Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0046800
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0011837 hsa_circMACF1_108 hsa-MACF1_0048
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39851106-39854330 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39385434-39388658 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-624.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -663.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 499.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((.((....(((..(((...((........(((((..((......))..)))))((((((((((.((((((((((((....)))(((((.(.........).))))).(((((.((((((((((((.......((((((((((((((((....(((((....((((((((((....(((((.((....)))))))(((((.((.......))...)))))..(..((((((......))))))..).))))))..)))).)))))...))))))))..)))..))))).......(((((...))))).(((((......))))).......(((((.(.((((..(((((...((..(((((.......(((((..((.((.(((.(((....))).))).)).)).)))))...)))))..))...)))))..(((((.(((((((.......((((((((((.((((((((...))))))))..((.....))...........((..(((((((((..(((((((((((((((((((((.........((((((((((..((((((((.............)))))..........(((((((((((.....))))))).))))...))))))))))).))((((....((((.(((....))).))))..(((.((((((.(((.......))).))))))..))).((.(..((((((((((.(((.(((...(((.((...((((...((((((((...((((....))))((((((.....((...))...))))))..........(((((.....(((((((........))))))).)))))..((((((((..((((.(((((((..((....))..))))))).)))).....................))))))))((..(.((((........))))).))))))))))..))))......))..)))...))).))).))))))))))..).)).)))).))))))).............))))))).(((((((.((...((((((........))))))..))...)))))))......((((......)))).....)).)))))......))))))))).))........((((((..........))))))))))))..))))..)))))))...))))).................((((.....)))).....))))..).))))).)))))))))))))))))...((((((((((.......((((..((.(((...)))))..))))...))))))))))..((((((((((((((...)))))))))..)))))..))))))))).)))..)))))))((((....))))..((((((...((((((..(...((((.(((((((((((.....((((.....((((.((((..(........)..)))).))))...)))).....)))))........(((((((.((((((((((....((((((...))))))..))))))).(((.(((...(.(((.((.(((((.((((((........)).)))).)).))))).))).)...))).)))...(((((((.(((((.....(((((((.((((((...((((.((((..((((((((...))))).)))....)))))))).......))))))..))))))).((((.((((....)))).))))..((((((......)))...)))...........((.(((.....))).))))))).)))))))..))).))).)))).((((((.....))))))....(((((......)))))...)))))).)))).)..))))))..)))))).(((((........))))).))...)))....)))....)).....)))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{..((((((..{...,,(({((,.{{..,,..,.)).(((((..((.....,),..)))))((((((((({.((((((((((((....)))(((((.,.........).))))).(((((.((((((((((((..,,,..((((((((((((((((((..{((((....((((((((((,...{(({{{,{.,..,,))},,(((((.((.......))...)))))..,..((((((......)))))),,).)))))}..)))).))))))),}))))))),.,))..})))}.{{{{..(((((...))))).,||||......}|}||.....,|{,{{{|{{({{{,,{||||,|,{{..{{|||,..,,,,(({{,..{({((,{{,.(((.,,,|||{|}}{||,|}.||||}...,}))),.}),},)))))..||{{{,||{{{{{,|,,,..{{{{||||||.{(((((({...}))))))|,,((,..,,,,..||||,|.,|{{||((((({({{|,(((((({((((((((((((((.........{{((((((({,,(((((({{.,......,..,,))))}..........(((((((((((.....))))))).))))...||}}))))))).}}({{(..,.((((.(((....))).))))..{({.((((((.((({....},))).))))))..))}.((.(..((((((((((.(((.(((...(((.((...((((...((((((((...,{((....))||((((((.....{{...})...)))))),.........(((((.....(((((((........))))))).)))))..{(((((({..((((.(((((((,.((....)).,))))))).)))).............,.......)))))))}{{..{.{{{{,,,.....))))).))))))))))..))))......))..)))...))).))).))))))))))..).)).)))}.))))))).............))))))).((((((({({...((((((........))))))..},,},}))))))......((((......))))....,)),})))),,,..,)}))))))).||,,......((((({.{,...,...))))))}))))},,}})}.|}}}}}},...})}||................,((((...,.)))}...,.,)}},}),)),)),)))))))))))))))))...((((((((((.,.....((((..(,{(((...)))))..))))..,))))))))))..{(((((((((((((...)))))))))..))))}..))))))))).}))..))))))){{(,,,,.,}||,||}|||,,.{(((((((.({,.((((.(({{,||||||....(((((((...{{...||...))).)))).{{{{|||{{|,||...|,....|..|(({({{{..,{{(({{{(({((.(((((((,,,.((((((...))))))..}}))}}).{{{,{,,...,.(((,{{{((((,.{,||||}}}}},.,}},},))})).}))))}))}|||..,}}.})).,,(((((((.((((({{(({{{{((((.((((((...((((.((((..((((((((...))))).)))....)))))))}.......))))))..)))))))))))|.{{{{....}}||{||....,((((,......|||{..,,,..}}}}.....,|}}}|...}}))),}}})))).))))))}.}}}},,}},}}||,(((((({...|)))))),}..{{{|{.....,))})).})))))))}).||..((..((((((....)))))))..)).}}.,))))))..}})))})}...}}}},.}},.,..)))))),,......,
Forensic Context

No forensic context available.