Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0057700
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0113310 hsa_circMACF1_121 hsa-MACF1_0110
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39898207-39914435 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39432535-39448763 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-829.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -884.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 748.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((.(((((...(((...(((((((((((..((((((...........((((.(((((.(((((((..(((.....)))..))))).......(((((((((((((((((.(((((.(((.((((((((.(((............))))))))))).))).))))).)).))).((((....(((..((((..((((((((((.........((((...))))....((((...))))......((((((((.((..((.((((....((((.(((.....((..(((..((((.((((((((..((.(((((((...(((....)))...)))....)))).))..)))).((((..((((.((((.(.((.......)).)))))..))))))))(((((.....))).)).)))))))).))))).....))).))))....)))).))..))))))))))........))))..............(((....))).)))))).((..(((........)))..)).(((((..((((((..(((......(((((..(((...........)))((.......)).((..((((((..(((((....(((((.....).))))((((((((.............(((.((.((((.........)))).)).)))))).))))).(((((...))))).)))))..)))))).))..(((((((.(((.((((..(.....)..))))..)).).)))))))......(((((((((...((.(((((((....((((.....(((((.((((((...((((.((.......)).))))...))....))))))))))))).......))))))).))......((((((......))))))....))))))))))))))(((((((((((..((((..(....)..))))............)))))))))))....((((((((..((((((((((..((((((((((.(((((..................))))).....((((((..(((..((((((((((((((.((..(((((((..((((..(((.((.....(((..((((((((............)))))))))))....)).)))..))))..((((.(((..((.(((((.......)))))))..)))....))))....(((......)))........))))).)).)).)))))))))))....)))...)))..))))))......(((.................))).....))))))))))..)))))))))).))))....)))).((((((.(.((.((......)))).)))))))))).))))))..)))))(((((.((((((((((..((((........))))....))).......((((((.......((((((.(((.((......))...)))..))))))......((((((....(((((((.......(((.(....))).).......))))))).......))).)))...)))))).......(((((......(((((((.(........)))))..)))......)))))(((((((.....)))))))))))))).))))).))))..)))...))))(((((((....)))))))......((((........)))).....(((.....))).(((......)))..))))))))))))..(((((((.(((..........))).)))))))......)))))))))))(((((...((((....((((..((((.(((((((((......((((((........))))))..)))))))))))))((((((((.((..(((((((((.....)))))))........(((((..((.(((((....)))))..))..))))).....))..)).))))))))))))....))))...)))))(((((((..((.((((....(((..((((((((((((((((..((((.(((((.(((.(((((.....((((((((((...(((((.....(((((..((((..(((..(((...)))...)))))))..))))).((((....)))).(((((((((((..((((((.(((..((.((.((((((..((((.........)))).)))))))).)).)))..))))))..)))(((..((((..((.(((..((((..........(((((...((((((...(((........))).......))))))(((((.......))))).......))))).(((((.((...))))))).....))))))).))))))...)))............))))))))((((((...((.(((((.......((((((.....))))))))))).))..((((((.((...)).)))).))...))))))))))).....))))))))))......))))).))).))))).((((....(((((((..(((.(....((((.....))))).)))..)))))))....))))....)))).((((.....))))(((((..(((((.........(((((.......)))))....))).))..)))))....))))))))))))....)))).)))....)))).))