Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ADCY5_0002600

Sequence Length

1036 nt

GC Content

0.5685

CAUCCUGUUUGCUGACAUCGAGGGCUUCACCAGCCUGGCGUCCCAGUGCACUGCACAGGAACUGGUCAUGACCCUCAACGAGCUCUUCGCCCGCUUUGACAAGCUGGCCGCAGAGAAUCACUGUUUACGUAUUAAGAUCCUUGGGGAUUGUUAUUACUGCGUCUCGGGGCUGCCUGAAGCAAGGGCUGACCACGCCCACUGCUGUGUGGAGAUGGGCAUGGACAUGAUCGAGGCCAUCUCGUUGGUCCGGGAGGUGACAGGGGUGAACGUGAACAUGCGUGUGGGAAUUCACAGCGGGCGAGUACACUGCGGUGUCCUUGGUCUCAGGAAGUGGCAGUUCGACGUCUGGUCUAACGAUGUCACGCUAGCCAACCACAUGGAGGCUGGCGGCAAGGCAGGACGCAUCCACAUCACCAAGGCUACACUCAACUACCUGAAUGGGGACUACGAGGUGGAGCCAGGCUGUGGGGGCGAGCGCAACGCCUACCUCAAGGAGCACAGUAUCGAGACCUUCCUCAUCCUGCGCUGCACCCAGAAGCGGAAAGAAGAGAAGGCCAUGAUCGCCAAGAUGAACCGCCAGAGAACCAACUCCAUCGGGCACAACCCACCACACUGGGGGGCUGAGCGCCCCUUCUACAACCACCUGGGUGGCAACCAGGUGUCCAAGGAGAUGAAGCGGAUGGGCUUUGAAGACCCCAAGGACAAGAACGCCCAGGAGAGUGCGAACCCUGAGGAUGAAGUGGAUGAGUUUCUGGGCCGUGCCAUUGACGCCAGGAGCAUUGAUAGGCUUCGGUCUGAGCACGUCCGCAAGUUCCUCCUGACCUUCAGGGAGCCUGACUUAGAGAAGAAGUACUCCAAGCAGGUAGACGACCGAUUUGGUGCCUAUGUGGCGUGUGCCUCGCUCGUCUUCCUCUUCAUCUGCUUUGUCCAGAUCACCAUCGUGCCCCACUCCAUAUUCAUGCUCAGCUUCUACCUGACCUGUUCCCUGCUGCUGACCUUGGUGGUGUUUGUGUCUGUGAUCUACUCCUGCGUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-369.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -389.41

Frequency: 0.0000

Diversity: 235.0

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((((((((((((((((((((((...(((((((((((((........)).)).))))..)))))...).))))).........((((((((((.(((....((.((((((.....((((.(((((((((.((((((((....))))).))).))).((.(((((((.(.((....((((.((((.......))))..)))).....(((((((.(.((........)).).))))))))).).))))))).)).......))))))))))...)))).)).))...))).))))))))))...(((((.(..((((.(....)))))..).)))))..(((.....)))....)))))))((((((((..((....)).)))))))))))).)))))(((((...(((((((((((((..((.(((......)))..((((((....(((((((((..((((((((((((((...((..((((..(((..(.(((.(((.((.(((......))))).))).))).)..((......))......))).))))..)).)))))..((((........(((......)))))))((((((...........(((((((((.....))))).........(((((((.......)))))))..(((((((((((((.(((((((((((.....((....))....))).)))))............(((((((((.((((((((((.((((..((((((.((((((((.((.....)).))))).)))..)))))))))).)))))))...))).)))......)))))).(((((.(((.(((........))).))))))))((((((.(((...((((((.....)))....)))))).))))))))).)))))))).))))).)))).........))))))...)))))).....)))..)).))))))).....))))))...))..).)))))))))))).)))))..............))(.....)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.,{{{((((((((((((((((((...(((((((((((({......,.}}.)).))))..)))))...).))))).........{(((((((((.(((....((.((((((.....((((.(((((((((.((,(((((....))))).})).))),((.(((((((.(.(({,..{{{{.||||...,,,.||||.,|}|}....}(((((((.(.{||......,)|,}.)))))))),.).))))))).)),......))))))))))...)))).)).))...))).))))))))))...(((((.{..((({,{....)))))..}.)))))..(((.....)))....))))))}((((((((..((....)).))))))))}}}}||}}||(((((...(((((((((((({..({.(((......)))..((((((....(((((((((..(((((((((((((.,,,...}}|||.,|,|..||(((.{{(,((.({(.,,{{,|||.|,|||{|||,|..,|,|.,}})}...}}.)}),}|||..|,|||,,,..|||{....,...(((......))),,,}(((({(..{{{,......}))|((((.....))))).,.......(((((((.......)))))))..{((({((((((((.(((((((({((...,.((....)).,..,}}.))))|{{,{.{,....,||||{((((....(((((((.((((..((((((.((((((((.((.....)).))))).)))..)))))))))).)))))))...,))})|{{{{...)))))}.(((((.(((.(((........))).))))))))((((((.(((...((((((.....))),...)))))).))))))))).)))))))).)))))....|{,....,}}))))))..}))}}}}.....)))..))}})))))).....))))))...})..).)))))))))))).))))),.,,,.......,.))|.....)