Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0015000
Sequence Length
732 nt
GC Content
0.5847
GCGGGGGCACGAACAGCAUCACCGUGAGGAAUGCCACAUUCACCUGGGCCAGGAGCGACCCUCCCACACUGAAUGGCAUCACCUUCUCCAUCCCCGAAGGUGCUUUGGUGGCCGUGGUGGGCCAGGUGGGCUGCGGAAAGUCGUCCCUGCUCUCAGCCCUCUUGGCUGAGAUGGACAAAGUGGAGGGGCACGUGGCUAUCAAGGGCUCCGUGGCCUAUGUGCCACAGCAGGCCUGGAUUCAGAAUGAUUCUCUCCGAGAAAACAUCCUUUUUGGAUGUCAGCUGGAGGAACCAUAUUACAGGUCCGUGAUACAGGCCUGUGCCCUCCUCCCAGACCUGGAAAUCCUGCCCAGUGGGGAUCGGACAGAGAUUGGCGAGAAGGGCGUGAACCUGUCUGGGGGCCAGAAGCAGCGCGUGAGCCUGGCCCGGGCCGUGUACUCCAACGCUGACAUUUACCUCUUCGAUGAUCCCCUCUCAGCAGUGGAUGCCCAUGUGGGAAAACACAUCUUUGAAAAUGUGAUUGGCCCCAAGGGGAUGCUGAAGAACAAGACGCGGAUCUUGGUCACGCACAGCAUGAGCUACUUGCCGCAGGUGGACGUCAUCAUCGUCAUGAGUGGCGGCAAGAUCUCUGAGAUGGGCUCCUACCAGGAGCUGCUGGCUCGAGACGGCGCCUUCGCUGAGUUCCUGCGUACCUAUGCCAGCACAGAGCAGGAGCAGGAUGCAGAGGAGAACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-289.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -302.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 233.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.....(((((((.((....))......((((...(((((((((((.....(((((((.((((...((((.(((((....(((...((((((...)))))))))....)))))))))))))((((......))))((((....((((((((.....)))))))).))))...).)))))).(((((((((.((...(((((((((((......)))))..(((((..((.((((..(((.(((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))).)))...(((((((.((...)).)))))))(((((.(((((((.((((...(((((........)))))....))).).)))).))).))))).)))))).))))))))))).)))))..))))))..)))))))))))..))))..((((..(((((........((......)).......)))))..))))..(((.((.(((..(((((((........))))).))..))))).))))))))))...........((.(.(((((((((.((..(((....))).((((((((.....((((.......)))).......))))))))((((...)))).(((((((...))))))))))))).)))))).))))))))))((..(((((((((.(((...((.((.....)).))...))))))))).)))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.,...(((((((.((.{,.{{.,,((({.,{{(({{(((({{(((.,....}}|||||,,,||,|||||||(((((((.........}}}))}}||||}}}||||}}}}}||||||||||{((({.....}}}}((((....((((((((.....)))))))).)))).....(((((({(({(((((,,,({.(((({,,,.})))}.}},))))).{{(((((((,,.,,,..,{{.{((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))}.}}|,{{{{..,,,.})))),)))))))))}))))))(((((.{,.(((..{((((((..{{.{({(((({..,{{,|.|||{{|,|.,|||}|{|,,|},|||||}{{{|{{{..,||||.,.,,.}))))))))}||},|{,|..,||.,}|||||.......}}}},...}))}}}}}.}),,))}.,)))).,))}},})))}...(((((........)))))..)))))))}}})})))))))..,..,,,,,.,{.{.|||||||}..||..(((....})}.((((((((...,.((((.......)))).,.....)))))))),{(({.{||.,.(((((((...))))))),}}},)})))))),},))))))))((..(((((((((.(((...((.((.....)).))...))))))))}.))),..))
Back