Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0001700
Sequence Length
441 nt
GC Content
0.5057
GACUGGAAUGUCACGUGGAAUACCAGCAACCCCGACUUCACCAAGUGCUUUCAGAACACGGUCCUCGUGUGGGUGCCUUGUUUUUACCUCUGGGCCUGUUUCCCCUUCUACUUCCUCUAUCUCUCCCGACAUGACCGAGGCUACAUUCAGAUGACACCUCUCAACAAAACCAAAACUGCCUUGGGAUUUUUGCUGUGGAUCGUCUGCUGGGCAGACCUCUUCUACUCUUUCUGGGAAAGAAGUCGGGGCAUAUUCCUGGCCCCAGUGUUUCUGGUCAGCCCAACUCUCUUGGGCAUCACCAUGCUGCUUGCUACCUUUUUAAUUCAGCUGGAGAGGAGGAAGGGAGUUCAGUCUUCAGGGAUCAUGCUCACUUUCUGGCUGGUAGCCCUAGUGUGUGCCCUAGCCAUCCUGAGAUCCAAAAUUAUGACAGCCUUAAAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-121.51 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -130.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 128.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((..(((.....((((.....((((.................))))...((((((.(((.(((....))).))).))))))...(((((((.(((....(((((((...((((((.(((.(((((......(((((((....................................)))))))..........(((((..((((((...))))))....)))))......))))).))).(((((((.....))))))).((((.....))))...((((((.....))))))....(((.((((..(............)..))))))))))))))))))))....))).).))))))......((((.....(((((((..((.(......).)).)))))))...)))).))))....)))..))))(((....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((..(((.....((((.....,((,.{{{.,{,,..,,,,,|}|,....,,,((({({|.,,|}},,))),))}.})},,....({(((((.(((..,,(((((({..,((((((.,{{.{(({{,...{{(((((((..,.....,,{{,..,,.,.||..,,..,,,,....}},))))...,.,,,..{{{{{..((((((...))))))....)))}}{{,,,{.}})),))).|||((((,.....,,}})),||{{.....)}))},,((((((.....))))))....(((.((((..{............}..)))))))))))))))))))),}..))).}}})))))......{{({.....(((((((..((.{....}.).)).)))))))...)))).))))....)))..))))(((....)))
Back