ForensicRNA
Home
Atlas
Index
MH Mapper
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_MACF1_0036700
Basic Information
Symbol
hsa_MACF1_0036700
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0113288
hsa_circMACF1_077
hsa-MACF1_0115
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39812649-39815299
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39346977-39349627
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-124.6
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-130.61
kcal/mol
Frequency:
0.0001
Diversity:
76.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
(((((....(((((...)))))....((((((..(((.....)))...))))))......((((((......((((((...((((((.(.(((((...((....))...))))).).))).)))))))))..))))))...)))))((((.(((.((((((((......(((((.....(((((.((((((((((((...((((((.((...((.((.....)))))).)))))))))))))).............(((((((((..((((((.((.....)).)))))))))..)))))).............))))..)))))..)))))......((....)).(((.(((((...)))))))).)))))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
(((((....(((((...)))))....((((((..(((.....)))...))))))......((((((......((((((...((({{(,(.{{{{|.,,((,,,.}}...}}}}).),))),))})))))),.)))))).,.)))))((({,(((.((((((((......(((((.....(((((.(((({(((((((...((((((.(,...((.((.....))))}}.)))))))))))))}.............((((((,{{..((((((.((,...,)).))))))}}}..)))))).............))))..)))))..)))))..,,..{,....)).{{(.(((((...)))))})).)))))))).)))))))
Forensic Context
No forensic context available.