Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0039000
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0011822 hsa_circMACF1_081 hsa-MACF1_0546
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39816457-39835858 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39350785-39370186 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-676.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -711.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 582.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((.((...((((..(((.(((..(((((..((((..((....)).)).)).)))))(((((........)))))........(((.(((((((((.........((((((.(((...(((((((...(((....)))...)))))))..)))..)))))).)))))).))).)))..(((.(((..(((((.((((..((((((......)).))))(((......)))............((.(((((.((.....((((((((((((..(((((((((((..((((....(((((((......(((.....))))))))))...)))))))))))...))))(((((....)))))..(((((.((..((.(((((...((((.((.(((....))).)))))).........((((.....))))(((.....))).........))))))).)).)))))..(((((((....))))))).........((((....))))(((((.(((((.(((((((((((((((........(((((....)))))........))))).........((((((.(((.((.((........)).)).)))))))))((((((((...((((.((((((...((....)).)))))).((((.(((((((....)))))))..))))......))))....))))))))...))))))))))...((((.....)).))...((((((((.(((.(((.((((..(((((....((((....))))...)))))..)))).).)).)))..(((((......)))))(((((((((.((..((((.(((((((.....)))))))..))))...)))))))))))..((((......(((........)))............(((...(((((..(((((..........((((((.............)))))).....(((((......)))))....(((....)))..))))).))))))))..(((((((((((..(((((((((((((....))))))))).))))....(.((((...)))).))))).)))))))))))(((..((((((....))))))..)))((((((((.........)))))))).((((.(((((((((((....(((...((((.....))))....)))....))).....((((((.(((.((..((((..(((..........)))..))))......)).))).)))))).)))))))).))))...))))).)))...)))))))))).)))))))))(((((((((.......((((((.....(((..(.((((((....)))))).)..)))((((.((((((((((.............(((((.........))))).((((((.((((((..(..(((.((((((..(((((.(((.(((........))).(((((....))))).)))..))).))..)))))))))..)..))))))))))))))))))......)))).)))).(((((((........)))))))..)))))).(((((........)))))..(((((((((.((((((((..((.(((......(((.......)))......))).)).....)))))))).)))))))))(((.....)))...)))))))))....((.....))...(((((...))))).))).....)).))))).))...........)))).)))))..))).)))(((..(((...((((..........))))...)))..)))....((((((.(((((..((((.((((((((..((.((((((((((((.(((..((.(((....))).))..))).)....((((((......))).))).))))))))))).)).))))).............((((((...))))))(((((......(((((.....)))))...))))))))))))..(((....)))...............((((((.((((......))))))))))....))))).)))))).......))))))))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,{.((((.((...{(({..,{(,{(((.(((((..{(((.,{{..,,,|.)).}}.)))))|||{{.((({{{.{,.{{.({{(,..(((.(((((((((.........((((((.(((...(((((((...(((....)))...)))))))..)))..)))))).)))))).))).))),,{{..,(({{((......,..))))}}}}}}.{||||}..|(((......,}}...,{,||....{,,{|{{((,.{,.,.....,,,|,||,.|({((((((((({{((((....{((,(((.....,}}}.))|{{{.|||||,,...,|||||||||..,{,|||((((({{.({,{{{.{(((,,.....,|}||(((((,((({.(({({({,,.|,|{|||,|,.....).))))},.,...||((((,,(((((.,..{.(((((......))))),},.,.})))))))}},,}|||||..........((((....))))(((((.(((((,((((((((((,{{,(,.......,((({....|}}}},{{,....,)))).,.......((((((.(((.((.((........)).))}))}))))))((((((((...((((.((((((...((....}).)))))).((((.(((((((....)))))))..))))......))))....))))))))...)))))))))),}.((((.....)}.)).,.,(((((((.(((.(({.((((..(((((,{..((((....))))..,)))))..)))).).)).)))..{((((......))))}((((((({{{((..((((,{((((((.....))))))),.))))...)))))))))))..((((,.....(((........)))...|||.,,...{{{,,.{((((.,(({(({,,,,.....{{{{{|,,..,,,......}})))},....{((((......))))}..,,{((|...,,,,,))))}.)))}}))}..,((((((((((..(((((((((((((....))))))))).))))....{.((((...)))).})))).)))))))))))(((..((((((....))))))..)))((((((((.........)))))))).((((.(((((((((((..,,(((.,.((((.....))))....))}.,}.))).....((((((.(((.{(..((({..(((..........)))..))))......)).))).)))))).)))))))).))))...)))))})})...)))))))))).|||}}}}}}|||||||.,..,||..,|}|||,.,,}|||.}|}||||||..,}))),))})},}))||,|},({{,{{{||,,.,,.........||||}}}}}..}}))),)||{((((.((((((..(,.(((.((((((..(((((.(((.{{,........,}|.(((((....))))),)))..))).))..)))))))))..),.))))))))))))))))))))}.))))},.||,,.{{({,((.,.,,,,.},))))),,},}}...(((({,,,,,,..}}}}}..(((((((((.((((((((..,{.{{{......,(({{,,,{|},,...,..))).)).,,..)))))))).)))))))))|||}}}}})))..}))))}})}}|||.{{,....,...,|||.,.|}|||((.((((({{.{{{.||||,,|{{{{{..,.,,..||{{{|||,...{,,(((((.{((({,.||||...,{{....||,..,||....))}....,,}|))))}}.|||||||.{||{{(((..{({{(((((((((({.(((,.((,(({,,.,)},.}}..)}},),,.,|{{{({......))).})).))))))))))).,,.))))}.......,.,,,,||{,||...}))))))||}|......||||,}}}.})))))}.))))))).,)}))}}}}},,..,||||......,|||.{.((((((.((((......)))))))))).}.}))||{.....,},.....,}),)}}))}})))))),,.
Forensic Context

No forensic context available.