Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ANKRD12_0010300

Sequence Length

639 nt

GC Content

0.4053

AGAAAGAAGGUCCAGAAAAGAAGAAGACAAAAAAGGAAGCUGGAAAUAAGAAAUCCACACCAGUUAGCAUUCUUUUUGGUUAUCCACUCUCUGAGCGAAAACAGAUGGCACUUCUUAUGCAGAUGACAGCAAGAGACAACAGUCCAGAUUCCACACCAAAUCAUCCAUCACAAACAACGCCUGCCCAAAAGAAAACUCCCAGUUCUUCAUCUCGACAGAAAGAUAAAGUUAAUAAAAGAAAUGAACGUGGUGAAACUCCUUUACACAUGGCUGCUAUUCGAGGAGAUGUGAAACAAGUUAAAGAAUUAAUAAGUUUAGGGGCAAAUGUGAAUGUGAAAGAUUUUGCAGGUUGGACACCACUGCAUGAAGCUUGCAAUGUUGGAUAUUACGAUGUUGCUAAGAUACUUAUAGCAGCUGGAGCAGAUGUUAACACACAAGGAUUAGAUGAUGACACUCCACUCCAUGAUUCUGCUAGUAGUGGGCACAGAGAUAUAGUAAAGCUGUUACUUCGUCACGGUGGAAAUCCAUUUCAAGCUAAUAAACAUGGGGAGCGUCCAGUGGAUGUAGCAGAAACAGAGGAGUUGGAGUUGCUACUAAAAAGAGAGGUGCCUUUAUCUGAUGAUGAUGAAAGUUACACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-140.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -154.81

Frequency: 0.0000

Diversity: 158.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.(((....((.((((..((..((.(((.((((((((((((((................))))))....)))))))).))).))..)).)))).))..........((((((((((.(((........)))...(((....))).....((((.(((..(..(((..(((((....(((..(((((......(((((...(((((((((((((....(((......(((................(((((((((.....))))).)))))))....)))...))))))............)))))))....)))))..)))))..)))...)))))..)))..)...)))))))..(((((((((((..((((((((((((.......))))))))).)))....)))).)))).)))((((...((((.(((..........).)).))))((((((((((.((.((((((((.((.(((((.....(((..(((((.....)))))..)))..(((((....)))))....(((.............)))))))).))....)))))))).))..)))).))))))))))........))))))))))))).)(((.((.((((....)))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

({(..,...,,{((((,,(({{(,.(((..,,,,(({,{((((..........,,,...}},)))..}.))))))))}),,.}}...)})|||.,,.....,,,,,((((((((((.(((........))).,.(((....)))|....((((.(((.,{..(((..(((((..,.(((..(((((....,.,,{{(...{{{(({{((((((....{{,.,.....,,.............,..|{{||{{{(.....}))}}.}|}}.||.||.,}}.,,)))))),,|{{,..{{{,|,,,,)),,,.,))))..)))))..))),..)))))..))).,}...)))))))..(((((((((((.,((((((((((((.......))))))))).)))....)))).)))).)))((({..,((({.{{,..........}.}}.))}}|(((((((((.((.((((((((.,{,(((((,{.,.({{..((({{..,,.)))))..))).,,|||{...,))))}....{{{........,,,,.,}||})}).}),}},)))))))).))..))))}})))))))))........)))))))))),|,|)|||.{{.{||{....)))}},)))