Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_AFF1_0004000

Sequence Length

1021 nt

GC Content

0.5093

UUUGUACAAUGACGACAGAAACCUGCUUCGAAUUAGAGAGAAGGAAAGACGCAACCAGGAAGCCCACCAAGAGAAAGAGGCAUUUCCUGAAAAGAUUCCCCUUUUUGGAGAGCCCUACAAGACAGCAAAAGGUGAUGAGCUGUCUAGUCGAAUACAGAACAUGUUGGGAAACUACGAAGAAGUGAAGGAGUUCCUUAGUACUAAGUCUCACACUCAUCGCCUGGAUGCUUCUGAAAAUAGGUUGGGAAAGCCGAAAUAUCCUUUAAUUCCUGACAAAGGGAGCAGCAUUCCAUCCAGCUCCUUCCACACUAGUGUCCACCACCAGUCCAUUCACACUCCUGCGUCUGGACCACUUUCUGUUGGCAACAUUAGCCACAAUCCAAAGAUGGCGCAGCCAAGAACUGAACCAAUGCCAAGUCUCCAUGCCAAAAGCUGCGGCCCACCGGACAGCCAGCACCUGACCCAGGAUCGCCUUGGUCAGGAGGGGUUCGGCUCUAGUCAUCACAAGAAAGGUGACCGAAGAGCUGACGGAGACCACUGUGCUUCGGUGACAGAUUCGGCUCCAGAGAGGGAGCUUUCUCCCUUAAUCUCUUUGCCUUCCCCAGUUCCCCCUUUGUCACCUAUACAUUCCAACCAGCAAACUCUUCCCCGGACGCAAGGAAGCAGCAAGGUUCAUGGCAGCAGCAAUAACAGUAAAGGCUAUUGCCCAGCCAAAUCUCCCAAGGACCUAGCAGUGAAAGUCCAUGAUAAAGAGACCCCUCAAGACAGUUUGGUGGCCCCUGCCCAGCCGCCUUCUCAGACAUUUCCACCUCCCUCCCUCCCCUCAAAAAGUGUUGCAAUGCAGCAGAAGCCCACGGCUUAUGUCCGGCCCAUGGAUGGUCAAGAUCAGGCCCCUAGUGAAUCCCCUGAACUGAAACCACUGCCGGAGGACUAUCGACAGCAGACCUUUGAAAAAACAGACUUGAAAGUGCCUGCCAAAGCCAAGCUCACCAAACUGAAGAUGCCUUCUCAGUCAGUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-280.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -300.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 245.43

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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