Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACTN4_0003000
Sequence Length
657 nt
GC Content
0.5434
ACCUUCACGGCAUGGUGCAACUCCCACCUGCGGAAGGCAGGCACACAGAUCGAGAACAUUGAUGAGGACUUCCGAGACGGGCUCAAGCUCAUGCUGCUCCUGGAGGUCAUAUCAGGGGAGCGGUUACCUAAGCCGGAGCGGGGGAAGAUGAGAGUGCACAAAAUCAACAAUGUGAACAAAGCGCUGGACUUUAUUGCCAGCAAAGGCGUCAAGCUGGUCUCCAUCGGGGCAGAAGAGAUUGUGGACGGCAACGCAAAGAUGACCCUGGGAAUGAUCUGGACCAUCAUCCUUAGGUUCGCCAUCCAGGACAUCUCCGUGGAAGAGACCUCGGCCAAGGAAGGGCUCCUUCUCUGGUGCCAGAGAAAGACAGCCCCGUAUAAGAACGUCAAUGUGCAGAACUUCCACAUCAGCUGGAAGGAUGGUCUUGCCUUCAAUGCCCUGAUCCACCGGCACAGACCAGAGCUGAUUGAGUAUGACAAGCUGAGGAAGGACGACCCUGUCACCAACCUGAACAAUGCCUUCGAAGUGGCUGAGAAAUACCUCGACAUCCCCAAGAUGCUGGAUGCAGAGGACAUCGUGAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCAUAAUGACCUAUGUGUCCAGCUUCUACCAUGCCUUUUCAGGAGCGCAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-208.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -221.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 162.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((....((((((((....(((((.(((((.....))))).................((((((..(((((((.((..((((...(((....)))))))))))))))).)))))))))))(((((.....))))).....(((((.(.((((.(((((((..........))))........(((((.(......))))))...((((((..((((((....(((((((((((((...(((((........))))).((((..(((((..(((...((((((..........)))))).)))))))).))))(((.(((..((....))..))).))).((((((.(((((((....))))))).))..))))....(((((.((((...........(((((((....).)))))))))).))))).))))..)))))))))..)))))).....((..((((..((......))..))))..))...)))).)).(.((((((...((((.......))))...))).))).)..))))))).).))))).(((.((((((((((.(((...((((......((((((......))....))))...))))))).)))))))))).))))))))))).....)))..(......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((,...((((((((,...(((((.(((((.....))))).......,,,,,.....|||||{..((((((({,(..((((...(((....)))))))})))))))).}}))},)))))(((((.....))))).....(((((.{.((((.((,((((..........)))).,,.....(((((.(......))))))...((((({..((((((....(((((((((((((,,.(({((,,.,,,,.|}}}|,(((({.{{{{({..{,,},|{{{{{|||,|||||.|)}}}}}}.|||||||,,}}|||.|||..|{,.,.}}..))).))}.(((((,,(((((((....))))))).)..})))),((,{{.,.,||,|..}}}}}....((((((,....}.))))))}}}}|}}},,,))))..)))))))))..))))))...,,||..((((..{{......,,..))))..}|..,|}||.}}.||||{,.....}},.,...|||,,,....,)))},,....,}})))).}.))))).(((.((((((((((.(((.{{({((.....,{{({{(......}}....))))...))),))).)))))))))).))))))))))).....})).,,.,....}
Back