Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0002000
Sequence Length
761 nt
GC Content
0.5191
GACUGGAAUGUCACGUGGAAUACCAGCAACCCCGACUUCACCAAGUGCUUUCAGAACACGGUCCUCGUGUGGGUGCCUUGUUUUUACCUCUGGGCCUGUUUCCCCUUCUACUUCCUCUAUCUCUCCCGACAUGACCGAGGCUACAUUCAGAUGACACCUCUCAACAAAACCAAAACUGCCUUGGGAUUUUUGCUGUGGAUCGUCUGCUGGGCAGACCUCUUCUACUCUUUCUGGGAAAGAAGUCGGGGCAUAUUCCUGGCCCCAGUGUUUCUGGUCAGCCCAACUCUCUUGGGCAUCACCAUGCUGCUUGCUACCUUUUUAAUUCAGCUGGAGAGGAGGAAGGGAGUUCAGUCUUCAGGGAUCAUGCUCACUUUCUGGCUGGUAGCCCUAGUGUGUGCCCUAGCCAUCCUGAGAUCCAAAAUUAUGACAGCCUUAAAAGAGGAUGCCCAGGUGGACCUGUUUCGUGACAUCACUUUCUACGUCUACUUUUCCCUCUUACUCAUUCAGCUCGUCUUGUCCUGUUUCUCAGAUCGCUCACCCCUGUUCUCGGAAACCAUCCACGACCCUAAUCCCUGCCCAGAGUCCAGCGCUUCCUUCCUGUCGAGGAUCACCUUCUGGUGGAUCACAGGGUUGAUUGUCCGGGGCUACCGCCAGCCCCUGGAGGGCAGUGACCUCUGGUCCUUAAACAAGGAGGACACGUCGGAACAAGUCGUGCCUGUUUUGGUAAAGAACUGGAAGAAGGAAUGCGCCAAGACUAGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-232.31 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -244.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 184.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((...((((...((((((...((...(((((((((...(((((......(((((.(((((....(((((.((...)).)))))....)))))))))).......)))))..........(((((......(((((((....................................)))))))..........(((((..((((((...))))))....)))))......)))))..))))))))))).)))))))))).))))).(((((((((.((.((.((.(((((((((((((...((((((.(((.((((((((.......))))))))((((((.((((...((((....))))...)))).))))))))).))))))....))).)))))).(((.(((.(((((..((....((.((((((.....((((((......((((((((.......(((....))).......))))))))...)))))).........))).))).))...))..)))))))).)))....((.((((((.(((((....((((((........((......))(((.(((..((((((.(((.((((((((((....)))).....(((((((.(((((((((((((......))))))....))))))))))).)))))))))..))).))))))..))).)))....))))))...))))).)...))))).)))))).))..)).))...)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((...((((...((((((...{,..{(((((((((..,{((,(,...,.{{(((,(({,{.}|,|||||.||},,),.,,,,}....|||}}}},,,.}},...,,,,,..........(((({....,,(((((((.........,||........,,..............))))))).......,..(((((..((((((...))))))....))))).,....,))))..))))))))))}.)))))))))).))))).(((((((((.((,((.,{,{({{((((({(((...((((({.(((.((((((({.......)))))))){((((({((((...((({....}))}...)))).))))))))).})))))....))).)))))).(((.((,{(((((..((..,.,,.((((((.....((((((......((((((((.,,....(((....))).....,.))))))))...)))))).........))).))).,),..))..)))))))).)))....({.((((({.(((({....((((((.....,,.||.....,,|{({.(((..((((((,(((.((((((((((....)))).....((((({(.(((((((((((((......))))))....)))))))}))),)))}})}}}..}}}.))))))..))).))}....))))))..}))))).)...))))).)))}))}))..}).))...)))))))))
Back