Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_AFF1_0005200

Sequence Length

1245 nt

GC Content

0.4948

UUUGUACAAUGACGACAGAAACCUGCUUCGAAUUAGAGAGAAGGAAAGACGCAACCAGGAAGCCCACCAAGAGAAAGAGGCAUUUCCUGAAAAGAUUCCCCUUUUUGGAGAGCCCUACAAGACAGCAAAAGGUGAUGAGCUGUCUAGUCGAAUACAGAACAUGUUGGGAAACUACGAAGAAGUGAAGGAGUUCCUUAGUACUAAGUCUCACACUCAUCGCCUGGAUGCUUCUGAAAAUAGGUUGGGAAAGCCGAAAUAUCCUUUAAUUCCUGACAAAGGGAGCAGCAUUCCAUCCAGCUCCUUCCACACUAGUGUCCACCACCAGUCCAUUCACACUCCUGCGUCUGGACCACUUUCUGUUGGCAACAUUAGCCACAAUCCAAAGAUGGCGCAGCCAAGAACUGAACCAAUGCCAAGUCUCCAUGCCAAAAGCUGCGGCCCACCGGACAGCCAGCACCUGACCCAGGAUCGCCUUGGUCAGGAGGGGUUCGGCUCUAGUCAUCACAAGAAAGGUGACCGAAGAGCUGACGGAGACCACUGUGCUUCGGUGACAGAUUCGGCUCCAGAGAGGGAGCUUUCUCCCUUAAUCUCUUUGCCUUCCCCAGUUCCCCCUUUGUCACCUAUACAUUCCAACCAGCAAACUCUUCCCCGGACGCAAGGAAGCAGCAAGGUUCAUGGCAGCAGCAAUAACAGUAAAGGCUAUUGCCCAGCCAAAUCUCCCAAGGACCUAGCAGUGAAAGUCCAUGAUAAAGAGACCCCUCAAGACAGUUUGGUGGCCCCUGCCCAGCCGCCUUCUCAGACAUUUCCACCUCCCUCCCUCCCCUCAAAAAGUGUUGCAAUGCAGCAGAAGCCCACGGCUUAUGUCCGGCCCAUGGAUGGUCAAGAUCAGGCCCCUAGUGAAUCCCCUGAACUGAAACCACUGCCGGAGGACUAUCGACAGCAGACCUUUGAAAAAACAGACUUGAAAGUGCCUGCCAAAGCCAAGCUCACCAAACUGAAGAUGCCUUCUCAGUCAGUUGAGCAGACCUACUCCAAUGAAGUCCAUUGUGUUGAAGAGAUUCUGAAGGAAAUGACCCAUUCAUGGCCGCCUCCUUUGACAGCAAUACAUACGCCUAGUACAGCUGAGCCAUCCAAGUUUCCUUUCCCUACAAAGGACUCUCAGCAUGUCAGUUCUGUAACCCAAAACCAAAAACAAUAUGAUACAUCUUCAAAAACUCACUCAAAUUCUCAGCAAGGAACGUCAUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-330.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -353.37

Frequency: 0.0000

Diversity: 218.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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