Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0007900
Sequence Length
858 nt
GC Content
0.5478
AAUCCCUGCCCAGAGUCCAGCGCUUCCUUCCUGUCGAGGAUCACCUUCUGGUGGAUCACAGGGUUGAUUGUCCGGGGCUACCGCCAGCCCCUGGAGGGCAGUGACCUCUGGUCCUUAAACAAGGAGGACACGUCGGAACAAGUCGUGCCUGUUUUGGUAAAGAACUGGAAGAAGGAAUGCGCCAAGACUAGGAAGCAGCCGGUGAAGGUUGUGUACUCCUCCAAGGAUCCUGCCCAGCCGAAAGAGAGUUCCAAGGUGGAUGCGAAUGAGGAGGUGGAGGCUUUGAUCGUCAAGUCCCCACAGAAGGAGUGGAACCCCUCUCUGUUUAAGGUGUUAUACAAGACCUUUGGGCCCUACUUCCUCAUGAGCUUCUUCUUCAAGGCCAUCCACGACCUGAUGAUGUUUUCCGGGCCGCAGAUCUUAAAGUUGCUCAUCAAGUUCGUGAAUGACACGAAGGCCCCAGACUGGCAGGGCUACUUCUACACCGUGCUGCUGUUUGUCACUGCCUGCCUGCAGACCCUCGUGCUGCACCAGUACUUCCACAUCUGCUUCGUCAGUGGCAUGAGGAUCAAGACCGCUGUCAUUGGGGCUGUCUAUCGGAAGGCCCUGGUGAUCACCAAUUCAGCCAGAAAAUCCUCCACGGUCGGGGAGAUUGUCAACCUCAUGUCUGUGGACGCUCAGAGGUUCAUGGACUUGGCCACGUACAUUAACAUGAUCUGGUCAGCCCCCCUGCAAGUCAUCCUUGCUCUCUACCUCCUGUGGCUGAAUCUGGGCCCUUCCGUCCUGGCUGGAGUGGCGGUGAUGGUCCUCAUGGUGCCCGUCAAUGCUGUGAUGGCGAUGAAGACCAAGACGUAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-305.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -321.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 222.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((.((((((.((((.....))))...((((((.((...(((((....))))).)))))))).......(((((((((......)))))).))))))))).))..)(((((((((....))))(((.((((.(.......).)))))))((((((((..(((..((((((..((......))..(((.....(((((((((((.(((..(((...((((...))))(((((((..((((((.(((((.((((...)))).((..((((((((((((.((((((((...))))......(((((..(((.((...))))))))))..(((((.((....)).)))))..))))))))))))))))..))))))).)))..)))((((........))))..((((...(((((((((.........))))........((((((.....))))))))))).)))).))))))).))).))).))))).))))))....)))((((..(((..(((........))).))).)))).))))))..))).(((((((.(((.(((((((((((..((((((((((((((((((.(((...))).))))))))))))..((((((((((((((.((((((((......)))).)))).))........((((((((((........))))))))))(((((((.((.(((....))))).))))))).......(((((.....))))).............))))))))).)))((((..((.....))..)).))))))))..))))))))))).)))((((((......)))))).)))))))))))))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.,{.((({((.,{(({..,{|||{{,,((((,{.,|}||{((((....))))},}}}}))}|{{|{{,,(({((((((......)))))).}}})))}})|||,.}{{{{(((((....})))|{{.((((.(.......).)))))}|((((((((..{{{.,({{{,{.}|{...,,})},.|||.||}.(((((((((((.(((..({(...((((...)))).((((((..(((,,{,((({,.{((,...}))|.((..((((((((((((.((((({((...}},,,,....(((((,(({(.{{...,)))})))))..{((((.({....}).))))).}))))))))))))))))..)),)))}})),..)))((((........))))..{{{{...(((((((({.........})))........((((((.....))))))))))).})}).)))))))},)).})).))))).))))))....)))||||},|,|..((({{.....{|{|{|,,.))))}),}}}}..))),{((((((.(((.(((((((((((..((((({((((((((((((.(((...))).)))))))))))),.{{{.(((((((((,..,((,,(({{{{..||||{||,,...........((((((((((........)))))))))){((((((.((.(((....))))).))))))}.......(((((.....))))),,}},.}}..}}}))),,)),,.|||{{....||},.))))))))),)))))))..))))))))))).)))((((((......)))))).)))))))}}}}}))),.,})))
Back