Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ABCC4_0026900

Sequence Length

957 nt

GC Content

0.4556

GAAAGUGCCAAAGUAAUCCAGCCCAUAUUUUUGGGAAAAAUUAUUAAUUAUUUUGAAAAUUAUGAUCCCAUGGAUUCUGUGGCUUUGAACACAGCGUACGCCUAUGCCACGGUGCUGACUUUUUGCACGCUCAUUUUGGCUAUACUGCAUCACUUAUAUUUUUAUCACGUUCAGUGUGCUGGGAUGAGGUUACGAGUAGCCAUGUGCCAUAUGAUUUAUCGGAAGGCACUUCGUCUUAGUAACAUGGCCAUGGGGAAGACAACCACAGGCCAGAUAGUCAAUCUGCUGUCCAAUGAUGUGAACAAGUUUGAUCAGGUGACAGUGUUCUUACACUUCCUGUGGGCAGGACCACUGCAGGCGAUUGCAGUGACUGCCCUACUCUGGAUGGAGAUAGGAAUAUCGUGCCUUGCUGGGAUGGCAGUUCUAAUCAUUCUCCUGCCCUUGCAAAGCUGUUUUGGGAAGUUGUUCUCAUCACUGAGGAGUAAAACUGCAACUUUCACGGAUGCCAGGAUCAGGACCAUGAAUGAAGUUAUAACUGGUAUAAGGAUAAUAAAAAUGUACGCCUGGGAAAAGUCAUUUUCAAAUCUUAUUACCAAUUUGAGAAAGAAGGAGAUUUCCAAGAUUCUGAGAAGUUCCUGCCUCAGAGGGAUGAAUUUGGCUUCAUUUUUCAGUGCAAGCAAAAUCAUCGUGUUUGUGACCUUCACCACCUACGUGCUCCUCGGCAGUGUGAUCACAGCCAGCCGCGUGUUCGUGGCAGUGACGCUGUAUGGGGCUGUGCGGCUGACGGUUACCCUCUUCUUCCCCUCAGCCAUUGAGAGGGUGUCAGAGGCAAUCGUCAGCAUCCGAAGAAUCCAGACCUUUUUGCUACUUGAUGAGAUAUCACAGCGCAACCGUCAGCUGCCGUCAGAUGGUAAAAAGAUGGUGCAUGUGCAGGAUUUUACUGCUUUUUGGGAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-303.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -321.57

Frequency: 0.0000

Diversity: 226.84

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((...((..((((((....((((......))))....))))))......(((((((((.((..(((((.((...(((((........)))))((((((((((((((...((((.........))))((.(((((((((......((((.....(((((((((((.(((((((.(((((((((((((((((....)))))..(((((...(((....)))...))))).))))))))))....(((((.((((........)).)))))))((((((......)))))).....((.(((.((....)).))).))((.(((((....)))))))....((((((...((((((((....)))))))).)))))).)).)))))))..))))))))))).))))...)))))))))))((((.((((((((((((((.(((.(((...((((....((((((((((((((....))))).........))))))))))))).))).)))..)))))....))))))..))).))))))))).)))..........)))))))))))))...)).)))))))))(((((.........))))).....))...))))(...((((((((((((((((((........(((((.((((.(((((((....)))).))))))).)))))(((...((((...)))))))..((((((.((.(((((((.(.((.(((((((((((((....))))))..))..))))))).).))))).))((((((((((..(((((....(((((((.....)))).)))....))))).)))))))))).................((((((((((.((((((.(......((((..........))))))))))).))))))))))..)).)))))))))))).......))))))))))))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

,,..,(.{({{(({{{{.,..((((......}}||....{{{.,,,|}},,,))},.}}}}...{{{{{{((((((((,((({{{{...{{({((((((((((((((({.,((((.,,...,,.))))((.((((({{((.,..,,(((,,,,..(((((((((((.(((((((,(((((((((((((((((....)))))..(((((...(((....)))...))))).)))))))))),.},(((((.((((........)).)))))))((((((......)))))).....{(.{{{.{{....}).))|,|},|.(((((....))))).},,|,((((((...((((((((....)))))))).)))))).}).)))))))..))))))))))).)))|..,)),))}))))){(({.{({(((((((((((.(((.(((...((((....((((((((((((({....})))),........))))))))))))).))).)))..)))))....))))))..})}.})))))))),,))..........))))))),})|||}}}))}}|(((({{{(.,........}}}))))),.,,,({{.,,,)))....,((((((.,{,..,,.,))))))}.(((((.(((.((((((({....}))).)))),)),))))){{{...((({...})))})}..,(((((.((({{((((((,..,|||.,,,.((((((....)))))).)))))))))).})))),.)))))((((((((((..(((((....(((((((,...,)))).)))....))))).))))))))))..,,..))))))))...,,,,,,(((,.,(((((...,}}}},|||((..{{{{{.,,||{|||,,,,))))),,,,)))))}))....((((.......))))...,))))))..,