Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_AFF1_0005600

Sequence Length

900 nt

GC Content

0.5167

ACAGCAAAAGGUGAUGAGCUGUCUAGUCGAAUACAGAACAUGUUGGGAAACUACGAAGAAGUGAAGGAGUUCCUUAGUACUAAGUCUCACACUCAUCGCCUGGAUGCUUCUGAAAAUAGGUUGGGAAAGCCGAAAUAUCCUUUAAUUCCUGACAAAGGGAGCAGCAUUCCAUCCAGCUCCUUCCACACUAGUGUCCACCACCAGUCCAUUCACACUCCUGCGUCUGGACCACUUUCUGUUGGCAACAUUAGCCACAAUCCAAAGAUGGCGCAGCCAAGAACUGAACCAAUGCCAAGUCUCCAUGCCAAAAGCUGCGGCCCACCGGACAGCCAGCACCUGACCCAGGAUCGCCUUGGUCAGGAGGGGUUCGGCUCUAGUCAUCACAAGAAAGGUGACCGAAGAGCUGACGGAGACCACUGUGCUUCGGUGACAGAUUCGGCUCCAGAGAGGGAGCUUUCUCCCUUAAUCUCUUUGCCUUCCCCAGUUCCCCCUUUGUCACCUAUACAUUCCAACCAGCAAACUCUUCCCCGGACGCAAGGAAGCAGCAAGGUUCAUGGCAGCAGCAAUAACAGUAAAGGCUAUUGCCCAGCCAAAUCUCCCAAGGACCUAGCAGUGAAAGUCCAUGAUAAAGAGACCCCUCAAGACAGUUUGGUGGCCCCUGCCCAGCCGCCUUCUCAGACAUUUCCACCUCCCUCCCUCCCCUCAAAAAGUGUUGCAAUGCAGCAGAAGCCCACGGCUUAUGUCCGGCCCAUGGAUGGUCAAGAUCAGGCCCCUAGUGAAUCCCCUGAACUGAAACCACUGCCGGAGGACUAUCGACAGCAGACCUUUGAAAAAACAGACUUGAAAGUGCCUGCCAAAGCCAAGCUCACCAAACUGAAGAUGCCUUCUCAGUCAGUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-246.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -263.82

Frequency: 0.0000

Diversity: 215.0

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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