Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0008100
Sequence Length
1297 nt
GC Content
0.5466
AAUCCCUGCCCAGAGUCCAGCGCUUCCUUCCUGUCGAGGAUCACCUUCUGGUGGAUCACAGGGUUGAUUGUCCGGGGCUACCGCCAGCCCCUGGAGGGCAGUGACCUCUGGUCCUUAAACAAGGAGGACACGUCGGAACAAGUCGUGCCUGUUUUGGUAAAGAACUGGAAGAAGGAAUGCGCCAAGACUAGGAAGCAGCCGGUGAAGGUUGUGUACUCCUCCAAGGAUCCUGCCCAGCCGAAAGAGAGUUCCAAGGUGGAUGCGAAUGAGGAGGUGGAGGCUUUGAUCGUCAAGUCCCCACAGAAGGAGUGGAACCCCUCUCUGUUUAAGGUGUUAUACAAGACCUUUGGGCCCUACUUCCUCAUGAGCUUCUUCUUCAAGGCCAUCCACGACCUGAUGAUGUUUUCCGGGCCGCAGAUCUUAAAGUUGCUCAUCAAGUUCGUGAAUGACACGAAGGCCCCAGACUGGCAGGGCUACUUCUACACCGUGCUGCUGUUUGUCACUGCCUGCCUGCAGACCCUCGUGCUGCACCAGUACUUCCACAUCUGCUUCGUCAGUGGCAUGAGGAUCAAGACCGCUGUCAUUGGGGCUGUCUAUCGGAAGGCCCUGGUGAUCACCAAUUCAGCCAGAAAAUCCUCCACGGUCGGGGAGAUUGUCAACCUCAUGUCUGUGGACGCUCAGAGGUUCAUGGACUUGGCCACGUACAUUAACAUGAUCUGGUCAGCCCCCCUGCAAGUCAUCCUUGCUCUCUACCUCCUGUGGCUGAAUCUGGGCCCUUCCGUCCUGGCUGGAGUGGCGGUGAUGGUCCUCAUGGUGCCCGUCAAUGCUGUGAUGGCGAUGAAGACCAAGACGUAUCAGGUGGCCCACAUGAAGAGCAAAGACAAUCGGAUCAAGCUGAUGAACGAAAUUCUCAAUGGGAUCAAAGUGCUAAAGCUUUAUGCCUGGGAGCUGGCAUUCAAGGACAAGGUGCUGGCCAUCAGGCAGGAGGAGCUGAAGGUGCUGAAGAAGUCUGCCUACCUGUCAGCCGUGGGCACCUUCACCUGGGUCUGCACGCCCUUUCUGGUGGCCUUGUGCACAUUUGCCGUCUACGUGACCAUUGACGAGAACAACAUCCUGGAUGCCCAGACAGCCUUCGUGUCUUUGGCCUUGUUCAACAUCCUCCGGUUUCCCCUGAACAUUCUCCCCAUGGUCAUCAGCAGCAUCGUGCAGGCGAGUGUCUCCCUCAAACGCCUGAGGAUCUUUCUCUCCCAUGAGGAGCUGGAACCUGACAGCAUCGAGCGACGGCCUGUCAAAGACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-463.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -485.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 426.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((..((((..(((((((((((((((.((...(((((....))))).))))))((((.(((((((((((((......))))))....)))))))))))((((((.(((...((((((((.((((.(.......).))))))).)))))...))).)))))).))))))).))))...)))).))..))))..)).(((((((((...((((((...(.((((.(((.((((......).)))....))))))).)....))))))(((((((((((((.....((((...((..((.(((((((..(((..........(((((.((....)).))))).)))..))))))).)).)).)))).....)))))))).))))).....((((.(((((((.((((.((..........)).)))).........(((((((.(((.(((((((((((..((((((((.((..(..((...))..)..))..))).))))).((.(((((((((..((((((...)))))).....((((((...((((.(((.(((((((((((..((((((((((((((((((.(((...))).))))))))))))..((((((((((((((.((((((((......)))).)))).))........((((((((((........))))))))))(((((((.((.(((....))))).))))))).......(((((.....))))).............))))))))).)))((((..((.....))..)).))))))))..))))))))))).)))((((((......)))))).............))))...)))))).((((..(((.(((........(((((......)))))........)))))).)))).....((((((..((((((.(((((((..(((((((((.........)))))))))..)))))))...))))))...))))))...((((..(((((((.........))))))).))))....))))))))).))....))))).)))))))))..))))))).(((.....))).......))))))).))))((((....))))))))))))).(((((((((((((((((...((((((.(((.......((((((((.((.(((((((.......).))))))..)).)))))).))........))).))))))..(((((......)))))((((........))))...)))))).))))....)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,{{(((({(..((((..((((((((((({{,(,.{{({(((((....))))}})),|||(({(.(((((((((((((......))))))....)))))))})))||||(({(((...,|||}|((.((((.(.......).)))))}),||||},,.,}}.,)),)).))))))).))))...)))).})..||||{,,,,{{,||||||.,..|||{,,.||||{.{|||.,.{{{{...{{{,{{{{..{((.(((.((..((((((((((((.((((({((...}}},,,....(((((,((((.({...})))})))))..{((((.({....}).))))).}))))))))))))))))..)).},,.,,,{(((((({,,(({({,,{(((({.{{,,|..{{{{.{{,|.,}}...,|,,}|||}}}}.}.}}|||.,.({(((((((((..(((({.(((((,((..,..,..,...}}.}})}}))}})|{{{((||.{,.,(((((,....((((((...)))))).....,,||||}..{|{|}||||(((((((((((..((((({((((((((((((.(((...))).)))))))))))),.{{{.(((((((((,..,((,,(({{{{..||||{||,,...........((((((((((........)))))))))){((((((.((.(((....))))).))))))}.......(((((.....))))),}}},.}}..}}}))),,)).,.|||{{....||},.))))))))),)))))))..))))))))))),|,|,((((({{{.,{||||||{{{{{.,{,{|..|,,|...||||||,(((({.{{.{(((,...{.,.{{{{(,,,...}|||},,......)))))).)}}),}}..,{||||...|||||.(((((((..(((((((({,........)))))))))..))))))).,,}},|||{{{|||||,|{.,.,,,}||},,}}}}.,}))),))))))),)),}},}}))))))|||{||{{,..,,)).))),,,)))}.}},})))}|||.}}}.,..}})))))),).,)......((((....)))),,,)))))))}|||,{||||||||,,,...,{{{{{.{||.,,,,,,||{{{{||,|{.{{{||||....,,,).)))}}),,)).))}|||,|,,,,{{...}}},))))}}..{((((......)))))|{{|,,...,,,}})}.,,}}}}}}.}))),},}},))))}
Back