Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0010200
Sequence Length
409 nt
GC Content
0.5379
GCAGCCGGUGAAGGUUGUGUACUCCUCCAAGGAUCCUGCCCAGCCGAAAGAGAGUUCCAAGGUGGAUGCGAAUGAGGAGGUGGAGGCUUUGAUCGUCAAGUCCCCACAGAAGGAGUGGAACCCCUCUCUGUUUAAGGUGUUAUACAAGACCUUUGGGCCCUACUUCCUCAUGAGCUUCUUCUUCAAGGCCAUCCACGACCUGAUGAUGUUUUCCGGGCCGCAGAUCUUAAAGUUGCUCAUCAAGUUCGUGAAUGACACGAAGGCCCCAGACUGGCAGGGCUACUUCUACACCGUGCUGCUGUUUGUCACUGCCUGCCUGCAGACCCUCGUGCUGCACCAGUACUUCCACAUCUGCUUCGUCAGUGGCAUGAGGAUCAAGACCGCUGUCAUUGGGGCUGUCUAUCGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-134.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -140.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 68.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..((.(((.........))).)).))...))))(...((((.(((.(((((((((((((..((..((((((((((((.((((((((...))))......(((((..(((.((...))))))))))..(((((.((....)).)))))..))))))))))))))))..)).(((((((((..(((((..((((...((((.((......(((((((((.........))))........((((((.....)))))))))))(((((.(((((.((............)).))))))))))...((((......))))......((((((...))))))...))))))....))))..))))).))))))...))))))))....)))))))).))).))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((..{(.(((.........))).)}.))...))))(...((((.(((.(((((((((((((..((..((((((((((((.((((({((...}},,,,....(((((,(({(.{{...,)))})))))..{((((.({....}).))))).}))))))))))))))))..)).{{,((((((..(((((..((((...({{(,{(,.....(((((((({.........})))........((((((.....)))))))))))(((((.(((((.((............)).))))))))))...((((......))))......((((((...))))))...,}))))....))))..))))).))))))...}},)))))....)))))))).))).))))..)
Back