}})))((((((......))))))((((((((......)))))))).((((((((.{{.(((((((((((((....)))))))))(((((((((((((((((((.(((((.((((((.(({.((({,.((((.{.(((((((((((((((...(((((((((({,,,(((..({.(((((.((((.......{{.((((((..,..((({.(,,((((((,(((,.{((((({...((,((((((((.(((((..((((((....,{{{{{.....}}})}}....{(({{,((((((((.......)))))))}.})}}))...))))))...))))).)))))))).||.......,..,......(((((((((((.((.....,...........))..))))))))))).......})))))).....,,,((({......|,|,,||,|{{....{||{,......,||...,,....}}..,.....}}}|.....,,,.}}..,,.....,..,,......{,{{{...,{......)),..||||,..((((((....)))))),}}),))},))})}.))))..}..))))))))))))..)))))..}}..))).,},))))))))..)))....))))))))).......((((((.....((((.({{(((((..{{..((..((........))..)).,}..)))))))))))))))))...{((({(.,,..,,,,{{,,|}}}}}..(((((((...))))))).......((((((.(((....(((((,,............)))}}.,,,..)))..))))))(((((((((........))))))))).,,.,,,}}))},..,,,,.,,,....((((.{(((((((((((((.......,.)))))))...))))))}.)))).))))))})))).|||||,.,,,,,,,|,{{,........))).})}.)))))))}))),)))))))))))))))))))..............})))}}.)))))))){..(((((((....(((((((..,{.......,,))))))))))))))..,,....,,((((((((.....)).))))))..,,||{{||||,,,,,,))))))))))}}},,,(((((((((.((((((((((...,,,,(((((,{{{{{..,))})),,||||{.{{.{((({{...,,{{}|}}}{{{|...........})}}.,.|}},.})))},.}}}|,.....}}))}...)))))).)))).)))))))))..,))),...
Forensic Context

No forensic context available.