..))))).)).................))))))..)))))))....(((((((....))))))))))).))).))))).))))))((.(.(((((.......((..(((....)))..))......(((((((((((..((((.(((((....))))).))))....)).)))).)))))((((((((....))))))))........)))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..,,...((((....)|}}..,,.((((((((((((.,.........,,..(((,(((.((({(((((..(((.....)))..)))))))))))}}}.||||{|,|.(((((.(((((.{((,((((((((.{{{.,,.......,.))})))))))).))).))))).)).)))..,}}|}.{((..((((.....((((((((.,,......((((((({.{({....,,,...,))),))))))))......,..(({,,,{(,,..((((((((((.(.{{,..((((((.....))))))..((.(((({((,..(((....}))...))),,,.)))).)).,)),,))))))))))....,,.,)))..,,,,.}}...)),..))))))))))))..)))..}.)))))))))))),}{{{...((((...{{.((((((..{,,...,}}))))))...,,....))))...}}}........,.....})),((((((({((............((((.....}))),...(((((.........))))}....((...{{{({.((((.((({......{{.((..((((((..(((((....(((((....,|||))){((({{{({{{......}}},|{{.,{||{|{,........}))),)}.)))))).))))).(((({...})))).)))}).,))))}),)).}|,((((((.(({({{,.,}}}....}}))))..||,|,}|||||}.....{(((((((((...{{.,{{,,,,....,((({(({{((((({{{{{(({{{({((,((....,,.}}.})))...)).,,.}})))))),}).,..,}}},},)))))}))......((((((......))))))....)))))))))).((((((((..((((.(((.(((((......((((((({...}))))))),(((({{{(,..{(,(((((..,|||||.||,..,|{|{|{{,,,|,))).,,,...}}},.},,,.,|||}}|,}..{{{{,,..,))),.))))).))).))))))))))))..((((.((,,(((((((..((((((.((((((((..,.......,.))))))))((.{(.(((((((((((((({({((.((.(((({,,,,,.{{{{{{|{{.|((((((.....,(((,.{{(({.{{{{..,...((((((((.(......}.))))))))......})))...{{((((((.{......{(({........,,,..((.((((.(((.((((,((.((.((((((..(((((((((({(((.(((((.(((((((({,......,{((({((((.((((.({{{{,,....{((((((.{{{{{,{({,..((({.......,)))}....}}}..{,,,,,|.|||,..,..}}}|)}|.}}})))).....}).}.)).}}}}).))))))}|(((((({..,(((((((.......,{{.{{,.,|}}.|.....,.}})}))}...,,,..,,.,}},,,,,.,}},..}}}},}}||,....,,(((((((.....))))))),,..,{{......|,...,{{({(,,....))))))))))))))}}.))))))))){{{.,...,},(((((((....)))))))...))))))}}))).)))))))).)).{((.....|||.(((......))).,,...,,}})))).))).))))}).,},))}......}.))))))))}))},}},..)))))).).}}}.)))))}..{(((((((((((.(((((((({.....,((((((........)))))),,)))))))))))))((((((((.((..((..(((((,,,,{|.,||||.......,||{{(..((.(((((....)))))..))..))))})))))))..)).)))))))),{{{{{.,{{.{,{|,|||{||||,|}..}},}},|....,,|.)))))))}(((((((((.{((({.(((((.(((.(((((.....((((((((((...(((((.....{{{({..{(((.,(((..(((...)))...))))}))..})}}}.{(({....,))}.{((((((((((..((((((,(((..(({,,.((((((..((((.,,...,,.)))).)))))),,.,)}),)},))))))..)))(((.{((((..((,{({..((((...........,{{....((((((,..(((........)))..,....)))))){((((.......))))).....,,|}|||{.{{{{.,,.}})},})))}....))))))).}})))),}.)))............)))))))}((((((...((.(((((.......((((((.....))))))))))).)),,{{((((.{(...)}.)))).))...)))))))}}}}.....))))))))))......))))).))).))))).{(({....{{{((((,,{,({{.(..({((,,,{{|}|,.,|},..))}})}}}}},)))).,..)}))},|||,,,,.}},|(((,(..,,|,|}},......(((((.......)))))....}}}.}}..}})))}...)))))))))({(((...,,)}))).......,.....))))).)).)).}}......)))))))))))))).}}.))...((((((({....})))))))))))))...)))))))))).))))..,..........|}}}||,.}}})),........,.(((((((((((..((((.(((({....})))).))))....)).)))).))))).|...})))))))))))),,.)).))).))))).)).
Forensic Context

No forensic context available.