Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0014900
Sequence Length
548 nt
GC Content
0.5803
GCGGGGGCACGAACAGCAUCACCGUGAGGAAUGCCACAUUCACCUGGGCCAGGAGCGACCCUCCCACACUGAAUGGCAUCACCUUCUCCAUCCCCGAAGGUGCUUUGGUGGCCGUGGUGGGCCAGGUGGGCUGCGGAAAGUCGUCCCUGCUCUCAGCCCUCUUGGCUGAGAUGGACAAAGUGGAGGGGCACGUGGCUAUCAAGGGCUCCGUGGCCUAUGUGCCACAGCAGGCCUGGAUUCAGAAUGAUUCUCUCCGAGAAAACAUCCUUUUUGGAUGUCAGCUGGAGGAACCAUAUUACAGGUCCGUGAUACAGGCCUGUGCCCUCCUCCCAGACCUGGAAAUCCUGCCCAGUGGGGAUCGGACAGAGAUUGGCGAGAAGGGCGUGAACCUGUCUGGGGGCCAGAAGCAGCGCGUGAGCCUGGCCCGGGCCGUGUACUCCAACGCUGACAUUUACCUCUUCGAUGAUCCCCUCUCAGCAGUGGAUGCCCAUGUGGGAAAACACAUCUUUGAAAAUGUGAUUGGCCCCAAGGGGAUGCUGAAGAACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-211.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -220.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 203.13
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((.((..(((.(((..(((.(((.((.....(((((((((((.....(((((((.((((...((((.(((((....(((...((((((...)))))))))....)))))))))))))((((......))))((((....((((((((.....)))))))).))))...).)))))).(((((((((.((...(((((((((((......)))))..(((((..((.((((..(((.(((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))).)))...(((((((.((...)).)))))))(((((.(((((((.((((...(((((........)))))....))).).)))).))).))))).)))))).))))))))))).)))))..))))))..)))))))))))..))))).))).))).))).......)).)))).)).)))))((((((((.....(.(((.((.(((..(((((((........))))).))..))))).))).)))))).))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
({((((((((,,.{(((.((({({,,,((,{(((({,.{{{{,,((((,,(((.....,|||||}},.,|}}}||||}}{{{{|||.,,....{{||||,,,})))))||{{{...,,,)))))))))||||}......)),||||}}}}(((((((({,,,,||||||||.||||,..{.|{|||{(((((((((({{,..{({{,|||||||}.,}}}))),}.{((((((((,..{{,..{{{.{((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))}.}}|,{{((.,,,,.}}}},,)))))))))(((((.(((((({.{(((...,((({.{{{....)))}}.|,,))).}.}))).))).))))),,,,.||,}}|}}}|||||{|..,|,,},,,}}.,)))))))))))},||||..,,,.)))}}},......}))}),),.)).)))}}|||||||,,,{{.,.{||,|{.(((..(((((((........))))).))..))))),))),,}))))},)}....,
Back