Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACAP2_0014100
Sequence Length
616 nt
GC Content
0.3685
GGCAGCUUUGGAAGAAGUAGAAGGUGAUGUGGCAGAAUUGGAACUAAAACUUGAUAAGCUUGUGAAACUUUGUAUUGCAAUGAUUGAUACUGGAAAAGCCUUUUGUGUUGCAAAUAAACAGUUCAUGAAUGGGAUUCGAGACCUGGCUCAGUAUUCUAGUAAUGAUGCUGUCGUUGAGACAAGUUUGACCAAGUUUUCUGACAGUCUUCAAGAAAUGAUAAAUUUUCACACAAUCCUGUUUGACCAAACUCAGAGAUCAAUUAAGGCACAGCUUCAGAACUUUGUUAAAGAAGAUCUUAGAAAAUUCAAAGAUGCCAAGAAGCAAUUCGAAAAAGUCAGUGAAGAAAAAGAAAAUGCGUUAGUAAAAAAUGCCCAAGUACAAAGAAACAAACAACAUGAAGUUGAAGAAGCCACCAACAUUCUGACAGCAACAAGAAAAUGUUUCCGACACAUAGCCCUCGAUUAUGUGCUUCAGAUUAAUGUUCUUCAAUCAAAAAGGAGAUCAGAAAUCCUAAAAUCAAUGUUGUCAUUUAUGUAUGCCCAUUUGGCCUUCUUUCAUCAAGGAUAUGAUCUGUUUAGUGAACUUGGACCCUACAUGAAGGAUCUUGGUGCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-121.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -132.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 148.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((..(((..(((((((((((.((((...((((((((((((((((.(((((((((..(((.((((.((((((((...((..((.....))..))...))))))))))))(((((((((...((((((.((((......))).).))))))...)))).))))).)))...)))))))))..)))))))).....))).)))))((((........)))).....((((((..(......)..))).))).......(((.((((((((....((((((........((((......((((..(((.....(((....)))......)))..))))....))))....(((((.......))))).............)))))).....)))))))).....)))....((((..(((((((((((......)))......((((((((....).))))))).....((((..((.(((((.........))))).))..))))..........))))))))...)))).))))))))..)))))))))).)))))).......)))))(.(((.(((.(((.(((......))).))).))).))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((..(((..((((((({(((.((((...{(({..,.,{((((((.({(((((((..{{(,((((,((((({((,,,{{,.(({,...||,.,,,,,|}}))))}}},,(((((((((...((((((.{(((......))).}.))))))...)))).))))).}))...))))))))}..))))))}},,,,}}}},}}},.((((........)))).....,,,,{||||,,......,))).})},,,,,..{{{.{{((((((...,((({{{...,,..,{(({.{,...,||,,,|||.....{{{,,..}}}......})}..)))},.....,.....(((((.......)))))....,,,,,,,,.,)))}}....,)})))))}.....}))....((((..((((((((,,,.,,,..,,}},,.{.(((((((,....}.))))))),.,..((((..((.(((((.........))))).))..))))..........))))))))...)))).)))))))}..)))))))))).)))))).......))))){.(((.(((.(((.(((......))).))).))).))).}
Back