Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0039100
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0113290 hsa_circMACF1_082 hsa-MACF1_0071
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39816457-39838268 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39350785-39372596 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-708.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -744.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 726.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((.(((((..(((((((..(((((.(((.(((((((.(.((((((..((((.((.(((.((((((((((((((.((((......))))(((((((((.........((((((.(((...(((((((...(((....)))...)))))))..)))..)))))).)))))).)))((((......)))).((((((((((..((((((......)).))))(((......)))....(((........)))(((..((.(........).))..)))..((((..(((((((...((((((.......((((((((...(((((((.((..(((((((....))))((((.((((.((..((..((((((....((...(((((.((((.((.(((....))).))))))..)))))))((((.....))))........((((((((......((((.((..((((((((((((((....)))))))...........((((..............)))))))))))....))..))))...)))))))).(((.(.((((.....)))).)..)))..((((((.(((.((.((........)).)).)))))))))((((((((...((((.((((((...((....)).)))))).((((.(((((((....)))))))..))))......))))....)))))))).....))))))..))..)).)))).).)))...)))..)))))))))(((((((..(((((....((((....))))...)))))..)))).).)).((((.(((((......)))))(((((((((.((..((((.(((((((.....)))))))..))))...)))))))))))...)))).....)))))))).)))))).)))))))..))))...((((.......)))).........))))))).))).......(((((....(((..(((((...((((.....(((..(((((((((((.....(((((....(.(((((.((((..(((((((((....)))))))))(((((...(.(((((((.((((..(((((..(....)..)))))....))))))))))).).....((((((((.........)))))))).((((.(((((((((((....(((...((((.....))))....)))....))).....((((((.(((.((..((((..(((..........)))..))))......)).))).)))))).)))))))).))))...)))))............((((.((..((.((((((((((.....))..((((((.....(((..(.((((((....)))))).)..)))((((.((((((((((.............(((((.........))))).((((((.((((((..(..(((.((((((..(((((.(((.(((........))).(((((....))))).)))..))).))..)))))))))..)..))))))))))))))))))......)))).)))).(((((((........)))))))..))))))...)))))))).)))))))).(((((((((.((((((((..((.(((......(((.......)))......))).)).....)))))))).)))))))))(((.....)))..))))))))).)...)))))...........))))))))))).)))...))))..)))))..)))..))))).)))))))))....(((.(((..(((...((((..........))))...)))..))).)))((((((.(((((..((((.((((((((..((.((((((((((((.(((..((.(((....))).))..))).)....((((((......))).))).))))))))))).)).))))).............((((((...))))))(((((......(((((.....)))))...))))))))))))..(((....)))...............((((((.((((......))))))))))....))))).)))))).............))))).))).))..))))....)))))).)))))))).)))((..(((......)))..)).........)))))))))...)))....))))).))..))))....(.(((........)))...)....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(({,.((,({(((.{(((,,((,,((({(.(((,({{((((.{.({{{{{..||{{.{|,||({(((((((({{{.{..{{.{,|||..{||,{{(((({((,,,,,,,..((((((.(((...(((((((...(((....)))...)))))))..)))..)))))).)}}}}|,||},|||{{{(,..{(((((......,..)))))||||,.,,|({|,,|(((......}}}....{,{,....,..||{(((..{{.{........|.}}..|||{{(((((((,,((({....{((,(((.....,||}.}}||{{,((|({|....,||{||||||..{|||((((((({,.{|,|||.|{{(,,.....{|}||(((((.((({.((,({({,,.},|{|||}|,...,,),))))},.....||((((,,(((((.,..{.(((((......))))),},.,.))))))))}},})}}|},....,,,..,||||,,,,})})|||||,||{|{.((((((((((,{{,{,,...,..{((({...,||}||{{{,....,)))).}.......((((((.(((.((.((........)).))}))}))))))((((((((...({({.((((((...((....}).)))))).((((.(((((((....)))))))..))))......))))....))))))))...)))))))))}.|,({((,,,,.}|.|}....{(({(((.{{{,|{{,((((..(((((,{..((((....))))..,)))))..)))).).)).}}}..{{(((......))))}(((((((({,{{..(({{,{((((((.....))))))},.})))...}))))))))))..,(({......{{{,,.....,))}...|||.||...|||},.{((({..{{,{||,|.......,,,,||},,,}}},,,,..,}))},},,,}||{||,,.,,,))))}..}},(({{,.|{{{||||||.}},,||||,.,{(({((((({..(((((((((((((....))))))))).))))....{.((((...}}}}.,}}}}.}}))))))}})|((,.((((((....)))))).,}}|((((((((.........)))))))).((((.(((((((((((..,,(((.,.((((.....))))....))}.,}.))).....((((((.(((.{(..((({..(((..........)))..))))......)).))).)))))).)))))))).))))...))}))})}}...}}}}}||||}{{||||||||{|({{||....,}}..||||{{,..,}|||.||,||||||...,)))}))|)|,}))||{||{({({{{{{{,,.,,........,||||,,,,}..},)))})||(((((.((((((..(,.(((.((((((..(((((.(((.{{,........,}|.(((((....))))),)))..))).))..)))))))))..),.)))))))))))))))}})}},.}}))}}.}}},.{{({{((.,.,,.,.}}))))),.},}),..(((({,,,,,...)))))..(((((((((.((((((((..,{.{{{......,(({{,,,{|},,...,..))).)).,,..)))))))).)))))))))|||}}}}})))..}))))))))}}}}.||,,...,....|||.||))))}||,{((((...,|,.)}}),,|.,|||........{{{({{||,.,,{{,(((((.{((({,.|{{{...,{{....}}}..,||....))}.,,,,|||})))}}.|}}||||.{{|{((((..{({{(((((((((({.(((,.((,(({,,.,)},.}}..)}}.),,.,|{{(({......))).})).))))))))))).,,.))))}.......,.,,,,||{{||...)))))}||||||..,..||||{,}}.}))))},.})})))),}},}}}}|||....,||{{......,|}|.,.((((((.((((......)))))))))).|,||}|((,{||||,,......|||,,,|}}}}.}}}..},,||||.,|.}}}}}}.}}})}}}).}))|,..|||},}},.}},..))..,,,,...}}))}})))}},),....,))))}.}),,)})),...|.{{|}.,,.,..})),..),},}
Forensic Context

No forensic context available.