Basic Information

Symbol
hsa_HSPG2_0003700
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0010567 hsa_circHSPG2_224
Host gene
HSPG2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:22155876-22166510 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:21829383-21840017 UCSC (hg38)
External Database
circbank circBase

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1076.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1117.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 570.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((.(((..(((..((((.((.((((((......))))))(((.......)))((.((((((((((((..((.((((((((((..(((((....((((......))))...(((((.....)))))..((((.....(((((((.(.....((.(((((......))))).)).....).)))))))......)))).)))))..)))).)))))).)).(((((((.(..(((((.((((.(((((((....))))...(((((.....))))).((((...))))((((((((((.((.(((((((.....)))....))).).)).))))))))))..((((((((.........(((((((((((.(((((((((....(((.....)))......((((((((.((((((((((..((((.(......)))))..))))).(((((((((....(.(((((........))))).))).)))))))((((((((((((((..((....)).))))))).).)))))))))))..))))))))......((..(((((.(((.((....)).))))))))..))....)))))))))(((((.((((((.(.(.((...)).).).))))))....)))))....((((((.............)))))).......))).))))))))....))))))))......))).).))).)))))))))).))).......)))))))))))).))....((((((.....))))))..(((..(((((((((((((.(((((((((((((..((((((((((((((((((((((....((((.....))))...)))).(((...((.(((....))))).))).((((((((((((((.(.(((....))).((((((.(((((....)).)))((.((.(((.(((.(((((..(((.(((((.(((..((....((((((.....))))))..)))))))))).)))...(((..((((....)))).)))...)))))))).)))....)).)).))))))(((.(((.((((.(((((((.((((((((...(((..((((.(.....((.(.((((((((.((..((.((((........))))))..))...)))))))).).)).).)))).))).))).)))))))))))))))).))).))).......).)))))))..))))))).(((((..((((.(((((..(....)..))))).)))).))))).)))))).))))).)))..))))..))...))))).))))))..((((((((...(.((((((.((.......(((.((((..(.(((..((((.......))))..)))...)..)))).)))..((........))..(((((((((....))).))))))..)).)))))).)....))))))))((..........)).))))))))..)))))...)))(((((((((((((..((((((.....(((((...((........))..)))))..((((((.(((((.(((((..((((((((.....((((....((..((.(((((............)))))...))..)).)))).............((((((((((..(((((.((((((((((((.(((((((.(((((((.((.(((((........))))).)).....(((.((((((((.............((((..((((...))))..))))...(((.((((((((((.((((......))))))))))..))))))))))))))).)))....))))))).))).))))..))))))).....((((....)))).......)).))).)))))...))))))))))))))))))))))).))))).)).))))......))))))...((.(((.(((.(((((((((.((((...(((((((.(((..((((.((...((((((....(((.((((......)))).)))...)))))).))))))..((((((((((((.((((....(((.(((((((((((((.((((((....)))))))))).).)))(((((((((((((..........))).))))))))))...))))))))..(((((..((((((....))))).)..))))))))).)))(((.....)))..)))))))))))).))))))).)))).(((((((((........)))))))))((((((((......)).))))))((((((.((..((...........((((....((.(((((.....))))).))..))))((((....)))).((((((....))))))))..)).))))))..))))))))).....)))))).))))))))))))))))).)))).)))..)))))))).)........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.(((((.(((..(((..(({(,.({((((((......)))))}|||,,.....}|.((.((((((((((((..,{.((((((((((..(((((....(((({((..({{{{...)})))..{{{(,|,...,||},.,..(((((((.{.....((.(((((......))))).)).....}.)))))))....))),))})))))..)))).)))))){|,,(((((((.(..(((((.(((,{((({.{{.((((..((..(((((.....))))).}.))))))||.((((((((((.((.(((((((.....)))....))).).)).))))))))))..((((((((.........(((((((((((.(((((((((....(((.....))}......((((((((.((((((((((..((((.(......)))))..))))),(((((((((......(((((........))))).})).)))))))((((((((((((((..((....)).))))))).).)))))))))))..))))))))......{(..(((((.(((.((....)).))))))))..)}....)))))))))((((({((((((.(..,.,...,..)..,)))))),},.}))))....((((((.............)))))).......))),,)))))))....))))))))....,.))).).))).)))))})))).))).,..,,.)))))))))))).)).|..((((((.....))))))..(((..(((((((((((((.(((((((((((((..((((((((((((((((((((((.,..((((,...,)))).,.)))).(((...((.(({....})))).))).((((((((((((((.{.(((...{((((((.....}}}||},..},..))|.{((((((.{(((((..,..{{{.((((,,(((..({.,..((((((.....)))))),})})))))))).,}|((((({..((((....)))).)}}.,)))},...,.)))))....},))))))}.(((.(((.((((.((((((({{(((({((,{.(((..((((.{.....{{.,.((((((((.{({{({.((((...,}}}.,)))),..},...)))))))).}..,.,.}))).))),))).)))))))))))))))).))).))).......}.)))))))..))))))).(((((..((((.(((((..{....)..))))).)))).))))).)))))).))))).)))..))))..))...))))).))))))..((((((((...(.((((((.((.......(((.((((.,(.({{..((((.......))))..}))...,..)))).))}..((........))..(((((((((....))))))))))..)).)))))).,....)))))))){{..........}}.))))))))..)))))...)))(((((((((((((..(({{(({..,.(((((.,.{{........))..))))){{(((({(,({{((.,(((({,((({((((.....{{||||.,||,.{|||||((,.{.,,,..,..,,}))....,.})).}}}}||||||,|,|||.{(((((((((,,(((((.((({{(((((((.(((((((.(((((((.((.(((((........))))).)).....(((.((((((((....,{{{,.,,,((((..((((...))))..)))){{{((,.,(((,{,,{,.|||{,.,}}})},,})))},.})))),,,)))))))).)))....))))))).))).))))..)))))))...,.((((,,..,,}}.......)).))).)))))..,}})))))))}}}}}||||,}}},.||}}},}},.|||,{{{|,||,}}}{(({{{(((,,{{,(({,,{{|||||||,..|||{{,{}||||.|||{,}},.,,|,|||....{,||{|{|..||||}|}||||{..,||{{|,{{|||||{,{.{|||{,({(({({{{{,..(((.(((((((((((((.((((((....)))))))))).).)))(((((((((((((........,.))).))))))))))...)))))))),,|{|||..|(({{{,,.,)))}}.|||,}}}},,}}|||}|||.,{,|||},|}}}})))}}))),)||||||.}||},{((((((((........))))))))}|{{{{{{{,.....,)}))))))|{||||}||,.{{........}},||||,...||},|||,}}}||}}},..,}.,},,(((((....))))}((((((....)))))))),.,)})))))),.)}))}))))}}}.})))),},)))))))))))))))...}))).)))..))))))))||{....,,,
Forensic Context

No forensic context available.