Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ABCC1_0012300

Sequence Length

532 nt

GC Content

0.5508

AAUCUGGGCCCUUCCGUCCUGGCUGGAGUGGCGGUGAUGGUCCUCAUGGUGCCCGUCAAUGCUGUGAUGGCGAUGAAGACCAAGACGUAUCAGGUGGCCCACAUGAAGAGCAAAGACAAUCGGAUCAAGCUGAUGAACGAAAUUCUCAAUGGGAUCAAAGUGCUAAAGCUUUAUGCCUGGGAGCUGGCAUUCAAGGACAAGGUGCUGGCCAUCAGGCAGGAGGAGCUGAAGGUGCUGAAGAAGUCUGCCUACCUGUCAGCCGUGGGCACCUUCACCUGGGUCUGCACGCCCUUUCUGGUGGCCUUGUGCACAUUUGCCGUCUACGUGACCAUUGACGAGAACAACAUCCUGGAUGCCCAGACAGCCUUCGUGUCUUUGGCCUUGUUCAACAUCCUCCGGUUUCCCCUGAACAUUCUCCCCAUGGUCAUCAGCAGCAUCGUGCAGGCGAGUGUCUCCCUCAAACGCCUGAGGAUCUUUCUCUCCCAUGAGGAGCUGGAACCUGACAGCAUCGAGCGACGGCCUGUCAAAGACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-175.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -184.16

Frequency: 0.0000

Diversity: 209.64

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((((((((.(((.(.(.(((((((((((((((.((((.(...((((((......))))))).)))).)))))((((...(((((((((((((....(((((..((.((....((((..(.(((.(((.....)))))).)..))))....))))...))))).(((((((..(((((((((.........)))))))))..)))))))....(.(((((((((((.((.....)).))..)))).)))))))))))).....)))))))))))(((((((((....)).)))...))))....)))))).)))).).))))..)))).))).........))..))))))).....))(..((((((((((((((((...((((((.(((.......((((((((.((.(((((((.......).))))))..)).)))))).))........))).))))))..(((((......)))))((((........))))...)))))).))))....)))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

{,{(((((((,{{(((((,(({,{.,.{{|{|{|{|||(|((,((((,(.{{({((({,,,,,,|||||||.|||,.||}},,((,...{(((({(((({((,{{{(({((...,.,.,{{{(,,,...}|||},,......}|||||.,{{}||,,,{{|,,,...))))},|{|||||},((((((((({..,,,,,,|||||}|||{,|||||}|,{.,|.(((((((((((.{{.....}},}}..}))).)))))||||}|}|{||.}}}}})))))){||||{|||.,,,)),))),..}}))},..)))}}||||,|,|.,}}}..}))).)}}.....,,,}))},))))))}..,,,))|||||,,,,||||{(((((...{{{{{{.{{{......,||||{{{{.{{.|||{|||,,,..,,),))})}),.)),|||}}}.,,,,,{,...}}},))))},..,,|||..,,,,)))))((((........))))...}))})).)))),,,,,,})))}