Basic Information

Symbol
hsa_ZZZ3_0004900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0114162 hsa_circZZZ3_008 hsa-ZZZ3_0045
Host gene
ZZZ3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:78046683-78107340 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:77580998-77641655 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-607.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -658.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 737.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(.(((((((..(((..((((............(((((((....)))).)))((((.....(((((((((....................((.(((..........))).)).......(((((((((((.......))))))))))).((((((.(..((((((((((......(((((......)))))........(((((((.(((..(((((((.....((((((..((((((((((.....((((..(((.....(((.((((.(((((((((((....((((((.((......(((((..........))))).........((((((.((((((((.(((((....(((((((((((..((.(.(((((((((.((......)))))))))))...).))..)))))))))))......))))).....(((((((..((.((..(((....)))....)).))..)))))))((((..((((....))))..))))(((((....)))))..........)))))))))))))).))...)))).))...))).)))))...))).)))).)))........(((.....)))(((........))).....((((((.(...).)))))))))..))))......))))))))))))))))..))))))).......((((((((((....((((((((((((..(((.........))).))))).)))))))...........))).)))))))...((((((...........))))))...))).)))))))........(((.....))).)))).))..))))...).))))))........((((...(((((.(((((((..((((.(((((.((.((((.....(((.((((((.......((((.........(((((.(.((((.(.(((((((((.((.....(((((((((((..........((((((....(((.(((((((((....((((((((......))))))))..)))))..)))).)))))))))((((((((.(................)))))))))..(((((..((....)).)))))((((..((((..........))))...))))(((((((...((((..(.(((.(((.(((((((....(((....)))((((.((((..........)))))))).....(((....))).......)))))))))).))).))))))))))))...........))))))))...)))....)))))))))))(((((((.(((((........(((.((((..(((((.........(((((.......(((.(((.((....))))).)))........)))))........((((.((..(.((....)).).)))))))))))..)))))))((((........))))..))))).)))))))....(((((((((((............))).))))))))...).)))).)...))))).....(((...)))(((((...))))))))).......)))))).))).....))))..)).))))))))).(((......))))))))))..)))))....)))))))))))))....)))).(((((.......(((.(((((......((((....))))......))))).)))..))))).........))))..)))..))))))).)..((((.((((((((((((.(...(((((.((((((((.((.(((.......((.((((......)))).)).....))))).)))))((((((.((((..............))))))))))(((.........)))........(((((((((((((.(((((.(....))))))(((((((((..(((.(((((.(((((....((((((.........((.((((.((((..(..(((.((...((((((....)))))).((((.....)))).....)))))..).)))))))))).........))).))).....))))).))))).)))(((((.........))))))))))))))..(((((((......))))))).((......))...................)))))))))))))((((((....)))))).(((......)))((((..(((((....)))))..)))).....))))))))...).))))))))))).).))))((....)).(((.((((.(((((((.........))))))).)))).))).....(((...(((...........)))...))).(((((....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,,..,,{,{{{,.((({{{({,.............{{{((({.{{{||||{||,..,{,,....,,.}}|,|}},|}}.........,,,..,{{({((({{{..{{{{,{(((...,,||((({{{|||||,|.,,{,||||||}}}}.....,{({(....)))}(((((......,,)))}}{{{{{{{(((...,,|||{{|||,|}}}},||}|}}},})}|}},||}},.|||}||||}}...|,|{||(({,.,||{.,.{|||,||||{|||||{....{{{{|},}|....,}}}|..,{(((({.((((,.......}}}}}}))}}}}}}}}}}|.((((((({,{((((((((((..({.(,(((((((((.((,.....}|}}}}))))),..,.)),.)))))))))}},,,...,,,||,}}}}|},||||...,(((((((.....(((((((.((((.((.(({..{(((.,((((....|}))..}))}(((((....))))).....,.,.,,}}}))},))).))))))}}))))),,))}}))))})}}}}.,}||}....})),.,.....|||},,,,)),(((........}))..,..((((({.,...,.)))))),||{,|.}|..,{{{{{{,,.}))))))|,,.,{{((,({{((({{(((((((((((,{{{(({{{(((((((,.{((.........})),)))}}}|}|}}}}........,,,})}.}}))))}.,,{((((({(........}}}}}}}....{{||{((({.........,,,.,,,||||..{{{{{{{{|{{{{..(((((..(((((.(((((({,.,{{{{..,,||,,,..,,,}},,}))).}))))..)}))){{{{((({{.,,,,,,(({........,,(((((.(,,,{({{,({{(({{{{.||...,,{{,(((((((({.........((((({...,(((.((((,{,,,{{,.((((((((......)))))))).,)),,}..)))).)))))))))((((((((.{................}))))))))..(((((..({....}).)))))((({..((((..........))))...}))}(((((((...,,,{,{({(((.(((.(((((((....(((....)))({({(((((..........)))))))}...,,{((....))},......)))))))))).))).)))))))))))).....,,}}}}}))})))).,.))).,..,}))))))))))),}..,.))|))))),,,..(((.((((..(((((.........(((((.......(((.(({{((....))))).)))........)))))....,...((((.((..,.((....)).}.)))))))))))..)))))))..,...}}},}}))))}})))}||||||}}|.||.{((((((((({.....,....|.}))|,))))))}...,,|{(((({..((((({.,..(((,..||}{({{{.,.))),)}}},........,},|((((......))))}..,||},.,{(((((((((.....(((({{{{{{{{|..,.....,....}))))).)))....))))....)))))).)))))}}))))))...}))))}..,,{,...(((({,.{((({{{((((((,.......,,..,}..,||}||.......,.,}))}((((((((((..((,....,}),..)))))).)))).......,{((((,,....}}}}.,,.....,,}},..}})}|||{||,|{|{,|||,......}}}))}))))))).)))}})),,..)))},,,....{((((((((((((.(((((.{....})))))(((((((((..(((.(((((.(((((....((((((....,..,,((.((((.((((..,..(((.{{...,(((((....)))))|.((((.....)))).,...}})))..}.}))))))))).,|......))).))).....))))).))))).))){((((.........)))))))))))))),,(((({{{...,..))}}}},.,,......|,...,{,.....,}}.....))))))))))))}((((((....)))))).(((......))){{{{..(((((....)))))}}))})))}))))))),})))))))))))))),,))},,,}))},,,,))}|({.((({.(((((((.........))))))),)))).)),,},,.||{...|||......,,...||},,.))),|||||....)))))
Forensic Context

No forensic context available.